MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009480	GTT	2	6	111714	111719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009480	ATC	2	6	111735	111740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_009480	GAG	2	6	111870	111875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009480	TTGC	2	8	111897	111904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_009480	CAC	2	6	111921	111926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_009480	AGC	2	6	111935	111940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_009480	CG	3	6	111961	111966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_009480	CGGC	2	8	112085	112092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_009480	ACCG	2	8	112093	112100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_009480	CGGC	2	8	112401	112408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_009480	CTT	2	6	112427	112432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_009480	GCC	2	6	112438	112443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_009480	TGACC	2	10	112566	112575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1014	NC_009480	AGG	2	6	112681	112686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009480	GGC	2	6	112757	112762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_009480	GGT	2	6	112824	112829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009480	GC	3	6	112863	112868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_009480	CGC	2	6	112973	112978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_009480	TCG	2	6	112991	112996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_009480	TG	3	6	114050	114055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009480	CG	4	8	114068	114075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_009480	TGA	3	9	114082	114090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009480	CA	3	6	114127	114132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_009480	GCG	2	6	114271	114276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_009480	CGC	2	6	114316	114321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_009480	AAC	2	6	114322	114327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_009480	GCT	2	6	114452	114457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_009480	CGG	2	6	114473	114478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_009480	TGA	2	6	114493	114498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009480	GGC	2	6	114551	114556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_009480	GAA	2	6	114585	114590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009480	CGAG	2	8	114638	114645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_009480	CCG	2	6	114646	114651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_009480	CGC	2	6	114674	114679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_009480	AGC	2	6	114685	114690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_009480	TGC	2	6	114704	114709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_009480	CCGT	2	8	114757	114764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_009480	TCC	2	6	114769	114774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_009480	GCAC	2	8	114778	114785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_009480	CGAAG	2	10	114792	114801	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1041	NC_009480	AGC	2	6	114839	114844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_009480	CCT	2	6	114871	114876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_009480	GAT	2	6	115310	115315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009480	CCAT	2	8	115336	115343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_009480	CCA	2	6	115384	115389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_009480	CGC	2	6	115543	115548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_009480	GC	3	6	115547	115552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_009480	GGA	2	6	115574	115579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009480	GCC	2	6	115588	115593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_009480	CGG	2	6	115620	115625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_009480	CCG	2	6	115659	115664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_009480	GTG	2	6	115675	115680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009480	GTG	2	6	115765	115770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009480	TCA	2	6	115802	115807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_009480	CCG	2	6	115847	115852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_009480	GGC	2	6	115931	115936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009480	GGC	2	6	115948	115953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_009480	AAC	2	6	115958	115963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_009480	AAC	2	6	116009	116014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009480	AGCC	2	8	116031	116038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_009480	CGC	2	6	116041	116046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_009480	CAT	2	6	116063	116068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_009480	CGA	2	6	116069	116074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009480	CAG	2	6	116111	116116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_009480	TTG	2	6	116159	116164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009480	CAC	2	6	116168	116173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_009480	CGT	2	6	116184	116189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_009480	GGGC	2	8	116238	116245	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_009480	GACC	2	8	116256	116263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_009480	GTA	2	6	116307	116312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009480	GTT	2	6	116334	116339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009480	GGA	3	9	116413	116421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_009480	CAG	2	6	116437	116442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_009480	TCCGT	2	10	116449	116458	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1075	NC_009480	GTG	2	6	116530	116535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009480	CGG	2	6	116582	116587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_009480	CAG	2	6	116589	116594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_009480	TG	3	6	116613	116618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_009480	GA	3	6	116639	116644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009480	GTG	2	6	116673	116678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009480	TGA	2	6	116771	116776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009480	TCG	3	9	116840	116848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_009480	GGC	2	6	116852	116857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_009480	CGC	2	6	116888	116893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_009480	GCG	2	6	116897	116902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_009480	TCC	2	6	117143	117148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_009480	CTG	2	6	117159	117164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_009480	GCA	2	6	117170	117175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_009480	CGG	2	6	119565	119570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_009480	CGA	2	6	119571	119576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_009480	GCT	2	6	119613	119618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_009480	GGC	2	6	119639	119644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_009480	CGG	4	12	119679	119690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_009480	GGAGA	2	10	119703	119712	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_009480	GCT	2	6	122978	122983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_009480	TGAGGA	2	12	123005	123016	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009480	CCG	2	6	123028	123033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_009480	AGC	2	6	124932	124937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_009480	TC	4	8	126974	126981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_009480	GC	3	6	126998	127003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_009480	CG	3	6	127009	127014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_009480	TAC	2	6	128321	128326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_009480	TG	4	8	128332	128339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009480	CGC	2	6	128349	128354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_009480	GGCGA	2	10	128368	128377	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1106	NC_009480	GCC	2	6	128444	128449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_009480	GGT	2	6	128454	128459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009480	TCT	2	6	128513	128518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009480	GAG	2	6	129312	129317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009480	GAC	2	6	129330	129335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_009480	GTC	2	6	130844	130849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_009480	GCGG	2	8	130861	130868	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_009480	G	6	6	132145	132150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009480	TGCG	2	8	133820	133827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_009480	CAG	3	9	133831	133839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_009480	TGG	2	6	133843	133848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009480	G	6	6	133887	133892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009480	CGA	2	6	133893	133898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_009480	CTC	2	6	133910	133915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_009480	TGAG	2	8	133918	133925	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009480	CGC	2	6	134007	134012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_009480	TTCGC	2	10	134027	134036	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1123	NC_009480	TCC	2	6	138169	138174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_009480	GCC	2	6	138187	138192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_009480	GCG	2	6	138233	138238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_009480	CG	3	6	138273	138278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_009480	CGG	2	6	140958	140963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_009480	TCA	2	6	141001	141006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_009480	CG	3	6	143697	143702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_009480	GCCTC	2	10	144761	144770	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1131	NC_009480	GTG	2	6	144811	144816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009480	GGA	2	6	144834	144839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009480	GGAGC	2	10	144849	144858	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1134	NC_009480	ACC	2	6	144885	144890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_009480	CG	3	6	144909	144914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_009480	CTC	2	6	149757	149762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_009480	CGT	2	6	149800	149805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_009480	GAC	2	6	149827	149832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1140	NC_009480	CGA	2	6	149860	149865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_009480	GAC	2	6	149867	149872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_009480	ATC	2	6	149873	149878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1144	NC_009480	TCCTG	2	10	154501	154510	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1145	NC_009480	CG	3	6	154530	154535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1146	NC_009480	CG	3	6	154561	154566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1147	NC_009480	TTCTC	2	10	154580	154589	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1151	NC_009480	CGC	2	6	158561	158566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1153	NC_009480	TTC	2	6	158674	158679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1157	NC_009480	TGC	2	6	158885	158890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1165	NC_009480	TGCG	2	8	159208	159215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1166	NC_009480	GCTC	2	8	159240	159247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1167	NC_009480	CGT	2	6	159258	159263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1183	NC_009480	ACCC	2	8	170388	170395	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1184	NC_009480	CGGCGT	2	12	171374	171385	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1225	NC_009480	CGG	2	6	193672	193677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_009480	CGT	2	6	203514	203519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1255	NC_009480	CCG	2	6	203528	203533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1256	NC_009480	CCG	2	6	203542	203547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1257	NC_009480	CGG	2	6	203553	203558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_009480	ACG	2	6	203563	203568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_009480	CGT	2	6	203579	203584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1261	NC_009480	GTG	3	9	203599	203607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_009480	GATC	2	8	204330	204337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1264	NC_009480	GGC	2	6	204350	204355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1268	NC_009480	GACGC	2	10	206598	206607	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1270	NC_009480	CTG	2	6	207413	207418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1271	NC_009480	GCG	2	6	207421	207426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_009480	GTCG	2	8	207435	207442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1294	NC_009480	GC	4	8	218620	218627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1296	NC_009480	GC	4	8	218716	218723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1398	NC_009480	ACG	2	6	235383	235388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1402	NC_009480	CA	3	6	240846	240851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1403	NC_009480	ACC	2	6	240860	240865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1404	NC_009480	GCC	2	6	242105	242110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1406	NC_009480	CG	3	6	242190	242195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1407	NC_009480	GCA	2	6	242196	242201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_009480	GAG	3	9	242203	242211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_009480	GCG	2	6	243612	243617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_009480	GC	3	6	243635	243640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1411	NC_009480	GTC	2	6	243642	243647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1413	NC_009480	GGC	2	6	245414	245419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_009480	CA	4	8	258412	258419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1433	NC_009480	CAC	2	6	258421	258426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1439	NC_009480	CTTC	2	8	264474	264481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1441	NC_009480	CGG	2	6	264523	264528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1442	NC_009480	GGCG	2	8	264551	264558	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1443	NC_009480	ACG	2	6	265771	265776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_009480	GCG	2	6	272677	272682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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