MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 9722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009480	CCG	2	6	72959	72964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_009480	CTG	2	6	72972	72977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_009480	GGC	2	6	72983	72988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_009480	TCC	2	6	73028	73033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_009480	GGTC	2	8	73082	73089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
506	NC_009480	AGC	2	6	73177	73182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_009480	CGAC	2	8	73189	73196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
508	NC_009480	TGA	2	6	73204	73209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009480	ATG	2	6	73230	73235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009480	CGA	2	6	73267	73272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_009480	GCC	3	9	73295	73303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_009480	GAG	2	6	73304	73309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009480	ATG	2	6	73349	73354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009480	A	6	6	73355	73360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009480	GCC	2	6	73398	73403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_009480	GCG	2	6	73413	73418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009480	TGC	2	6	73489	73494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009480	GCT	2	6	73507	73512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009480	CGA	2	6	73594	73599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009480	CGA	2	6	73624	73629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_009480	GCC	2	6	73698	73703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_009480	CGA	2	6	73717	73722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009480	CGA	2	6	73761	73766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_009480	GAAAG	3	15	73784	73798	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009480	GAG	2	6	73802	73807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009480	TAAG	2	8	73850	73857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009480	CGG	2	6	73871	73876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_009480	GCT	2	6	73905	73910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009480	GCC	2	6	73936	73941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_009480	CCGG	2	8	73959	73966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_009480	CGG	4	12	74048	74059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_009480	TACC	2	8	74095	74102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_009480	AAGCG	2	10	74122	74131	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
534	NC_009480	GAC	2	6	74141	74146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_009480	GTC	2	6	74151	74156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_009480	CG	3	6	74175	74180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_009480	CGG	2	6	74195	74200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_009480	TGG	2	6	74229	74234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009480	ACA	2	6	74258	74263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_009480	AGTGG	2	10	74305	74314	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009480	CG	3	6	74316	74321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_009480	CGT	2	6	74360	74365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_009480	CGG	2	6	74444	74449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009480	GCG	2	6	74459	74464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009480	AGTC	2	8	74498	74505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_009480	ACGC	2	8	74515	74522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
547	NC_009480	ACG	2	6	74549	74554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009480	GC	3	6	74584	74589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_009480	AGC	2	6	74618	74623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_009480	GAG	2	6	74767	74772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009480	GCC	2	6	74773	74778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_009480	GTT	2	6	75637	75642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009480	GAC	2	6	75646	75651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009480	TGG	2	6	75659	75664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009480	ACA	2	6	75687	75692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009480	ATT	2	6	75797	75802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009480	ATC	2	6	75805	75810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_009480	GCA	2	6	75837	75842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_009480	GC	3	6	75865	75870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_009480	CCG	2	6	75874	75879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_009480	TC	3	6	75881	75886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_009480	GA	3	6	75909	75914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009480	CTC	2	6	75924	75929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_009480	GT	3	6	75974	75979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009480	GAAG	2	8	76009	76016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009480	CCT	2	6	76095	76100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_009480	CGG	2	6	76256	76261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_009480	AAGG	2	8	76281	76288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009480	CGT	2	6	76347	76352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009480	GCC	2	6	76399	76404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_009480	GGCTCT	2	12	78605	78616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_009480	GGC	2	6	78638	78643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_009480	GCTG	2	8	78648	78655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_009480	TC	3	6	78721	78726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_009480	GCG	2	6	78741	78746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_009480	GCG	2	6	78782	78787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_009480	CCGC	2	8	78803	78810	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
578	NC_009480	TAC	2	6	78908	78913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_009480	CGT	2	6	78931	78936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_009480	CGG	2	6	78987	78992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_009480	GCCGTG	2	12	79005	79016	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009480	TCC	2	6	79026	79031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_009480	TGC	2	6	79032	79037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_009480	GCT	2	6	79042	79047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_009480	GCC	2	6	79760	79765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_009480	CGG	2	6	79783	79788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_009480	CGAG	2	8	79796	79803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
588	NC_009480	GAT	2	6	79808	79813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009480	C	6	6	79815	79820	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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591	NC_009480	GTCG	2	8	79909	79916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
592	NC_009480	TAC	2	6	79917	79922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_009480	GAC	2	6	79944	79949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_009480	CGAGC	2	10	79965	79974	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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598	NC_009480	GAG	2	6	80174	80179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009480	GCC	2	6	80206	80211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_009480	ACGTTC	2	12	80231	80242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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602	NC_009480	TCG	2	6	80401	80406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_009480	CGC	2	6	80421	80426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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605	NC_009480	GGC	2	6	80536	80541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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607	NC_009480	GAC	2	6	80580	80585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_009480	TGG	2	6	80620	80625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009480	TC	3	6	80923	80928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_009480	TGA	2	6	80966	80971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009480	GCCGGG	2	12	81048	81059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_009480	AC	3	6	81135	81140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_009480	GC	3	6	81196	81201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_009480	AGC	2	6	81235	81240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_009480	ACG	2	6	81258	81263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_009480	GCT	2	6	81274	81279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_009480	GCC	2	6	81322	81327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_009480	GCCGTG	2	12	81380	81391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_009480	GTC	2	6	81402	81407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_009480	GAG	2	6	81437	81442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009480	TCA	2	6	81456	81461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_009480	GCCG	2	8	81467	81474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_009480	GGC	2	6	81481	81486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_009480	ACC	2	6	81534	81539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_009480	GTC	2	6	81578	81583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_009480	GAA	2	6	81597	81602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009480	GTC	2	6	81613	81618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_009480	AGGA	2	8	81680	81687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_009480	TCC	2	6	81712	81717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_009480	CGC	2	6	81801	81806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_009480	GGC	2	6	81829	81834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_009480	CGC	2	6	81844	81849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_009480	CGA	3	9	81865	81873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_009480	CGC	2	6	81876	81881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_009480	CCCCT	2	10	81890	81899	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
636	NC_009480	ACT	2	6	81934	81939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_009480	CGG	2	6	81943	81948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_009480	GTC	2	6	81985	81990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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640	NC_009480	CGC	2	6	82020	82025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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