MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM2

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009479	CGGC	2	8	2232	2239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009479	CCGG	2	8	3339	3346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009479	GCCG	2	8	3356	3363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009479	CCGT	2	8	3500	3507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009479	GCCG	2	8	7060	7067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009479	TTCG	2	8	16625	16632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009479	ATGA	2	8	27785	27792	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009479	TGGC	2	8	27898	27905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009479	GTCG	2	8	27919	27926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009479	CAGT	2	8	29057	29064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009479	CAGG	2	8	31655	31662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009479	CATG	4	16	31820	31835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009479	CCGG	2	8	33156	33163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009479	AAAG	2	8	33889	33896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009479	CTCA	2	8	37677	37684	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009479	GGGC	2	8	38102	38109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009479	CGGG	2	8	38621	38628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009479	GGTA	2	8	41473	41480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009479	TAAA	2	8	42648	42655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009479	GGTG	2	8	44374	44381	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009479	CTAT	2	8	44592	44599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009479	ATTC	2	8	44608	44615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009479	CCGC	2	8	45260	45267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_009479	AACT	2	8	45918	45925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009479	GCCG	2	8	47392	47399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009479	GACA	2	8	47427	47434	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009479	CGCC	2	8	48571	48578	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_009479	GGCT	2	8	49311	49318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009479	CCGC	2	8	51089	51096	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_009479	TCGG	2	8	53406	53413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009479	TGCT	2	8	53437	53444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009479	TGGA	2	8	55042	55049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009479	GTTC	2	8	55200	55207	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009479	CTCG	2	8	56255	56262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009479	TACT	2	8	56799	56806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009479	GCTG	2	8	57174	57181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009479	TTGC	2	8	57222	57229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009479	GCAC	2	8	57461	57468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009479	ACCG	2	8	57947	57954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009479	CGTT	2	8	58649	58656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009479	CAGC	2	8	58674	58681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009479	CGAG	2	8	59895	59902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009479	GCCG	2	8	60180	60187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009479	CCGC	2	8	62925	62932	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_009479	CGGC	2	8	65269	65276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009479	GTCG	2	8	65421	65428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009479	CGGC	2	8	66354	66361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009479	GGGT	2	8	68806	68813	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009479	CACC	2	8	68831	68838	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.