MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009478	CAGC	2	8	885	892	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009478	CCGT	2	8	905	912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009478	GCCG	2	8	1019	1026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009478	CCGA	2	8	1182	1189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009478	GTTA	2	8	1892	1899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009478	GTAG	2	8	1953	1960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009478	TAGG	2	8	17423	17430	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009478	TGCG	2	8	17470	17477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009478	GTTC	2	8	22134	22141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009478	TCGG	2	8	22271	22278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009478	CGTT	2	8	22426	22433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009478	GCGT	2	8	22463	22470	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009478	GCCG	2	8	24141	24148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009478	GCCG	2	8	24299	24306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009478	CGAG	2	8	25311	25318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009478	GCTT	2	8	26951	26958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009478	TCTG	2	8	27022	27029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009478	GCAA	2	8	27069	27076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009478	AAAG	2	8	27110	27117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009478	GCTC	3	12	27272	27283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009478	CAGC	2	8	27350	27357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.