MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009465	ATCTT	2	10	1309	1318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009465	TATTT	2	10	17168	17177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009465	ATTTT	2	10	17264	17273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009465	ATTGT	2	10	37245	37254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009465	TATCC	2	10	43278	43287	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009465	AGTTA	2	10	47994	48003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009465	TAAAA	2	10	51612	51621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009465	ATTAT	2	10	51929	51938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009465	TAAAA	2	10	52032	52041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009465	AGTTT	2	10	61200	61209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009465	TTAAT	2	10	61424	61433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009465	CTTTA	2	10	62374	62383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009465	ATTTT	2	10	63585	63594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009465	TCATT	2	10	65739	65748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009465	TTCTT	2	10	65970	65979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009465	TTCTT	2	10	65990	65999	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009465	TTATC	2	10	68143	68152	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009465	TTGAT	2	10	68951	68960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009465	TAATT	2	10	69283	69292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009465	TTTTA	2	10	72536	72545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009465	TTGAT	2	10	76747	76756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009465	TAAAT	2	10	82356	82365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009465	ATGAT	2	10	83794	83803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009465	TTTTA	2	10	86852	86861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009465	ATTTT	2	10	89663	89672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009465	ATTTT	2	10	90060	90069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009465	TTTGT	2	10	96118	96127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009465	ATATA	2	10	97894	97903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009465	TTAAA	2	10	108732	108741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009465	TTGTC	2	10	111337	111346	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009465	ATTTT	2	10	116449	116458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009465	TTTTA	2	10	116529	116538	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009465	TAAGT	2	10	116699	116708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009465	GGCTG	2	10	124669	124678	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009465	ATTTT	2	10	133772	133781	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009465	TAAAT	2	10	133787	133796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009465	ATTAG	2	10	134031	134040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009465	ATTTT	2	10	143431	143440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009465	AGTAA	2	10	152787	152796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009465	GAATT	2	10	159377	159386	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009465	TCTTT	2	10	162646	162655	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009465	TGATA	2	10	163118	163127	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009465	TTATC	2	10	172559	172568	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009465	ATATA	2	10	176518	176527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009465	TAATA	2	10	195314	195323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009465	TAATT	2	10	196765	196774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009465	TTTCA	2	10	204537	204546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009465	TAGTT	2	10	207604	207613	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009465	ATCTT	2	10	207946	207955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009465	ATTAA	2	10	209641	209650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009465	ACTTT	2	10	209754	209763	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009465	ATTTT	2	10	210284	210293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009465	TATGG	2	10	252783	252792	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009465	TTTTA	2	10	256422	256431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009465	ATTTT	2	10	258121	258130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009465	TTTTA	2	10	264029	264038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009465	TATGA	2	10	269860	269869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009465	TTTTA	2	10	270853	270862	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009465	TTTAG	2	10	276548	276557	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009465	AATTA	2	10	277495	277504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009465	TTAAA	2	10	284076	284085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009465	TAAAA	2	10	288767	288776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009465	TTTTA	2	10	294881	294890	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009465	CTAAT	2	10	295261	295270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009465	ATAAA	2	10	302165	302174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009465	GATTT	2	10	310373	310382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009465	ATTTA	2	10	318095	318104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009465	TAAGG	2	10	328291	328300	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009465	AATAA	2	10	334914	334923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009465	ATATT	2	10	350496	350505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009465	ATTTT	2	10	361994	362003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009465	ATTAT	2	10	378254	378263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009465	AGTTT	2	10	380143	380152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009465	CTTTC	2	10	381409	381418	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_009465	TTAAG	2	10	384315	384324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009465	ATATT	2	10	389157	389166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009465	TAAAA	2	10	399462	399471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009465	TTTGA	2	10	399819	399828	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009465	GTTAT	2	10	402505	402514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009465	TTAAC	2	10	403704	403713	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009465	ACATA	2	10	409526	409535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009465	TACTT	2	10	409880	409889	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009465	ATTTA	3	15	409978	409992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009465	TAAAA	2	10	418928	418937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009465	TTAAT	2	10	419692	419701	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009465	TAAAA	2	10	420062	420071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009465	TTAGA	2	10	432398	432407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009465	AACTA	2	10	436961	436970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009465	TTTAG	2	10	447166	447175	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009465	TTTAA	2	10	458535	458544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009465	ACATT	2	10	462040	462049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009465	TAGTT	2	10	465681	465690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009465	ATTTA	2	10	466914	466923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009465	AATTT	2	10	475415	475424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009465	GTAAA	2	10	477563	477572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009465	TATAA	2	10	477716	477725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009465	TTTAA	2	10	479935	479944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009465	TTGAT	2	10	479978	479987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009465	TTAAA	2	10	494677	494686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009465	AATTA	2	10	498041	498050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009465	TTTTA	2	10	498259	498268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009465	ATTTA	2	10	517635	517644	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009465	AATGA	2	10	517710	517719	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009465	AAATT	2	10	519075	519084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009465	GTCAA	2	10	531289	531298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009465	GCTCT	2	10	531458	531467	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_009465	AGAGG	2	10	554356	554365	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009465	AAATC	2	10	562527	562536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009465	TTTAG	2	10	564690	564699	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009465	TAATA	2	10	570180	570189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009465	TAATA	2	10	574242	574251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009465	ATTAA	2	10	579713	579722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009465	GATTC	2	10	579909	579918	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009465	TCTTT	2	10	580798	580807	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009465	TTTAT	2	10	594762	594771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009465	AGAAA	2	10	594789	594798	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009465	AAAAC	2	10	597587	597596	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009465	AAAAT	2	10	600748	600757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009465	AAATT	2	10	600993	601002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009465	TAAAA	2	10	601099	601108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009465	ACACT	2	10	607967	607976	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009465	ATTAA	2	10	608043	608052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009465	AAAAT	2	10	608385	608394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009465	ATCAA	2	10	608509	608518	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009465	TATAA	2	10	611519	611528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009465	AAAAT	2	10	611944	611953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009465	ATAAA	2	10	618357	618366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009465	GCGGA	2	10	628753	628762	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009465	GAATA	2	10	630367	630376	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009465	TTTTA	2	10	632217	632226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009465	AAAAG	2	10	633617	633626	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009465	CTAAA	2	10	639249	639258	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009465	TATAA	2	10	639307	639316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009465	AAATA	2	10	640320	640329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009465	AGATA	2	10	644077	644086	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009465	TTCAA	2	10	655410	655419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009465	TTAAC	2	10	655587	655596	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009465	TTTTG	2	10	655706	655715	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009465	TAAAT	2	10	658068	658077	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009465	TAATT	2	10	668643	668652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009465	ATTTA	2	10	676971	676980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009465	ATTCA	2	10	677005	677014	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009465	TTAAC	2	10	683551	683560	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009465	TTATT	2	10	695080	695089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009465	AGAAA	2	10	695392	695401	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009465	ATAAA	2	10	695465	695474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009465	ATTAG	2	10	696793	696802	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009465	TAATA	2	10	698990	698999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009465	TTAAA	2	10	699128	699137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.