MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 chromosome

Total Repeats: 588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009437	TTAAA	2	10	211	220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009437	ATTTT	2	10	4733	4742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009437	TTTTA	2	10	11695	11704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009437	AAGAG	2	10	13901	13910	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009437	CAAAT	2	10	15061	15070	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009437	TTAAA	2	10	22842	22851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009437	AAGGA	2	10	23429	23438	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009437	TTTGA	2	10	23710	23719	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009437	GACAA	2	10	25865	25874	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009437	GATAA	2	10	30594	30603	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009437	ATTTT	2	10	34190	34199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009437	TTTGA	2	10	35563	35572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009437	ATAAA	2	10	36539	36548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009437	ATAAA	2	10	39542	39551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009437	TTCAT	2	10	42691	42700	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009437	GATAT	2	10	43035	43044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009437	GGATG	2	10	43136	43145	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009437	ATAAA	2	10	43164	43173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009437	TGTAG	2	10	43228	43237	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009437	TTGAT	2	10	45855	45864	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009437	AAATT	2	10	54103	54112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009437	ATAAC	2	10	54153	54162	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009437	AAGGA	2	10	55902	55911	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009437	TAAAA	2	10	57868	57877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009437	AAAAT	2	10	63714	63723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009437	GTGAG	2	10	63743	63752	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009437	TAAAA	2	10	68965	68974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009437	CTACA	2	10	71716	71725	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009437	TTTTA	2	10	71779	71788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009437	TTCTC	2	10	72058	72067	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009437	GGGAA	2	10	92227	92236	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009437	GTTCT	2	10	94992	95001	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009437	AAGAA	2	10	95032	95041	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009437	TCTTT	2	10	97216	97225	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009437	GAAGG	2	10	101020	101029	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009437	CAAGA	2	10	110885	110894	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009437	AATTA	2	10	111937	111946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009437	AAAAT	2	10	136038	136047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009437	ATGAT	2	10	145586	145595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009437	TCTTT	2	10	155937	155946	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009437	ATTTT	2	10	170000	170009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009437	AGGGC	2	10	171008	171017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009437	TGAGG	2	10	171095	171104	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009437	AAAGG	2	10	171672	171681	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009437	AAATT	2	10	172521	172530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009437	AAGTT	2	10	176727	176736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009437	TTTTA	2	10	177207	177216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009437	AAAAG	2	10	182625	182634	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009437	ATATT	2	10	182654	182663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009437	TTGTC	2	10	201213	201222	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009437	TTTGG	2	10	204564	204573	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009437	GAAAA	2	10	207475	207484	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009437	ATATA	2	10	208614	208623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009437	TTTAC	2	10	229380	229389	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009437	AATTT	2	10	237134	237143	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009437	TTTGA	2	10	245116	245125	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009437	TATAA	2	10	251549	251558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009437	GAAGA	2	10	253710	253719	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009437	GTAGG	2	10	256101	256110	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009437	TAAAA	2	10	264818	264827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009437	AAAGG	2	10	265878	265887	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009437	AGGGT	2	10	275145	275154	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009437	CAAGT	2	10	279022	279031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009437	TTAAG	2	10	279110	279119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009437	TATAA	2	10	279121	279130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009437	GGGTG	2	10	285272	285281	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009437	TCGTG	2	10	285335	285344	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009437	TAGGT	2	10	285819	285828	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009437	CAAGT	2	10	286490	286499	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009437	GGGAG	2	10	286632	286641	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009437	AGGGG	2	10	288008	288017	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009437	CCGAA	2	10	288027	288036	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_009437	ATTTT	2	10	299098	299107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009437	ATTTG	2	10	304015	304024	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009437	ATTTT	2	10	308451	308460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009437	TGATG	2	10	309495	309504	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009437	TCAAG	2	10	314129	314138	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009437	GTAAA	2	10	315533	315542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009437	TTTTA	2	10	325705	325714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009437	ACCAC	2	10	330668	330677	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_009437	TAAAA	2	10	331338	331347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009437	CTTAC	2	10	331788	331797	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009437	GGAAG	2	10	337115	337124	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009437	ACATT	2	10	347592	347601	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009437	CTACA	2	10	351644	351653	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009437	TTTTA	2	10	351707	351716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009437	TTTTC	2	10	352446	352455	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009437	TGCGG	2	10	352965	352974	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009437	ATTTT	2	10	355427	355436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009437	TAACC	2	10	358496	358505	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009437	TAAAA	2	10	360692	360701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009437	CTTTT	2	10	362198	362207	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009437	TTAAT	2	10	366126	366135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009437	AAAAG	2	10	367430	367439	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009437	ATTTT	2	10	380787	380796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009437	AAGGG	2	10	408090	408099	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009437	TTTCC	2	10	408259	408268	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_009437	AGATG	2	10	419663	419672	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009437	AAAAT	2	10	423815	423824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009437	ATCTT	2	10	425137	425146	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009437	TAAAA	2	10	425199	425208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009437	ATGAT	2	10	425790	425799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009437	TAAAC	2	10	427311	427320	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009437	TTTGC	2	10	429117	429126	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009437	AGGGA	2	10	431610	431619	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009437	AAGTT	2	10	441356	441365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009437	ATTAT	2	10	441682	441691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009437	ATATT	2	10	442037	442046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009437	TAAAA	2	10	442351	442360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009437	TGAAA	2	10	460776	460785	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009437	AATTT	2	10	464794	464803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009437	TTTGT	2	10	473085	473094	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009437	TATTT	2	10	473801	473810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009437	ACAAA	2	10	473874	473883	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009437	ATAAA	2	10	473919	473928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009437	AAAAG	2	10	482284	482293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009437	ACAAA	2	10	484930	484939	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009437	TATAA	2	10	486256	486265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009437	GGGTG	2	10	487475	487484	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009437	TCGTG	2	10	487539	487548	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009437	CAAGT	2	10	488545	488554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009437	GGGAG	2	10	488688	488697	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009437	AGGGG	2	10	490066	490075	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009437	CCGAA	2	10	490085	490094	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009437	AGCAA	2	10	517444	517453	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009437	AAACA	2	10	522599	522608	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009437	GGAGA	2	10	524440	524449	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009437	AATTA	2	10	527202	527211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009437	GAAAA	2	10	528344	528353	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009437	ATAAA	2	10	528536	528545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009437	TGTAG	2	10	528600	528609	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009437	GGAAA	2	10	536136	536145	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009437	AAAAT	2	10	536347	536356	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009437	TCGCC	2	10	536364	536373	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_009437	ATTTT	2	10	538709	538718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009437	AACAG	2	10	541156	541165	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009437	ATAAA	2	10	541423	541432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009437	TTGTT	2	10	559979	559988	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009437	CTGAG	2	10	561049	561058	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009437	CCTTC	2	10	561501	561510	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_009437	TTTTA	2	10	564624	564633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009437	TGAGG	2	10	565484	565493	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009437	TTTTG	2	10	578251	578260	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009437	ATATT	2	10	580087	580096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009437	AAATA	2	10	588476	588485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009437	TATAA	2	10	588541	588550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009437	ATTAA	2	10	588606	588615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_009437	AACTA	2	10	596776	596785	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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