MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 chromosome

Total Repeats: 10710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009437	TTGA	2	8	82	89	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009437	ATT	2	6	148	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009437	CAAAAT	2	12	174	185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009437	AAATTA	2	12	190	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009437	TTAAA	2	10	211	220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009437	CAAATT	2	12	230	241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009437	AAT	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009437	AAT	2	6	394	399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009437	TTG	2	6	440	445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009437	AAT	2	6	451	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009437	T	8	8	456	463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009437	AT	3	6	465	470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009437	T	7	7	575	581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009437	TTAC	2	8	607	614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009437	TACA	2	8	617	624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009437	TG	3	6	2025	2030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009437	CA	3	6	2124	2129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009437	TAT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009437	TAC	3	9	2158	2166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009437	TTTA	2	8	2176	2183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009437	AGG	2	6	2213	2218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009437	T	6	6	3333	3338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009437	TCT	2	6	4409	4414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009437	A	6	6	4418	4423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009437	ATTTT	2	10	4733	4742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009437	AGG	2	6	6693	6698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009437	CTTT	2	8	9188	9195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009437	TATAAT	2	12	9238	9249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009437	AAT	2	6	9252	9257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009437	A	6	6	9274	9279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009437	A	7	7	9344	9350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009437	AC	3	6	9356	9361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009437	TTTC	2	8	9374	9381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009437	T	6	6	9388	9393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009437	GA	3	6	9429	9434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009437	GAT	2	6	11357	11362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009437	A	6	6	11363	11368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009437	AGG	2	6	11419	11424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009437	AAT	2	6	11431	11436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009437	AGA	2	6	11451	11456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009437	TTA	2	6	11466	11471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009437	TTG	2	6	11486	11491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009437	ATT	2	6	11535	11540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009437	TGC	2	6	11587	11592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009437	GA	3	6	11619	11624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009437	TGA	2	6	11689	11694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009437	TTTTA	2	10	11695	11704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009437	TTG	2	6	12740	12745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009437	TAT	2	6	12786	12791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009437	A	6	6	12800	12805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009437	TC	4	8	12841	12848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009437	GT	3	6	13193	13198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009437	A	6	6	13308	13313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009437	AT	3	6	13379	13384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009437	AGG	2	6	13472	13477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009437	TGT	2	6	13481	13486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009437	ACA	2	6	13503	13508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009437	GGAA	2	8	13511	13518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009437	AGC	2	6	13598	13603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009437	A	6	6	13613	13618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009437	AAC	2	6	13625	13630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009437	CAT	2	6	13635	13640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009437	ATA	2	6	13641	13646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009437	TTC	2	6	13678	13683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009437	ATT	2	6	13842	13847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009437	AAAG	2	8	13850	13857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009437	AAGAG	2	10	13901	13910	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009437	T	6	6	14352	14357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009437	CAC	2	6	14478	14483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009437	T	7	7	14494	14500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009437	A	6	6	14564	14569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009437	TAA	2	6	14585	14590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009437	A	6	6	14598	14603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009437	TAA	2	6	14630	14635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009437	T	6	6	14671	14676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009437	CT	3	6	14704	14709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009437	T	6	6	14711	14716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009437	TG	3	6	14754	14759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009437	TAT	2	6	14814	14819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009437	TTA	2	6	14824	14829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009437	TAT	2	6	14890	14895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009437	GCT	2	6	15008	15013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009437	TGC	2	6	15038	15043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009437	CAAAT	2	10	15061	15070	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009437	CA	3	6	15203	15208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009437	AAG	2	6	15241	15246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009437	TAG	2	6	15336	15341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009437	TTA	2	6	15376	15381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009437	T	7	7	15393	15399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009437	CTT	2	6	15400	15405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009437	ATAA	2	8	15426	15433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009437	TAT	2	6	21071	21076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009437	TTA	2	6	21077	21082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009437	A	6	6	21122	21127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009437	T	6	6	21204	21209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009437	TCAA	2	8	21216	21223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009437	ATGT	2	8	21247	21254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009437	ATTT	2	8	21281	21288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009437	GAA	2	6	21359	21364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009437	GAA	2	6	21367	21372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009437	A	6	6	21379	21384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009437	AT	3	6	21394	21399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009437	TGA	2	6	21400	21405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009437	A	6	6	21405	21410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009437	A	8	8	21421	21428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009437	AGA	2	6	21445	21450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009437	CAG	2	6	21474	21479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009437	A	8	8	21508	21515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009437	A	7	7	21608	21614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009437	TGT	2	6	21622	21627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009437	ATA	2	6	21654	21659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009437	TAGT	2	8	21672	21679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009437	TAT	2	6	21707	21712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009437	ATG	2	6	21741	21746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009437	AAG	3	9	21766	21774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009437	A	6	6	21784	21789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009437	ATG	2	6	21825	21830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009437	CTTC	2	8	21836	21843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009437	GTT	2	6	21856	21861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009437	TTA	2	6	21882	21887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009437	TAA	2	6	22108	22113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009437	TAT	2	6	22178	22183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009437	TTG	2	6	22215	22220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009437	A	6	6	22240	22245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009437	AT	3	6	22255	22260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009437	TGA	2	6	22285	22290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009437	TGA	2	6	22330	22335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009437	GAA	2	6	22343	22348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009437	A	6	6	22351	22356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009437	ACAA	2	8	22362	22369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009437	A	6	6	22384	22389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009437	T	6	6	22457	22462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009437	ATT	2	6	22520	22525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009437	A	6	6	22530	22535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009437	AGA	2	6	22537	22542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009437	CAAA	2	8	22583	22590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009437	GAAATA	2	12	22604	22615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009437	TAA	2	6	22621	22626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009437	GAA	2	6	22630	22635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009437	A	6	6	22664	22669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009437	ATTA	2	8	22726	22733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009437	A	6	6	22738	22743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009437	ATT	2	6	22826	22831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009437	TTAAA	2	10	22842	22851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009437	T	6	6	22903	22908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009437	TAA	2	6	23038	23043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009437	AATT	2	8	23052	23059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009437	TCT	2	6	23089	23094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_009437	ATA	2	6	23127	23132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009437	AAAC	2	8	23186	23193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_009437	ACT	2	6	23268	23273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_009437	A	6	6	23422	23427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009437	AAGGA	2	10	23429	23438	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009437	AGA	2	6	23439	23444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009437	AGA	2	6	23520	23525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_009437	A	6	6	25086	25091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_009437	AGA	2	6	35292	35297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_009437	GGT	2	6	35616	35621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_009437	GCA	2	6	36023	36028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_009437	AGA	2	6	36055	36060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_009437	GT	3	6	36192	36197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
293	NC_009437	ACC	2	6	36200	36205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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