MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeovibrioides DSM 265 chromosome

Total Repeats: 581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009337	TAAA	2	8	1636	1643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009337	TCCT	2	8	4396	4403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009337	GACG	2	8	15149	15156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009337	CCCG	2	8	21496	21503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_009337	AAGA	2	8	27527	27534	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009337	TCAT	2	8	33517	33524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009337	ATGT	2	8	35603	35610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009337	ATCA	2	8	35641	35648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009337	CCTT	2	8	37354	37361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009337	CCGG	2	8	37722	37729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009337	GCCG	2	8	38110	38117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009337	CGAA	2	8	38568	38575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009337	CTTC	2	8	38602	38609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009337	TGGC	2	8	39511	39518	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009337	TGTT	2	8	39968	39975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009337	ACCG	2	8	39979	39986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009337	TGGC	2	8	40009	40016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009337	TTTG	2	8	41542	41549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009337	CAAG	2	8	41611	41618	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009337	TTAT	2	8	44389	44396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009337	CTGC	2	8	60100	60107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009337	CCAC	2	8	66848	66855	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_009337	CCGT	2	8	67740	67747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009337	TTCA	2	8	67857	67864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009337	ACGA	2	8	69869	69876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009337	TTAC	2	8	77162	77169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009337	AGTC	2	8	77905	77912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009337	CAGG	2	8	78333	78340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009337	ACGG	2	8	78476	78483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009337	CTTT	2	8	97856	97863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009337	CAGT	2	8	98673	98680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009337	TTTA	2	8	100022	100029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009337	TCGG	2	8	100558	100565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009337	GAAT	2	8	100811	100818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009337	GATT	2	8	106263	106270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009337	AAAG	2	8	106337	106344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009337	GCAG	3	12	106351	106362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009337	ATAC	2	8	107654	107661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009337	GGCA	2	8	108250	108257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009337	ATTT	2	8	109253	109260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009337	TCAA	2	8	109264	109271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009337	TCGG	2	8	110038	110045	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009337	GTCT	2	8	110238	110245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009337	CTGT	2	8	110331	110338	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009337	ATGC	2	8	111406	111413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009337	CCGG	2	8	111504	111511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009337	AAAT	2	8	111709	111716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009337	ATTC	2	8	112058	112065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009337	AGGA	2	8	118796	118803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009337	TCAC	2	8	123487	123494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009337	CCGG	2	8	123763	123770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009337	CCGG	2	8	124692	124699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009337	GGAA	2	8	129047	129054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009337	AAGA	2	8	133081	133088	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009337	GACC	2	8	134888	134895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009337	GGCT	2	8	134933	134940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009337	GAAT	2	8	135118	135125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009337	GGCA	2	8	135240	135247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009337	TGCA	2	8	137844	137851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009337	TAAA	2	8	138477	138484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009337	GATT	2	8	141019	141026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009337	GGTT	2	8	143828	143835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009337	TTTG	2	8	143928	143935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009337	CATT	2	8	147790	147797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009337	CAGA	2	8	150738	150745	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009337	AAAG	2	8	161817	161824	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009337	ATCC	2	8	167735	167742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009337	TTTA	2	8	178509	178516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009337	ATAA	2	8	181920	181927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009337	AGAT	2	8	191395	191402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009337	CATG	2	8	192384	192391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009337	AGGG	2	8	192772	192779	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009337	AGGA	2	8	192930	192937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009337	TGGC	2	8	193286	193293	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009337	AAGT	2	8	193706	193713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009337	AGCG	2	8	194079	194086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009337	ACGG	2	8	196930	196937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009337	TGTA	2	8	197849	197856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009337	GATG	2	8	197896	197903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009337	AGTA	2	8	199902	199909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009337	GCGG	2	8	202061	202068	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009337	GCAA	2	8	202132	202139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009337	CCGG	2	8	208880	208887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009337	GCGG	2	8	212307	212314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009337	TGGT	2	8	216984	216991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009337	CCCG	2	8	221750	221757	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_009337	ATGA	2	8	222108	222115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009337	TTCT	2	8	222637	222644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009337	TGGC	2	8	222665	222672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009337	CTTC	2	8	222768	222775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009337	AGAA	2	8	222852	222859	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009337	GCGG	2	8	228767	228774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009337	CAGC	2	8	229104	229111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009337	AGCC	2	8	229112	229119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009337	CTGC	2	8	229615	229622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009337	TGGA	2	8	229877	229884	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009337	TTTG	2	8	231132	231139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009337	TTGC	2	8	231159	231166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009337	CGTT	2	8	234545	234552	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009337	TCCC	2	8	239943	239950	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_009337	TTTA	2	8	239955	239962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009337	CTGA	2	8	259258	259265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009337	AAAC	2	8	264380	264387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009337	TTAC	2	8	264391	264398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009337	TACA	2	8	264714	264721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009337	TCAG	2	8	271687	271694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009337	AATG	2	8	273345	273352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009337	AATC	2	8	274956	274963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009337	TCGG	2	8	280939	280946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009337	AACA	2	8	282256	282263	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009337	ATGC	2	8	302335	302342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009337	TCAA	2	8	308505	308512	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009337	GAGT	2	8	313287	313294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009337	CTTT	2	8	313588	313595	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009337	TGTT	2	8	313704	313711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009337	TGCA	2	8	316280	316287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009337	AATT	2	8	319606	319613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009337	ATTT	2	8	319618	319625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009337	AGCC	2	8	328803	328810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009337	TGGC	2	8	328825	328832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009337	TCCT	3	12	334141	334152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009337	TGTC	2	8	338763	338770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009337	TAAT	2	8	339744	339751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009337	GTTT	2	8	341694	341701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009337	TGAT	2	8	341710	341717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009337	TTTG	2	8	341746	341753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009337	AGGC	2	8	347404	347411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009337	GCCT	2	8	347426	347433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009337	AGGC	2	8	350154	350161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009337	ATTG	2	8	350183	350190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009337	GGCA	2	8	356993	357000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009337	GGCC	2	8	368466	368473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009337	GCAC	2	8	375371	375378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009337	CAAT	2	8	381561	381568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009337	AATC	2	8	410396	410403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009337	CAGG	2	8	411453	411460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009337	TTTA	2	8	413017	413024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009337	ATGA	2	8	425142	425149	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009337	TATT	2	8	466120	466127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009337	TTTC	2	8	466240	466247	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009337	AGGC	2	8	498118	498125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009337	GTCG	2	8	498128	498135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009337	TTTA	2	8	511603	511610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009337	GGGT	2	8	518029	518036	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009337	AACT	2	8	523297	523304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009337	GTTT	2	8	525480	525487	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009337	GTTC	2	8	533837	533844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009337	AATT	2	8	536430	536437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009337	AGGC	2	8	537471	537478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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151	NC_009337	GAAC	2	8	546992	546999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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