MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 1459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009089	GGTAA	2	10	11054	11063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009089	AGGAG	2	10	11434	11443	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009089	TCGTG	2	10	11845	11854	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009089	CTTGC	2	10	12398	12407	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009089	GGGAG	2	10	13346	13355	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009089	TAAGT	2	10	13871	13880	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009089	TAAGC	2	10	14292	14301	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009089	AAGAT	2	10	15600	15609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009089	AAAAT	2	10	19473	19482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009089	GATAA	2	10	19508	19517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009089	TATAT	2	10	24799	24808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009089	GGTAA	2	10	25509	25518	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009089	AGGAG	2	10	25889	25898	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009089	TCGTG	2	10	26300	26309	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009089	GGGAG	2	10	27558	27567	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009089	TAAGT	2	10	28083	28092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009089	TAAGC	2	10	28504	28513	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009089	AAGAT	2	10	29812	29821	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009089	TAATA	2	10	30082	30091	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009089	AAAAT	2	10	30822	30831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009089	ATTAA	2	10	31715	31724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009089	AAAAT	2	10	32653	32662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009089	ATTTA	2	10	32935	32944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009089	ATTAA	2	10	33640	33649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009089	TATAG	2	10	45505	45514	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009089	AATAT	2	10	48022	48031	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009089	TTATT	2	10	52664	52673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009089	ATAAG	2	10	52699	52708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009089	ATTAT	2	10	61532	61541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009089	TAAAA	2	10	67259	67268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009089	AATTG	2	10	69522	69531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009089	ATAAA	2	10	70482	70491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009089	TAAAA	2	10	71653	71662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009089	AAAAT	2	10	71692	71701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009089	ATAAG	2	10	76655	76664	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009089	AGCAA	2	10	78588	78597	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009089	TATAA	2	10	78940	78949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009089	ATATT	2	10	85105	85114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009089	TAAAA	2	10	88599	88608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009089	ACTAA	2	10	102116	102125	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009089	AAAAT	2	10	102264	102273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009089	GTTAA	2	10	122736	122745	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009089	AATAA	2	10	122758	122767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009089	ATTTT	2	10	122856	122865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009089	TATAA	2	10	122956	122965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009089	TAAAA	2	10	123968	123977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009089	GGTAA	2	10	124394	124403	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009089	AGGAG	2	10	124774	124783	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009089	TCGTG	2	10	125185	125194	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009089	CTTGC	2	10	125738	125747	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009089	GGGAG	2	10	126685	126694	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009089	TAAGT	2	10	127210	127219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009089	TAAGC	2	10	127631	127640	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009089	AAGAT	2	10	128939	128948	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009089	AAGTT	2	10	129241	129250	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009089	GGTAA	2	10	131341	131350	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009089	AGGAG	2	10	131721	131730	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009089	TCGTG	2	10	132132	132141	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009089	CTTGC	2	10	132685	132694	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009089	GGGAG	2	10	133632	133641	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009089	TAAGT	2	10	134157	134166	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009089	TAAGC	2	10	134578	134587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009089	AAGAT	2	10	135886	135895	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009089	GGTAA	2	10	141951	141960	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009089	AGGAG	2	10	142331	142340	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009089	TCGTG	2	10	142742	142751	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009089	CTTGC	2	10	143295	143304	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009089	GGGAG	2	10	144181	144190	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009089	TAAGT	2	10	144706	144715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009089	TAAGC	2	10	145127	145136	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009089	AAGAT	2	10	146435	146444	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009089	GGTAA	2	10	147406	147415	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009089	AGGAG	2	10	147786	147795	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009089	TCGTG	2	10	148197	148206	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009089	CTTGC	2	10	148750	148759	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_009089	GGGAG	2	10	149575	149584	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009089	TAAGT	2	10	150100	150109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009089	TAAGC	2	10	150521	150530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009089	AAGAT	2	10	151829	151838	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009089	CAATT	2	10	152538	152547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009089	ATCTA	2	10	153499	153508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009089	TAATT	2	10	156195	156204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009089	TTTGT	2	10	165310	165319	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009089	GATAA	2	10	165521	165530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009089	AATTA	2	10	171703	171712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009089	TATAA	2	10	171835	171844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009089	AGTAA	2	10	174116	174125	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009089	ATTTA	2	10	177014	177023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009089	TAAAA	2	10	177044	177053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009089	TTAAT	2	10	208307	208316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009089	ATTAA	2	10	208563	208572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009089	ATATT	2	10	208648	208657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009089	TATAA	2	10	208763	208772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009089	TATAT	2	10	209296	209305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009089	ATTAA	2	10	209312	209321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009089	AATAT	2	10	210013	210022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009089	AAATA	2	10	210271	210280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009089	TAAAA	2	10	211044	211053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009089	TATTC	2	10	211806	211815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009089	ATTTT	2	10	211916	211925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009089	ATTTT	2	10	211941	211950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009089	ATTTA	2	10	211955	211964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009089	TTATA	2	10	212000	212009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009089	GAAAG	2	10	215286	215295	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009089	AAAGT	2	10	217171	217180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009089	TAATA	2	10	220446	220455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009089	GTATA	2	10	220537	220546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009089	GTATA	2	10	224039	224048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009089	ATATA	2	10	227401	227410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009089	TAAAA	2	10	228944	228953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009089	AATTA	2	10	229218	229227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009089	AAAAT	2	10	229328	229337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009089	TATTT	2	10	229395	229404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009089	TGTAC	2	10	238415	238424	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009089	GATTT	2	10	240847	240856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009089	TATAT	2	10	242312	242321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009089	TTAAT	2	10	242322	242331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009089	TATAA	2	10	249134	249143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009089	AATTA	2	10	255516	255525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009089	TTAAA	2	10	260187	260196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009089	ATTTT	2	10	260271	260280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009089	ATATA	2	10	265776	265785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009089	TAAAA	2	10	277951	277960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009089	AAGGT	2	10	278858	278867	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009089	TTAAA	2	10	292686	292695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009089	GAGGT	2	10	294585	294594	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009089	GCTTT	2	10	301853	301862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009089	TTCTT	2	10	301864	301873	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009089	AAATA	2	10	304186	304195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009089	ATTAT	2	10	304653	304662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009089	TAAAA	2	10	308420	308429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009089	TAAAT	2	10	308641	308650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009089	AAATT	2	10	308697	308706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009089	ATAAA	2	10	308999	309008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009089	TAATG	2	10	309155	309164	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009089	AAATT	2	10	335467	335476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009089	TTTTA	2	10	336992	337001	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009089	TATTT	2	10	338146	338155	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009089	ATTTA	2	10	340736	340745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009089	AGATA	2	10	341042	341051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009089	TAAAA	2	10	342379	342388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009089	TAAAT	2	10	342449	342458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009089	AATTT	2	10	342759	342768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009089	ATATA	2	10	342950	342959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009089	AATTT	2	10	350216	350225	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009089	GAAAA	2	10	352373	352382	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009089	CTTTT	2	10	352609	352618	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_009089	TAAAA	2	10	362047	362056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009089	ATATA	2	10	370521	370530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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