MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 11266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009089	ATT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009089	TTA	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009089	CAA	2	6	1486	1491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009089	CTA	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009089	TAC	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009089	AGG	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009089	AGG	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009089	GGC	2	6	10851	10856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009089	GCG	2	6	10899	10904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009089	ATA	2	6	10977	10982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009089	CGA	2	6	11077	11082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009089	GCA	2	6	11151	11156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009089	GCA	2	6	11191	11196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009089	CGC	2	6	11198	11203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009089	GAG	2	6	11266	11271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009089	CAG	2	6	11294	11299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009089	GTA	2	6	11400	11405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009089	AGG	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009089	GGC	2	6	11504	11509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009089	GAA	2	6	11746	11751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009089	GGT	2	6	11822	11827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009089	GTC	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009089	CAT	2	6	11904	11909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009089	GGA	2	6	11948	11953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009089	ATC	2	6	11972	11977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009089	GTA	2	6	12017	12022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009089	TGC	2	6	12138	12143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009089	CAC	2	6	12183	12188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009089	GAA	2	6	12229	12234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009089	GTC	2	6	12235	12240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009089	CCT	2	6	12309	12314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009089	CTC	2	6	12432	12437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009089	CCA	2	6	12442	12447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009089	TAG	2	6	12482	12487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009089	AAT	2	6	12615	12620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009089	GTT	2	6	12637	12642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009089	GTG	2	6	12650	12655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009089	TTA	2	6	12830	12835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009089	GCG	2	6	13067	13072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009089	CAC	2	6	13173	13178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009089	AGG	2	6	13264	13269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009089	ACC	2	6	13271	13276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009089	TAC	2	6	13290	13295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009089	AGC	2	6	13927	13932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009089	TAC	2	6	14005	14010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009089	ATG	2	6	14030	14035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009089	ACA	2	6	14230	14235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009089	TAC	2	6	14250	14255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009089	TAG	2	6	14392	14397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009089	TGT	2	6	14510	14515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009089	CCA	2	6	14561	14566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009089	CGG	2	6	14726	14731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009089	CAA	2	6	14820	14825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009089	TAC	2	6	14926	14931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009089	ACC	2	6	14997	15002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009089	GTA	2	6	15006	15011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009089	GGT	2	6	15221	15226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009089	TCA	2	6	15336	15341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009089	GTA	2	6	15354	15359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009089	CGT	2	6	15416	15421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009089	GCA	2	6	15671	15676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009089	TTA	2	6	15809	15814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009089	TGG	2	6	15926	15931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009089	TAT	2	6	15979	15984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009089	TAA	2	6	16027	16032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009089	AAT	2	6	17559	17564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009089	TAT	2	6	17923	17928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009089	ATT	2	6	17933	17938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009089	AGG	2	6	17939	17944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009089	TGA	2	6	19256	19261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009089	ATT	2	6	19305	19310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009089	CAG	2	6	19350	19355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009089	TCA	2	6	19361	19366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009089	ATT	2	6	19415	19420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009089	TAA	2	6	19457	19462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009089	GGA	2	6	19535	19540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009089	GCC	2	6	20218	20223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009089	GTG	2	6	20232	20237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009089	TAT	2	6	22116	22121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009089	ATA	3	9	22125	22133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009089	AGG	2	6	22150	22155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009089	TCT	2	6	23210	23215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009089	TGT	2	6	23229	23234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009089	AAT	2	6	23496	23501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009089	ATA	2	6	23526	23531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009089	TCC	2	6	24774	24779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009089	ATT	2	6	24852	24857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009089	GAT	2	6	25124	25129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009089	GGC	2	6	25306	25311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009089	GCG	2	6	25354	25359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009089	ATA	2	6	25432	25437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009089	CGA	2	6	25532	25537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009089	GCA	2	6	25606	25611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009089	GCA	2	6	25646	25651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009089	CGC	2	6	25653	25658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009089	GAG	2	6	25721	25726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009089	CAG	2	6	25749	25754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009089	GTA	2	6	25855	25860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009089	AGG	2	6	25938	25943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009089	GGC	2	6	25959	25964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009089	GAA	2	6	26201	26206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009089	GGT	2	6	26277	26282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009089	GTC	2	6	26291	26296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009089	CAT	2	6	26359	26364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009089	GGA	2	6	26403	26408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009089	ATC	2	6	26427	26432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009089	GTA	2	6	26472	26477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009089	TGC	2	6	26593	26598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009089	CAC	2	6	26638	26643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009089	GAA	2	6	26684	26689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009089	GTC	2	6	26690	26695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009089	CCT	2	6	26764	26769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009089	TTA	2	6	27042	27047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009089	GCG	2	6	27279	27284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009089	CAC	2	6	27385	27390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009089	AGG	2	6	27476	27481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009089	ACC	2	6	27483	27488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009089	TAC	2	6	27502	27507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009089	AGC	2	6	28139	28144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009089	TAC	2	6	28217	28222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009089	ATG	2	6	28242	28247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009089	ACA	2	6	28442	28447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009089	TAC	2	6	28462	28467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009089	TAG	2	6	28604	28609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009089	TGT	2	6	28722	28727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009089	CCA	2	6	28773	28778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009089	CGG	2	6	28938	28943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009089	CAA	2	6	29032	29037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009089	TAC	2	6	29138	29143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009089	ACC	2	6	29209	29214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009089	GTA	2	6	29218	29223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009089	GGT	2	6	29433	29438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009089	TCA	2	6	29548	29553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009089	GTA	2	6	29566	29571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009089	CGT	2	6	29628	29633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009089	GCA	2	6	29883	29888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009089	ATT	2	6	29934	29939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_009089	TGG	2	6	30192	30197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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