MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 25224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009089	CAC	2	6	147051	147056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_009089	AAT	2	6	147057	147062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009089	AAAC	2	8	147109	147116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_009089	GGC	2	6	147203	147208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_009089	GCG	2	6	147251	147256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_009089	AC	3	6	147291	147296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_009089	ATA	2	6	147329	147334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009089	GGTAA	2	10	147406	147415	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009089	CGA	2	6	147429	147434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009089	GCA	2	6	147503	147508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_009089	GCA	2	6	147543	147548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_009089	CGC	2	6	147550	147555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_009089	GTGA	2	8	147556	147563	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009089	GAG	2	6	147618	147623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009089	CAG	2	6	147646	147651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_009089	GTA	2	6	147752	147757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009089	AGGAG	2	10	147786	147795	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009089	AGG	2	6	147835	147840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009089	GGC	2	6	147856	147861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_009089	GAA	2	6	148098	148103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009089	GGT	2	6	148174	148179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009089	GTC	2	6	148188	148193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_009089	TCGTG	2	10	148197	148206	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_009089	CAT	2	6	148256	148261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_009089	AG	3	6	148277	148282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009089	GGA	2	6	148300	148305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009089	ATC	2	6	148324	148329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1029	NC_009089	GTA	2	6	148369	148374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009089	TGC	2	6	148490	148495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_009089	AC	3	6	148520	148525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_009089	CAC	2	6	148535	148540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_009089	GAA	2	6	148581	148586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009089	GTC	2	6	148587	148592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_009089	CCT	2	6	148661	148666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_009089	TA	3	6	148717	148722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009089	CTTGC	2	10	148750	148759	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_009089	CTC	2	6	148784	148789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_009089	CCA	2	6	148794	148799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_009089	TAG	2	6	148834	148839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009089	AT	5	10	148947	148956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009089	AT	3	6	148982	148987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009089	TTA	2	6	149059	149064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009089	GAAG	2	8	149263	149270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009089	AGAA	2	8	149271	149278	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009089	GCG	2	6	149296	149301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_009089	CAC	2	6	149402	149407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_009089	AGG	2	6	149493	149498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009089	ACC	2	6	149500	149505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_009089	TAC	2	6	149519	149524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_009089	GGGAG	2	10	149575	149584	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009089	TG	3	6	149635	149640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009089	GA	3	6	149935	149940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009089	TAAGT	2	10	150100	150109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009089	AGC	2	6	150156	150161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_009089	TAC	2	6	150234	150239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009089	ATG	2	6	150259	150264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009089	ACA	2	6	150459	150464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_009089	TAC	2	6	150479	150484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_009089	GA	3	6	150497	150502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009089	TAAGC	2	10	150521	150530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_009089	TG	3	6	150544	150549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009089	TAG	2	6	150621	150626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_009089	GGTG	2	8	150701	150708	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009089	GA	3	6	150731	150736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009089	TGT	2	6	150739	150744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009089	CCA	2	6	150790	150795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_009089	CGG	2	6	150955	150960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_009089	CAA	2	6	151049	151054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_009089	TAC	2	6	151155	151160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_009089	ACC	2	6	151226	151231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_009089	GTA	2	6	151235	151240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1074	NC_009089	CGTA	2	8	151367	151374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_009089	AG	3	6	151390	151395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009089	GGT	2	6	151450	151455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009089	TCA	2	6	151565	151570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_009089	GTA	2	6	151583	151588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_009089	CGT	2	6	151645	151650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_009089	GCA	2	6	151900	151905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1084	NC_009089	AT	3	6	151976	151981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009089	TTA	2	6	152038	152043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_009089	CT	3	6	152134	152139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_009089	TGG	2	6	152155	152160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009089	A	6	6	152275	152280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009089	TCG	2	6	152405	152410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_009089	TTTA	2	8	153041	153048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009089	TA	3	6	153195	153200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009089	TA	3	6	153227	153232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009089	ATT	2	6	153250	153255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009089	A	6	6	153310	153315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009089	TAAA	2	8	153366	153373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009089	TTA	2	6	153374	153379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009089	AT	3	6	153393	153398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009089	TAT	2	6	153415	153420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009089	ATA	2	6	153452	153457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009089	ATCTA	2	10	153499	153508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_009089	TTA	2	6	153522	153527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009089	AAT	2	6	153554	153559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009089	TGA	2	6	153562	153567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_009089	AT	4	8	153634	153641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009089	AT	3	6	153651	153656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009089	TAA	2	6	153751	153756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009089	TATT	2	8	153765	153772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009089	ATT	2	6	153800	153805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009089	ATT	2	6	153832	153837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009089	TA	3	6	153874	153879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009089	AAG	2	6	153904	153909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1121	NC_009089	AT	3	6	156104	156109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_009089	A	6	6	156111	156116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_009089	TAAA	2	8	156133	156140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009089	TAATT	2	10	156195	156204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009089	A	6	6	156227	156232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009089	AT	3	6	158936	158941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_009089	AGG	2	6	158952	158957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_009089	A	8	8	161617	161624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_009089	ATT	2	6	161634	161639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009089	T	6	6	161649	161654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_009089	ATA	2	6	161725	161730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009089	ATT	2	6	163187	163192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_009089	CGG	2	6	163240	163245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_009089	GT	3	6	163256	163261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_009089	CTT	2	6	163276	163281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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