MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009012	A	7	7	793946	793952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_009012	TATT	2	8	794000	794007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_009012	AAG	2	6	794017	794022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_009012	TTA	2	6	794025	794030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_009012	AAG	2	6	794062	794067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_009012	GAA	2	6	795184	795189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_009012	TTG	2	6	795212	795217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_009012	T	9	9	795219	795227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_009012	AT	3	6	795234	795239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_009012	ATT	2	6	795241	795246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_009012	ATA	2	6	798332	798337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_009012	ATTA	2	8	798358	798365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_009012	TTA	2	6	798387	798392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_009012	A	6	6	798392	798397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_009012	A	6	6	798402	798407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_009012	TA	3	6	798441	798446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_009012	ACA	2	6	798468	798473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_009012	CGC	2	6	798554	798559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_009012	GAG	2	6	798566	798571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_009012	AATT	2	8	798594	798601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_009012	AATT	2	8	798606	798613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_009012	GAT	2	6	798633	798638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009012	CCTG	2	8	798653	798660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_009012	ATC	2	6	798777	798782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_009012	ATC	2	6	798789	798794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_009012	A	7	7	798886	798892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_009012	GATG	2	8	801720	801727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_009012	AT	3	6	801748	801753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_009012	TAA	2	6	801761	801766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_009012	ATAA	2	8	801779	801786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_009012	TA	3	6	801800	801805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_009012	T	6	6	801807	801812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009012	TAC	2	6	801839	801844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_009012	T	8	8	803524	803531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_009012	TTAT	2	8	803536	803543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_009012	TGT	2	6	803566	803571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_009012	CGT	2	6	803585	803590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_009012	ATT	2	6	803591	803596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_009012	AT	3	6	803688	803693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_009012	T	9	9	803732	803740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_009012	A	6	6	803755	803760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_009012	TTAA	2	8	803776	803783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_009012	T	6	6	803790	803795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_009012	TTG	2	6	803850	803855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_009012	A	7	7	803880	803886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_009012	TAA	2	6	803935	803940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_009012	GAA	2	6	803970	803975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_009012	GAC	2	6	803983	803988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_009012	TAA	2	6	804002	804007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009012	AAG	2	6	804359	804364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_009012	TAT	2	6	804372	804377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009012	AT	3	6	804774	804779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_009012	AGG	2	6	804876	804881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_009012	T	7	7	804940	804946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_009012	TTCT	2	8	805001	805008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_009012	TA	3	6	805046	805051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_009012	TA	3	6	805136	805141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_009012	ATG	2	6	805145	805150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_009012	A	6	6	805158	805163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_009012	ATT	2	6	805190	805195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_009012	ATTG	2	8	805228	805235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_009012	GTT	2	6	805252	805257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_009012	TTGTT	2	10	805269	805278	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_009012	AAT	2	6	805305	805310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_009012	A	7	7	805314	805320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_009012	GAA	2	6	805327	805332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_009012	ATGA	2	8	805366	805373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_009012	TAA	2	6	805405	805410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009012	T	6	6	805444	805449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_009012	GGA	2	6	805477	805482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_009012	ATA	2	6	805768	805773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_009012	TA	3	6	805806	805811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_009012	T	6	6	805826	805831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_009012	AGA	2	6	805841	805846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_009012	TTAAA	2	10	806123	806132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_009012	TGACG	2	10	806222	806231	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3077	NC_009012	GTTTTT	2	12	806330	806341	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_009012	AT	4	8	807848	807855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_009012	A	6	6	807863	807868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_009012	TTA	2	6	807927	807932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_009012	CAAA	2	8	809167	809174	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_009012	AATT	2	8	809199	809206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_009012	TGG	2	6	809213	809218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_009012	TAT	2	6	809231	809236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_009012	ATT	2	6	809243	809248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_009012	TA	4	8	809256	809263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_009012	TAT	2	6	809273	809278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_009012	TGA	2	6	809285	809290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_009012	TGA	2	6	809295	809300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_009012	TTATT	2	10	809341	809350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_009012	AT	3	6	809356	809361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_009012	AT	3	6	809375	809380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_009012	AT	3	6	809399	809404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_009012	T	7	7	810584	810590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_009012	TTTTTA	2	12	810670	810681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3098	NC_009012	AAAATT	2	12	810756	810767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_009012	TAA	2	6	810775	810780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_009012	A	6	6	810784	810789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_009012	AT	3	6	810985	810990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_009012	TAT	2	6	811000	811005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_009012	TA	3	6	811026	811031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_009012	AATC	2	8	811674	811681	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_009012	A	6	6	811748	811753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_009012	TAT	2	6	811761	811766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_009012	TA	3	6	811790	811795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_009012	CTGT	2	8	811891	811898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_009012	A	6	6	811915	811920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_009012	GCG	2	6	811963	811968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_009012	ATT	2	6	811990	811995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_009012	CAAA	2	8	812026	812033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_009012	CAT	2	6	812069	812074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_009012	ACA	2	6	812128	812133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_009012	ATA	2	6	812200	812205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_009012	T	6	6	812241	812246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_009012	A	6	6	812260	812265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_009012	AGC	2	6	812279	812284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_009012	AT	3	6	812306	812311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_009012	AAG	2	6	812313	812318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_009012	GAAA	2	8	812345	812352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_009012	A	7	7	812377	812383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_009012	CTT	2	6	812403	812408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_009012	CAT	2	6	812903	812908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_009012	T	6	6	812908	812913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_009012	ATTT	2	8	812924	812931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_009012	TAAA	2	8	812976	812983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_009012	A	6	6	812986	812991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_009012	AT	4	8	813026	813033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_009012	ATT	2	6	813042	813047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_009012	ATTG	2	8	813081	813088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_009012	GA	3	6	813141	813146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_009012	A	6	6	813162	813167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_009012	AAT	2	6	813169	813174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_009012	GCA	2	6	813188	813193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_009012	TAT	2	6	813208	813213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_009012	AT	3	6	815628	815633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_009012	TAA	2	6	815641	815646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3140	NC_009012	TTTGT	2	10	815703	815712	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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