MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 chromosome

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008787	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008787	AATTTA	2	12	20966	20977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008787	TATTTA	2	12	41081	41092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008787	TTTATT	2	12	44883	44894	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008787	TTATAG	2	12	59274	59285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008787	ATTTTT	2	12	176475	176486	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008787	ATATTA	2	12	183511	183522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008787	TATTTT	2	12	214890	214901	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008787	TTAATT	2	12	229771	229782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008787	TATATT	2	12	230344	230355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008787	TATATT	2	12	246524	246535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008787	TATAAA	2	12	246662	246673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008787	AAAATT	2	12	274398	274409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008787	TATTTT	2	12	367267	367278	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008787	TGTGTT	2	12	374932	374943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008787	TATTTA	2	12	397689	397700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008787	TTTATT	2	12	401492	401503	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008787	ATCTTA	2	12	460098	460109	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008787	TATAAA	2	12	460356	460367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008787	ATCTTA	2	12	460382	460393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008787	TAAAAG	2	12	462316	462327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008787	AATTTA	2	12	475039	475050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008787	TTTTAA	2	12	519974	519985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008787	ATATTT	2	12	575153	575164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008787	TAATAG	2	12	612215	612226	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008787	ATTTAA	2	12	621158	621169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008787	TTTATT	2	12	631307	631318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008787	TAAATT	2	12	631376	631387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008787	ATTTTT	2	12	637555	637566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008787	ATAATT	2	12	665033	665044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008787	CTTTCG	2	12	667294	667305	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008787	TTAAAT	2	12	684617	684628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008787	TAGGAG	2	12	687874	687885	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008787	TTATGT	2	12	687944	687955	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008787	TATTTA	2	12	694839	694850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008787	TTTATT	2	12	698643	698654	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008787	TTATTT	2	12	700059	700070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008787	TCAAAA	2	12	703463	703474	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008787	AAATTT	2	12	768391	768402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008787	AATTTT	2	12	781677	781688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008787	AAATTA	2	12	810382	810393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008787	ACAAAG	2	12	824002	824013	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008787	TTTTTA	2	12	826479	826490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008787	AATAAA	2	12	872876	872887	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008787	AATTTC	2	12	875426	875437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008787	TCAAAT	2	12	879192	879203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008787	TAAAAA	2	12	879274	879285	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008787	ATCTTA	2	12	907998	908009	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008787	ATTATA	2	12	910950	910961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008787	ATCTTA	2	12	913397	913408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008787	TATAAA	2	12	913655	913666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008787	ATCTTA	2	12	913681	913692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008787	TAAAAG	2	12	915615	915626	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008787	ATTTTG	2	12	963623	963634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008787	ATTTTA	2	12	1031973	1031984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008787	TTAATT	2	12	1129879	1129890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008787	TATTTT	2	12	1141349	1141360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008787	ATTTAA	2	12	1141534	1141545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008787	AAAAGA	2	12	1141649	1141660	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008787	ATATCC	2	12	1142413	1142424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008787	AAAAAT	2	12	1157128	1157139	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008787	TTAATT	2	12	1157867	1157878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008787	TTTTTA	2	12	1170798	1170809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008787	AATTTT	2	12	1193324	1193335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008787	CAAAAA	2	12	1300834	1300845	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008787	TTAATT	2	12	1310106	1310117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008787	TAAAAA	2	12	1318833	1318844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008787	ATCGCC	2	12	1372190	1372201	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008787	ACTAAA	2	12	1429640	1429651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008787	TAAAAA	2	12	1435820	1435831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008787	CTTAAA	2	12	1435853	1435864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008787	TAGCTT	2	12	1465194	1465205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008787	ATAAAA	2	12	1466679	1466690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008787	ATTTTT	2	12	1489528	1489539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008787	TTAATT	2	12	1489601	1489612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008787	TAAAAA	2	12	1501931	1501942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008787	ATTTTT	2	12	1560093	1560104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008787	TAAAAA	2	12	1600961	1600972	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008787	AGGAAT	2	12	1601329	1601340	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008787	TAAAAT	2	12	1613060	1613071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.