MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 chromosome

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008787	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008787	TAAT	2	8	6557	6564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008787	TAAT	2	8	6566	6573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008787	ATTT	3	12	8038	8049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008787	AAAT	2	8	17480	17487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008787	TTTA	2	8	19680	19687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008787	TGAT	2	8	27237	27244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008787	AAGG	2	8	29581	29588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008787	TATT	2	8	37452	37459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008787	TTTA	2	8	38744	38751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008787	CTAT	2	8	39145	39152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008787	ATTT	2	8	41015	41022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008787	TAGA	2	8	41051	41058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008787	CAAG	2	8	41170	41177	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008787	TAGC	2	8	41775	41782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008787	CTTA	2	8	42437	42444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008787	AAAG	2	8	42508	42515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008787	AGTA	2	8	42568	42575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008787	TAAT	2	8	42828	42835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008787	GGAT	2	8	43098	43105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008787	GGTG	2	8	43183	43190	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008787	TCCC	2	8	43325	43332	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_008787	TTAC	2	8	44854	44861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008787	TAAA	2	8	45079	45086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008787	ATTA	2	8	45131	45138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008787	TTAA	2	8	45145	45152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008787	TATT	2	8	45211	45218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008787	TTTA	2	8	45243	45250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008787	TAAA	2	8	67086	67093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008787	TAAA	2	8	71980	71987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008787	TGAT	2	8	76655	76662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008787	GATT	2	8	77219	77226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008787	ATTT	2	8	77454	77461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008787	AGAA	2	8	77556	77563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008787	AATT	2	8	79163	79170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008787	AAAT	2	8	80818	80825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008787	GTTT	2	8	82480	82487	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008787	TTTA	2	8	82724	82731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008787	TATT	2	8	84102	84109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008787	ATTT	2	8	90397	90404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008787	AAAT	2	8	90430	90437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008787	TTTA	2	8	92599	92606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008787	TTTA	2	8	93904	93911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008787	TAAA	2	8	99499	99506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008787	ATCA	2	8	104828	104835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008787	AATT	2	8	105649	105656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008787	ATTT	2	8	105696	105703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008787	TAAA	3	12	105705	105716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008787	TAAA	2	8	106530	106537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008787	AGGA	2	8	111338	111345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008787	ATTA	2	8	129322	129329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008787	AAGG	2	8	144136	144143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008787	ATTT	2	8	157352	157359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008787	CTTT	2	8	162806	162813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008787	TTAA	2	8	176434	176441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008787	AAAT	2	8	176450	176457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008787	TAAA	2	8	177056	177063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008787	TAAA	2	8	183632	183639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008787	ATTT	2	8	199329	199336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008787	TTTA	2	8	201732	201739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008787	AAGA	2	8	203167	203174	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008787	ATCA	2	8	212373	212380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008787	AAAT	2	8	214372	214379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008787	CAAG	2	8	214695	214702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008787	TAAA	2	8	219138	219145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008787	TAAA	2	8	219191	219198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008787	TAAA	2	8	224130	224137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008787	TAAA	2	8	224951	224958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008787	GGTT	2	8	225037	225044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008787	ATTA	3	12	230396	230407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008787	TAGT	2	8	232981	232988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008787	TTTG	2	8	233096	233103	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008787	ATTT	2	8	234522	234529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008787	ATTA	2	8	234610	234617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008787	TAAA	2	8	237445	237452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008787	TTTG	2	8	237478	237485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008787	GTTT	2	8	250906	250913	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008787	TCCC	2	8	250990	250997	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_008787	TTGA	2	8	251040	251047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008787	AAAT	2	8	260600	260607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008787	CTTT	2	8	270550	270557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008787	TTAA	2	8	272255	272262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008787	ATTG	2	8	273086	273093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008787	GCAA	2	8	273181	273188	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008787	TAAA	2	8	278097	278104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008787	TTAA	2	8	278123	278130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008787	AATA	2	8	297942	297949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008787	AAAG	2	8	305855	305862	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008787	TTTA	2	8	307101	307108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008787	TAAA	2	8	318162	318169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008787	ATTT	2	8	319390	319397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008787	TAAA	2	8	328122	328129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008787	ATAA	2	8	329905	329912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008787	ATTA	2	8	329943	329950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008787	ATTT	2	8	329973	329980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008787	TAAA	2	8	334813	334820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008787	TTTA	2	8	374923	374930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008787	TAAA	2	8	384135	384142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008787	AAGG	2	8	386763	386770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008787	TTTA	2	8	387197	387204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008787	TTTA	2	8	395354	395361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008787	CTAT	2	8	395755	395762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008787	ATTT	2	8	397623	397630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008787	TAGA	2	8	397659	397666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008787	CAAG	2	8	397778	397785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008787	TAGC	2	8	398385	398392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008787	CTTA	2	8	399047	399054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008787	AAAG	2	8	399118	399125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008787	AGTA	2	8	399178	399185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008787	TAAT	2	8	399438	399445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008787	GGAT	2	8	399708	399715	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008787	GGTG	2	8	399793	399800	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008787	TCCC	2	8	399935	399942	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_008787	TTAC	2	8	401463	401470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008787	GATA	2	8	405523	405530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008787	TTAA	2	8	406719	406726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008787	ATAA	2	8	406728	406735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008787	TTAA	2	8	406740	406747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008787	ATTT	2	8	406836	406843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008787	ATCT	2	8	406854	406861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008787	GTTT	2	8	406942	406949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008787	TTAA	2	8	413959	413966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008787	ATAA	2	8	416171	416178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008787	ATTT	2	8	435614	435621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008787	ATTT	2	8	436054	436061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008787	AAAG	2	8	449451	449458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008787	TCAT	2	8	449854	449861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008787	TTTA	2	8	457526	457533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008787	TATT	2	8	457578	457585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008787	ATAG	2	8	458742	458749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008787	AACA	2	8	462122	462129	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008787	CAAA	2	8	462149	462156	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008787	TAAA	2	8	466886	466893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008787	TTTA	2	8	474595	474602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008787	CTTT	2	8	474996	475003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008787	ATTT	2	8	507394	507401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008787	CAAA	2	8	510551	510558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008787	TTTC	2	8	510694	510701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008787	ATCA	2	8	510871	510878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008787	ATTT	2	8	511541	511548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008787	TTTA	2	8	518826	518833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008787	TTTA	2	8	519917	519924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008787	TGTT	2	8	522324	522331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008787	AATT	2	8	522434	522441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008787	CTTT	2	8	523911	523918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008787	ACTT	2	8	529231	529238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008787	ATTT	2	8	529965	529972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008787	AATA	2	8	530169	530176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008787	TAAA	2	8	537060	537067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008787	ATTT	2	8	573855	573862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008787	TAAT	2	8	573881	573888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.