MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 10751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008639	GGCG	2	8	305442	305449	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_008639	CGT	2	6	305476	305481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_008639	AAAT	2	8	305483	305490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008639	CCG	2	6	305494	305499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_008639	GCT	2	6	305506	305511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_008639	AG	3	6	305539	305544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008639	GCG	2	6	306810	306815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008639	CAC	2	6	307539	307544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_008639	TTTA	2	8	308337	308344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008639	AT	3	6	308411	308416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008639	ATAA	2	8	308521	308528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008639	TATC	2	8	308544	308551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_008639	AAT	2	6	308587	308592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008639	ATG	2	6	308652	308657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008639	T	8	8	308729	308736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008639	TGAAAA	2	12	308778	308789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008639	GCA	2	6	308794	308799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008639	TGA	2	6	308877	308882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008639	GATGAA	2	12	308905	308916	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008639	CAA	2	6	308934	308939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_008639	ATG	2	6	308946	308951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008639	AGC	2	6	309032	309037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_008639	ATA	2	6	309099	309104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008639	A	7	7	309139	309145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008639	ATT	2	6	309171	309176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008639	ATTT	2	8	309981	309988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008639	CAA	2	6	309994	309999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_008639	CGG	2	6	310054	310059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_008639	ATC	2	6	310110	310115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008639	TAG	2	6	310117	310122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008639	AATT	2	8	310174	310181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008639	TGT	2	6	310238	310243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008639	ACTG	2	8	310302	310309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_008639	GCT	2	6	310324	310329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_008639	CGT	2	6	310345	310350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_008639	GCT	2	6	310375	310380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008639	GGA	2	6	310472	310477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008639	CGC	2	6	311357	311362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_008639	GGA	2	6	311404	311409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008639	TAAA	2	8	311525	311532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008639	TTGC	2	8	311537	311544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_008639	ATG	2	6	311566	311571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008639	GA	4	8	311615	311622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008639	TG	3	6	311694	311699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008639	GA	3	6	311759	311764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008639	CGA	2	6	311921	311926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_008639	AGC	2	6	311960	311965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_008639	AATAA	2	10	311999	312008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008639	ACT	2	6	312068	312073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_008639	TTCA	2	8	312463	312470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_008639	TCAGG	2	10	312518	312527	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1052	NC_008639	TGA	2	6	314513	314518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008639	ATT	2	6	314522	314527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008639	ATT	2	6	314573	314578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008639	GCA	2	6	314614	314619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_008639	GTT	2	6	314639	314644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008639	TGA	2	6	314652	314657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008639	CCT	2	6	314668	314673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_008639	AAAG	2	8	314751	314758	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008639	TCTG	2	8	314764	314771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_008639	AG	3	6	314809	314814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008639	GCAG	2	8	314900	314907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_008639	TAAA	2	8	314942	314949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008639	ACC	3	9	315388	315396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_008639	AGA	2	6	315932	315937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008639	TG	3	6	316267	316272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008639	CA	3	6	316287	316292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_008639	GGA	2	6	316895	316900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008639	CCT	2	6	316935	316940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_008639	A	7	7	317073	317079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008639	GGT	2	6	317086	317091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008639	GGCT	2	8	318051	318058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_008639	TTGAT	2	10	318149	318158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008639	GTT	2	6	319225	319230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008639	A	6	6	319259	319264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008639	TGAC	2	8	319283	319290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_008639	ACG	2	6	319291	319296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_008639	ATAAA	2	10	319331	319340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008639	G	8	8	319380	319387	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008639	TAA	2	6	319960	319965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008639	TAC	2	6	320061	320066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_008639	TGAG	2	8	320261	320268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008639	CCT	2	6	320274	320279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_008639	GAG	2	6	320285	320290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008639	ATGC	2	8	320311	320318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_008639	ATCCGT	2	12	320343	320354	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_008639	TGTTT	2	10	320367	320376	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008639	TG	3	6	320397	320402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008639	AGGA	2	8	320467	320474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008639	GTT	2	6	320492	320497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008639	TGT	2	6	320560	320565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008639	A	6	6	320626	320631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008639	TAT	2	6	320640	320645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008639	TATG	2	8	320724	320731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008639	AGA	2	6	323628	323633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008639	A	7	7	323746	323752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008639	TGA	2	6	323870	323875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008639	TGTT	2	8	323932	323939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008639	GCT	2	6	323951	323956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_008639	TG	3	6	323994	323999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008639	CGAA	2	8	324054	324061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_008639	TC	3	6	324070	324075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_008639	TCT	2	6	324079	324084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008639	CT	3	6	324120	324125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_008639	AATT	2	8	324163	324170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008639	TTGT	2	8	324209	324216	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008639	AAC	2	6	324324	324329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_008639	AATT	2	8	324411	324418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008639	CTA	2	6	324490	324495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_008639	A	7	7	324554	324560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008639	T	7	7	324585	324591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008639	AT	3	6	328669	328674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008639	AATA	2	8	328684	328691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008639	T	7	7	328718	328724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008639	GTT	2	6	328746	328751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008639	ATG	2	6	328779	328784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008639	TCA	2	6	328795	328800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008639	GA	3	6	328830	328835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008639	CTT	2	6	328872	328877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_008639	TTC	2	6	328898	328903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008639	GCAG	2	8	328964	328971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_008639	CTC	2	6	331802	331807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_008639	A	6	6	333419	333424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008639	AAAAC	2	10	336708	336717	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_008639	AT	3	6	336722	336727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008639	AAT	2	6	336731	336736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008639	GGT	2	6	336785	336790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008639	A	6	6	337633	337638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008639	GGA	2	6	337691	337696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008639	TTATA	2	10	337752	337761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008639	T	6	6	337807	337812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008639	GTT	2	6	337833	337838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008639	A	7	7	337869	337875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008639	TTA	2	6	337879	337884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008639	TTTA	2	8	337897	337904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_008639	TTA	2	6	338005	338010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008639	AACGC	2	10	338043	338052	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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