MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 10751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008639	AGG	2	6	1576321	1576326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_008639	CGA	2	6	1577461	1577466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_008639	A	6	6	1577497	1577502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_008639	TGA	2	6	1577532	1577537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_008639	CGGA	2	8	1577555	1577562	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_008639	GCA	2	6	1577617	1577622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_008639	GC	3	6	1577629	1577634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_008639	TCCG	2	8	1577933	1577940	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_008639	TGCT	2	8	1579070	1579077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_008639	GCA	2	6	1579093	1579098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_008639	AT	3	6	1579118	1579123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_008639	GTAAC	2	10	1579782	1579791	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5013	NC_008639	TCC	2	6	1579834	1579839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_008639	GA	3	6	1579942	1579947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_008639	GTAA	2	8	1579961	1579968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008639	GTAA	2	8	1580008	1580015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008639	ATT	3	9	1580042	1580050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008639	ACT	2	6	1581064	1581069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_008639	A	6	6	1581078	1581083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_008639	ATA	2	6	1581090	1581095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_008639	TTAC	2	8	1581111	1581118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_008639	AGT	2	6	1581156	1581161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008639	ATT	2	6	1581191	1581196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_008639	CATA	2	8	1581211	1581218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_008639	ATT	2	6	1581398	1581403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_008639	ATT	2	6	1581412	1581417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_008639	TAA	2	6	1584532	1584537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008639	CAA	2	6	1584594	1584599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_008639	ATTT	2	8	1584643	1584650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008639	TGA	2	6	1584686	1584691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_008639	AAG	2	6	1584709	1584714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_008639	TC	3	6	1584775	1584780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_008639	ATTA	2	8	1584799	1584806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_008639	CTT	2	6	1584807	1584812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_008639	AGG	2	6	1584816	1584821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_008639	ATT	2	6	1584829	1584834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008639	T	7	7	1584833	1584839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_008639	TCG	2	6	1584853	1584858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_008639	TAT	2	6	1584892	1584897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_008639	GCAAT	2	10	1587005	1587014	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5041	NC_008639	ATC	2	6	1587056	1587061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_008639	TTTA	2	8	1587084	1587091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008639	ACA	2	6	1587102	1587107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_008639	CAT	2	6	1587126	1587131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_008639	GAA	2	6	1590339	1590344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_008639	A	6	6	1590397	1590402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_008639	A	7	7	1599110	1599116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_008639	CTT	2	6	1599649	1599654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_008639	GC	3	6	1599687	1599692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_008639	ATC	2	6	1599722	1599727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_008639	TCT	2	6	1599751	1599756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_008639	TCCG	2	8	1599781	1599788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_008639	TCA	2	6	1599806	1599811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_008639	GAG	2	6	1599826	1599831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008639	TTGA	2	8	1601193	1601200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_008639	AT	3	6	1601231	1601236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_008639	A	7	7	1601239	1601245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_008639	TCTGA	2	10	1601724	1601733	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5059	NC_008639	ATC	2	6	1601758	1601763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_008639	GAT	2	6	1601789	1601794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_008639	ATGTT	2	10	1601796	1601805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_008639	AGA	2	6	1601823	1601828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_008639	AAACG	2	10	1601843	1601852	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5064	NC_008639	CGTTT	2	10	1601866	1601875	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5065	NC_008639	CCT	2	6	1602238	1602243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_008639	TAA	2	6	1602382	1602387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_008639	TAA	2	6	1602431	1602436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_008639	CATT	2	8	1602443	1602450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_008639	CAA	2	6	1602485	1602490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_008639	CT	3	6	1602506	1602511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_008639	CAG	2	6	1602602	1602607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_008639	A	6	6	1602948	1602953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_008639	CAT	2	6	1602983	1602988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_008639	CCT	2	6	1602991	1602996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_008639	CTG	2	6	1603024	1603029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_008639	TCG	2	6	1603031	1603036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_008639	AACA	2	8	1603058	1603065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5078	NC_008639	A	9	9	1603076	1603084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_008639	TGC	2	6	1603095	1603100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_008639	GAA	2	6	1603149	1603154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_008639	TGC	2	6	1603158	1603163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_008639	GAA	2	6	1605617	1605622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_008639	CAG	2	6	1605633	1605638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008639	T	6	6	1605692	1605697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008639	TCA	2	6	1605756	1605761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_008639	GTTT	2	8	1605766	1605773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_008639	AGCGGA	2	12	1605779	1605790	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5088	NC_008639	A	7	7	1605852	1605858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_008639	GAA	2	6	1607278	1607283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_008639	T	6	6	1607287	1607292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008639	ATG	2	6	1607310	1607315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_008639	CG	3	6	1607327	1607332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_008639	T	7	7	1608969	1608975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_008639	AGA	2	6	1608992	1608997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_008639	A	7	7	1609035	1609041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_008639	T	6	6	1609046	1609051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_008639	A	7	7	1609065	1609071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_008639	T	9	9	1609085	1609093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008639	GGA	2	6	1609130	1609135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_008639	T	6	6	1609679	1609684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008639	T	8	8	1611761	1611768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_008639	CAA	2	6	1611780	1611785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_008639	TC	3	6	1612034	1612039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_008639	T	6	6	1612051	1612056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_008639	AAT	2	6	1612067	1612072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_008639	T	7	7	1612213	1612219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_008639	GGCT	2	8	1612229	1612236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_008639	AC	3	6	1612252	1612257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_008639	ATG	2	6	1612418	1612423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_008639	GAACA	2	10	1612558	1612567	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5111	NC_008639	TTG	2	6	1612703	1612708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_008639	TATAA	2	10	1612720	1612729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_008639	T	9	9	1612752	1612760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008639	AATA	2	8	1612783	1612790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008639	T	7	7	1612811	1612817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_008639	ATTT	2	8	1612829	1612836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008639	TTCT	2	8	1612864	1612871	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_008639	A	7	7	1613118	1613124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_008639	TC	3	6	1613133	1613138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_008639	T	8	8	1613145	1613152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_008639	GCA	2	6	1613162	1613167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_008639	TCAA	3	12	1613178	1613189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_008639	A	7	7	1613494	1613500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_008639	CAA	2	6	1613547	1613552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_008639	CGCT	2	8	1613575	1613582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_008639	A	6	6	1613607	1613612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_008639	CTC	2	6	1614535	1614540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_008639	A	6	6	1614598	1614603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_008639	CAG	2	6	1614617	1614622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_008639	CAAT	2	8	1614631	1614638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_008639	A	8	8	1614688	1614695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_008639	CAG	2	6	1614757	1614762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_008639	TCA	2	6	1614783	1614788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5157	NC_008639	CTCTTC	2	12	1618278	1618289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5161	NC_008639	GTT	2	6	1618662	1618667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5255	NC_008639	A	7	7	1630854	1630860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_008639	TGA	2	6	1631191	1631196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_008639	A	6	6	1631214	1631219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_008639	AGA	2	6	1631254	1631259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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