MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 3224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008610	AAC	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008610	TAA	2	6	1374	1379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008610	TAA	5	15	1507	1521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008610	ATT	2	6	2718	2723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008610	CAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008610	ATA	2	6	2843	2848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008610	TAC	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008610	ATT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008610	TTA	2	6	6484	6489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008610	CAA	2	6	6518	6523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008610	TAC	2	6	6663	6668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008610	ATG	2	6	6733	6738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008610	TAT	2	6	10332	10337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008610	ATT	3	9	10355	10363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008610	ATT	2	6	11148	11153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008610	AAT	2	6	11188	11193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008610	ATT	3	9	11923	11931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008610	TAA	3	9	11938	11946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008610	ATT	2	6	19956	19961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008610	AAG	2	6	20240	20245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008610	GAT	2	6	21180	21185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008610	CAC	2	6	21398	21403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008610	TGT	2	6	21532	21537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008610	ATG	2	6	21613	21618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008610	CTG	2	6	21800	21805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008610	ATT	2	6	21832	21837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008610	ATA	2	6	21880	21885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008610	ATT	2	6	22005	22010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008610	AAT	2	6	22013	22018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008610	GTT	2	6	22027	22032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008610	TTG	2	6	22041	22046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008610	GAC	2	6	22121	22126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008610	AGT	2	6	22147	22152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008610	ATT	2	6	25308	25313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008610	TAA	2	6	25321	25326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008610	TTA	2	6	27406	27411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008610	GTT	2	6	27445	27450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008610	TTA	2	6	27468	27473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008610	GCA	2	6	27503	27508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008610	ATG	2	6	27597	27602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008610	TTA	2	6	27606	27611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008610	TAA	2	6	27680	27685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008610	TAT	2	6	27690	27695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008610	TAA	2	6	27699	27704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008610	ATT	2	6	27791	27796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008610	ACA	2	6	31938	31943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008610	TAA	2	6	32040	32045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008610	TAG	2	6	32249	32254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008610	ACA	2	6	32414	32419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008610	AAG	2	6	32471	32476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008610	TAC	2	6	32484	32489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008610	AGT	2	6	32543	32548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008610	TCA	2	6	32549	32554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008610	AGT	2	6	32587	32592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008610	TAC	2	6	32647	32652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008610	TGA	2	6	32659	32664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008610	ATT	2	6	32778	32783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008610	GAC	2	6	32908	32913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008610	GTG	2	6	32935	32940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008610	ATA	2	6	33002	33007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008610	ATA	2	6	33022	33027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008610	ATA	2	6	33160	33165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008610	CTA	2	6	33170	33175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008610	CAG	2	6	33218	33223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008610	AGA	2	6	33277	33282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008610	AGT	2	6	33286	33291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008610	GCA	2	6	33312	33317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008610	CTG	2	6	33362	33367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008610	ATT	2	6	33486	33491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008610	TGA	2	6	33553	33558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008610	TTA	2	6	33675	33680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008610	TTC	2	6	33685	33690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008610	TAT	2	6	33892	33897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008610	TTC	2	6	33937	33942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008610	GAA	2	6	34055	34060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008610	TGA	2	6	34070	34075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008610	TAT	2	6	34126	34131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008610	GCA	2	6	34137	34142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008610	ATT	2	6	34228	34233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008610	TTG	2	6	34256	34261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008610	TAT	2	6	35117	35122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008610	AAT	2	6	36791	36796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008610	AAT	2	6	36849	36854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008610	TTA	2	6	37102	37107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008610	TTA	2	6	38112	38117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008610	AAT	2	6	39105	39110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008610	TAT	2	6	39134	39139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008610	AAT	2	6	39154	39159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008610	ACA	2	6	39188	39193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008610	TAA	2	6	42047	42052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008610	TAT	2	6	42074	42079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008610	ATT	3	9	43588	43596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008610	ATT	2	6	43603	43608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008610	ATT	2	6	46823	46828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008610	TAT	2	6	46836	46841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008610	TAT	2	6	47863	47868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008610	TTA	2	6	47875	47880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008610	TTA	2	6	47887	47892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008610	TAA	2	6	48143	48148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008610	ATT	2	6	48149	48154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008610	ATG	3	9	48171	48179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008610	ATG	2	6	48258	48263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008610	AAG	2	6	48281	48286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008610	AGT	2	6	48348	48353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008610	TGA	3	9	48376	48384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008610	AAT	2	6	48391	48396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008610	TAA	2	6	48455	48460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008610	GTA	2	6	48479	48484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008610	TAT	2	6	48535	48540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008610	CTA	2	6	48683	48688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008610	TGT	2	6	48740	48745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008610	TGA	2	6	48849	48854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008610	CTA	2	6	48874	48879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008610	ACA	2	6	48894	48899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008610	GTT	2	6	48902	48907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008610	ATA	2	6	48977	48982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008610	TTA	3	9	49035	49043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008610	CAT	2	6	49079	49084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008610	TAT	2	6	49135	49140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008610	ATC	2	6	49141	49146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008610	TAT	2	6	49184	49189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008610	GTG	2	6	49212	49217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008610	ATT	2	6	49318	49323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008610	CCA	2	6	53339	53344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_008610	ATT	2	6	53414	53419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008610	TAT	2	6	53481	53486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008610	ATT	3	9	53514	53522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008610	CTC	2	6	53568	53573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_008610	TAA	2	6	53679	53684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008610	GTA	2	6	53704	53709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008610	TAA	2	6	53781	53786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008610	TAT	2	6	53887	53892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008610	TTA	2	6	53978	53983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008610	ATT	2	6	54024	54029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008610	GAT	2	6	54132	54137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008610	GAT	2	6	57769	57774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008610	AAT	2	6	57844	57849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008610	TCA	2	6	57860	57865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008610	ATT	2	6	57893	57898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008610	AGT	2	6	57963	57968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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