MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 6213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008610	AAAC	2	8	202424	202431	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_008610	AC	3	6	202430	202435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_008610	ACT	2	6	205523	205528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_008610	GGT	2	6	205564	205569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008610	GAT	2	6	205625	205630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008610	AGC	2	6	205664	205669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008610	GAA	2	6	205728	205733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008610	TTA	2	6	205747	205752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008610	TATATG	2	12	205758	205769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008610	AGTG	2	8	205794	205801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008610	TTG	2	6	205820	205825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008610	GT	3	6	205832	205837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008610	T	6	6	205837	205842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008610	GTT	2	6	205869	205874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008610	CT	3	6	205936	205941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_008610	TAAAA	2	10	205942	205951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008610	TAA	2	6	206009	206014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008610	ATA	2	6	206061	206066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008610	ATT	2	6	206069	206074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008610	TTA	2	6	206145	206150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008610	TAA	2	6	206215	206220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008610	ATG	2	6	206222	206227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008610	TCT	2	6	206336	206341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_008610	A	6	6	206354	206359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008610	GGGA	2	8	206424	206431	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008610	TAT	2	6	206438	206443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008610	TATT	2	8	206485	206492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008610	TTTAT	2	10	206545	206554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008610	TGG	2	6	206566	206571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008610	TAG	2	6	206703	206708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008610	TA	3	6	206722	206727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008610	ATC	2	6	206827	206832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_008610	T	7	7	206857	206863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008610	TTA	2	6	206894	206899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008610	CTAT	2	8	206906	206913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_008610	TAA	2	6	206994	206999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008610	A	6	6	207043	207048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008610	ATT	2	6	207092	207097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_008610	A	7	7	207123	207129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008610	TGA	3	9	207177	207185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008610	ATT	2	6	207202	207207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008610	TAAT	2	8	207280	207287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008610	TAG	2	6	207321	207326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008610	GAT	2	6	207375	207380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008610	TAAAA	2	10	207413	207422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008610	A	6	6	207432	207437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008610	TAAT	2	8	207459	207466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008610	TAT	2	6	207497	207502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008610	TTG	2	6	207535	207540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008610	TAG	2	6	207570	207575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008610	AGT	2	6	207589	207594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008610	CA	3	6	207602	207607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_008610	ATT	2	6	207632	207637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008610	T	6	6	207636	207641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008610	TTAA	2	8	207652	207659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008610	TAC	2	6	207720	207725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_008610	GAT	2	6	207762	207767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008610	TAA	2	6	207792	207797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008610	T	7	7	207799	207805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008610	CAC	2	6	207816	207821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_008610	T	6	6	207868	207873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008610	TAA	2	6	207945	207950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008610	GCA	2	6	207959	207964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_008610	ATAA	2	8	207967	207974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008610	ATT	2	6	208005	208010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008610	AT	3	6	208032	208037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008610	TAA	2	6	208049	208054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008610	TTA	2	6	208078	208083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008610	ATC	2	6	208089	208094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_008610	CAC	2	6	208113	208118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_008610	GAT	2	6	208135	208140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008610	TCA	2	6	208149	208154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_008610	AAAT	2	8	208163	208170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008610	GTTT	2	8	208180	208187	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008610	TGAT	2	8	208235	208242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008610	T	6	6	208244	208249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008610	TACA	2	8	208252	208259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_008610	TTG	2	6	208267	208272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008610	CT	3	6	208324	208329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_008610	ATT	2	6	208331	208336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008610	A	6	6	208339	208344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008610	GAT	2	6	208378	208383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008610	CATT	2	8	208426	208433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_008610	AAT	2	6	208447	208452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008610	TAA	2	6	208463	208468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008610	TATT	2	8	208518	208525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008610	TAT	2	6	208592	208597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008610	AATA	2	8	208604	208611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008610	TGG	2	6	208646	208651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008610	ATT	2	6	208653	208658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008610	A	6	6	208679	208684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008610	A	6	6	208714	208719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008610	GAC	2	6	208739	208744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008610	CAA	2	6	208767	208772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_008610	A	6	6	208775	208780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008610	ATGA	2	8	208843	208850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008610	AT	3	6	208881	208886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008610	AAT	2	6	208979	208984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008610	AAAT	2	8	208985	208992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008610	TG	4	8	209010	209017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008610	ATTT	2	8	209094	209101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008610	AAGC	2	8	209114	209121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_008610	TAT	2	6	209535	209540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008610	T	6	6	209557	209562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008610	CAT	2	6	209563	209568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008610	T	6	6	210678	210683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008610	GTAA	2	8	210711	210718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008610	CTT	2	6	210742	210747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008610	T	6	6	210776	210781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008610	AAC	2	6	210811	210816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008610	T	6	6	210828	210833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008610	ATTA	2	8	210844	210851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008610	ATTT	2	8	210855	210862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008610	TGA	2	6	210863	210868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008610	AGCA	2	8	210919	210926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_008610	TATTG	2	10	210982	210991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008610	TCTT	2	8	210995	211002	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_008610	T	6	6	211001	211006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008610	A	7	7	211011	211017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008610	TAT	2	6	211025	211030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008610	ACT	2	6	211054	211059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_008610	AAG	2	6	211146	211151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008610	CTT	2	6	211159	211164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_008610	TATCT	2	10	211178	211187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_008610	AATTA	2	10	211199	211208	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008610	TTA	2	6	211330	211335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008610	TGCA	2	8	211350	211357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_008610	AAT	2	6	211367	211372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008610	TTA	2	6	211453	211458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008610	TAAG	2	8	211460	211467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008610	ATTTA	2	10	211486	211495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008610	GTTA	2	8	211509	211516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008610	TAA	2	6	211541	211546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008610	T	6	6	211596	211601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008610	AAT	2	6	211627	211632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_008610	T	6	6	211632	211637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_008610	ATTT	2	8	211692	211699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_008610	AAC	2	6	276079	276084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_008610	ATC	2	6	276197	276202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1443	NC_008610	TTA	2	6	281916	281921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_008610	ATT	2	6	281977	281982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_008610	AAT	2	6	282145	282150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_008610	TTA	2	6	282215	282220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_008610	ATT	2	6	282231	282236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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