MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40 chromosome

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008599	TAAAAA	2	12	1409	1420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008599	TTTAAT	2	12	21968	21979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008599	AATTTA	2	12	22028	22039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008599	TTTAAA	2	12	33298	33309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008599	ATTTAA	2	12	50321	50332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008599	TTAAAT	2	12	58200	58211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008599	TAAATT	2	12	64502	64513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008599	TATAGT	2	12	77223	77234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008599	ATATTT	2	12	114894	114905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008599	TTTAAA	2	12	131093	131104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008599	ATAAAA	2	12	164040	164051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008599	TTGTAT	2	12	170966	170977	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008599	CTAAAT	2	12	176079	176090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008599	TGTTTT	2	12	186994	187005	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008599	TTATAT	2	12	209412	209423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008599	TAAATT	2	12	225343	225354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008599	AAATTA	2	12	225355	225366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008599	AAAAAT	2	12	225460	225471	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008599	TTAAAA	2	12	231167	231178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008599	ATTTAA	2	12	232602	232613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008599	CTGATG	2	12	251731	251742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008599	CCAAAT	2	12	252039	252050	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008599	ATTTCA	2	12	269106	269117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008599	TTAAAT	2	12	277135	277146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008599	ATTTAA	2	12	282683	282694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008599	ATTAAA	2	12	282776	282787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008599	TAAATT	2	12	319578	319589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008599	TAAATT	2	12	319640	319651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008599	TTTAAT	2	12	325122	325133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008599	ATTTAA	2	12	368043	368054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008599	TTTAAA	2	12	369548	369559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008599	ATTCCC	2	12	395132	395143	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008599	AAATAT	2	12	396029	396040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008599	AATTTA	2	12	403165	403176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008599	TTTAAA	2	12	446522	446533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008599	TTTAAA	2	12	452062	452073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008599	TAGTGA	2	12	456469	456480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008599	CAAATG	2	12	457983	457994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008599	TCCTAT	2	12	458909	458920	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008599	GTTTGA	2	12	459791	459802	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008599	TTTAAA	2	12	516654	516665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008599	TTTAAA	2	12	529810	529821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008599	TTTAAA	2	12	532514	532525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008599	AGTTTA	2	12	553113	553124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008599	TAAATT	2	12	646130	646141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008599	TTTAAA	2	12	654808	654819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008599	GCTTTT	2	12	679320	679331	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008599	ATATAA	2	12	701173	701184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008599	TTTAAA	2	12	718764	718775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008599	TTTAAA	2	12	764465	764476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008599	AAATTT	2	12	767226	767237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008599	TGAAAA	2	12	777953	777964	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008599	AAAAAT	2	12	803716	803727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008599	TCAAAT	2	12	804017	804028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008599	GGAATT	2	12	804538	804549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008599	ATATTT	2	12	825980	825991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008599	TTTAAA	2	12	878422	878433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008599	CTTTAA	2	12	914697	914708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008599	AAATTT	2	12	918020	918031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008599	TAAAAT	2	12	923402	923413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008599	AAAATA	2	12	931027	931038	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008599	TAAATT	2	12	958661	958672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008599	AATTTT	2	12	958751	958762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008599	ACTCAA	2	12	976588	976599	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008599	AAGTAA	2	12	976721	976732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008599	ATTAAT	2	12	1005952	1005963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008599	TTTAAA	2	12	1006041	1006052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008599	GGAAAC	2	12	1019061	1019072	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008599	TTTAAA	2	12	1029847	1029858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008599	TTAAAT	2	12	1048025	1048036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008599	TTAAAA	2	12	1052946	1052957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008599	AAATTT	2	12	1052977	1052988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008599	TTTATA	2	12	1057566	1057577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008599	TTTAAA	2	12	1069390	1069401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008599	GTCTTT	2	12	1103101	1103112	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008599	ATTTAA	2	12	1120654	1120665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008599	AAAATT	2	12	1120699	1120710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008599	TTTAAA	2	12	1150273	1150284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008599	TTTAAA	2	12	1181044	1181055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008599	TATAAA	2	12	1182140	1182151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008599	GATAAA	2	12	1207296	1207307	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008599	TTTAAA	2	12	1209800	1209811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008599	AAGATT	2	12	1219460	1219471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008599	ATTTAA	2	12	1234693	1234704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008599	TGATAA	2	12	1234715	1234726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008599	AGTTGA	2	12	1234961	1234972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008599	TTAAAT	2	12	1245053	1245064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008599	CTATAA	2	12	1267350	1267361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008599	TTTAAA	2	12	1271015	1271026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008599	TATTTT	2	12	1287768	1287779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008599	TAATTA	2	12	1289876	1289887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008599	TAAAAC	2	12	1292925	1292936	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008599	AAATTT	2	12	1301429	1301440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008599	TGAATT	2	12	1301934	1301945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008599	ATTTAA	2	12	1339861	1339872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008599	TTAAAT	2	12	1339876	1339887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008599	TTTAAA	2	12	1348242	1348253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008599	ATTAAT	2	12	1386700	1386711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008599	CTATAT	2	12	1389441	1389452	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008599	CAAAAG	2	12	1406783	1406794	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008599	TTTTAA	2	12	1432221	1432232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008599	TTAAAT	2	12	1436082	1436093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008599	TTTAAT	2	12	1436171	1436182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008599	ATTTTA	2	12	1436664	1436675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008599	TTAAAT	2	12	1442670	1442681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008599	ATTTAA	2	12	1497298	1497309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008599	TTTAAA	2	12	1510116	1510127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008599	TAATTT	2	12	1532070	1532081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008599	AAATTT	2	12	1533528	1533539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008599	TTTAAA	2	12	1533609	1533620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008599	TAAAAA	2	12	1575294	1575305	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008599	TTTGAG	2	12	1578616	1578627	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008599	AAATTA	2	12	1579639	1579650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008599	AAATAA	2	12	1593913	1593924	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008599	ATTTTT	2	12	1603424	1603435	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008599	TTTAAA	2	12	1625294	1625305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008599	TTAAAT	2	12	1633504	1633515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008599	ATTTTA	2	12	1641280	1641291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008599	TAAATT	2	12	1668728	1668739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008599	AGAATG	2	12	1678098	1678109	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008599	TCATTT	2	12	1725632	1725643	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008599	TTTAAA	2	12	1742548	1742559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008599	TAAATT	2	12	1748117	1748128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008599	AAATTT	2	12	1753798	1753809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008599	TTTAAA	2	12	1771359	1771370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.