MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	AAATAA	2	12	11677	11688	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008593	TAAATA	2	12	32887	32898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008593	TAAAAA	2	12	36831	36842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008593	TATAAA	2	12	51832	51843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008593	TTTAAT	2	12	57730	57741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008593	TGAAAT	2	12	60973	60984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008593	TTTACT	2	12	62280	62291	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008593	ATTTAA	2	12	74772	74783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008593	AAAAAG	2	12	79587	79598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008593	TAAAAT	2	12	80459	80470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008593	TTATTT	2	12	115921	115932	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008593	ATAAAT	2	12	117006	117017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008593	ATAAAT	2	12	146541	146552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008593	ACATAT	2	12	150420	150431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008593	ACAAAA	2	12	152080	152091	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008593	TAAGTA	2	12	160119	160130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008593	TTTTTA	2	12	169754	169765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008593	ATTTTT	2	12	175190	175201	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008593	TATTAA	2	12	187893	187904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008593	TGATAT	2	12	188098	188109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008593	TTAAAT	2	12	189404	189415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008593	TGCTTT	2	12	192442	192453	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008593	TTTAAT	2	12	200754	200765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008593	TAAAAT	2	12	230365	230376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008593	GCAGAT	2	12	255563	255574	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008593	CTCAAT	2	12	258851	258862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008593	TAATAT	2	12	259103	259114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008593	TAATAT	2	12	274217	274228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008593	TAAAAA	2	12	320608	320619	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008593	GATTAG	2	12	342541	342552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008593	AAATAA	2	12	344785	344796	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008593	AGTTTA	2	12	458849	458860	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008593	GAGTCA	2	12	525515	525526	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008593	TACATG	2	12	530612	530623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008593	AGTTTA	2	12	549137	549148	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008593	TAAAAT	2	12	549159	549170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008593	TTATAA	2	12	552723	552734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008593	AGTAAA	2	12	575996	576007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008593	ACCTTA	2	12	579722	579733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008593	CTTTTT	2	12	581501	581512	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008593	ATTAAA	2	12	599187	599198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008593	TAAAAA	2	12	636158	636169	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008593	AAAGAA	2	12	643175	643186	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008593	TAAATT	2	12	655204	655215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008593	TTAAAT	2	12	669541	669552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008593	TCTAAT	2	12	669553	669564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008593	TAAATA	2	12	690543	690554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008593	TTGTAT	2	12	724947	724958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008593	TATAAA	2	12	752965	752976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008593	AATAAA	2	12	772769	772780	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008593	AAATAT	2	12	779186	779197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008593	TTAAAT	2	12	787548	787559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008593	AAAATT	2	12	788390	788401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008593	AAAAAC	2	12	798287	798298	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008593	TTATAT	2	12	839923	839934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008593	ATTTGA	2	12	861687	861698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008593	TAATAC	2	12	873333	873344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008593	AAAATT	2	12	880570	880581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008593	TATGGC	2	12	927511	927522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008593	ATTAAA	2	12	942659	942670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008593	ATATTT	2	12	943687	943698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008593	ATACTA	2	12	955787	955798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008593	CCAAAG	2	12	958128	958139	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008593	ATTAAG	2	12	988267	988278	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008593	TAAAAA	2	12	1017385	1017396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008593	ATAAAT	2	12	1021072	1021083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008593	TAAATT	2	12	1037693	1037704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008593	CATTTA	2	12	1039214	1039225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008593	ATTAAA	2	12	1062812	1062823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008593	TTGCAT	2	12	1067286	1067297	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008593	TTTTTA	2	12	1068841	1068852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008593	TAAAAA	2	12	1089425	1089436	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008593	TATAAA	2	12	1151840	1151851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008593	TTTAAA	2	12	1184519	1184530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008593	AATAGC	2	12	1198188	1198199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008593	ATATAA	2	12	1215242	1215253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008593	AAATTA	2	12	1215877	1215888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008593	AAATGA	2	12	1218988	1218999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008593	ATTTAT	2	12	1232221	1232232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008593	AACATA	2	12	1248663	1248674	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008593	AAGTAT	2	12	1255374	1255385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008593	TGAGAT	2	12	1269106	1269117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008593	TGAAAA	2	12	1269651	1269662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008593	TTAAAA	2	12	1284153	1284164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008593	TATAAA	2	12	1287813	1287824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008593	AATATA	2	12	1293670	1293681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008593	TAGTAT	2	12	1300589	1300600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008593	CAAAAC	2	12	1351805	1351816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008593	ATTTTA	2	12	1357735	1357746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008593	AAGTAC	2	12	1361460	1361471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008593	TCCTAG	2	12	1361705	1361716	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008593	TTTAAA	2	12	1387810	1387821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008593	TTTTAA	2	12	1410636	1410647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008593	ATATAA	2	12	1426553	1426564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008593	TGTTTT	2	12	1455298	1455309	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008593	ATTTTT	2	12	1458027	1458038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008593	TTACTT	2	12	1478711	1478722	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008593	AAACCA	2	12	1489579	1489590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008593	TGTTTA	2	12	1497200	1497211	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008593	AAAAAT	2	12	1497278	1497289	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008593	TTTATA	2	12	1500749	1500760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008593	ATACAT	2	12	1502092	1502103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008593	AACTTG	2	12	1508786	1508797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008593	TATATT	2	12	1510639	1510650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008593	TTTTAT	2	12	1535423	1535434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008593	TTTATA	2	12	1536909	1536920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008593	TATTGA	2	12	1539859	1539870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008593	TTAAAT	2	12	1583631	1583642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008593	ATAAAT	2	12	1584531	1584542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008593	TGCAAA	2	12	1600162	1600173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008593	ACAATA	2	12	1600477	1600488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008593	ATTTAT	2	12	1601659	1601670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008593	ATTAAA	2	12	1622411	1622422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008593	TTTAAT	2	12	1628293	1628304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008593	TTTTAT	2	12	1632142	1632153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008593	ATATGT	2	12	1632264	1632275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008593	ACTTTA	2	12	1649117	1649128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_008593	ATTGAT	2	12	1656766	1656777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008593	TCATAT	2	12	1657588	1657599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_008593	TAAATT	2	12	1686576	1686587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008593	CTTTAT	2	12	1728949	1728960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008593	TAAAAA	2	12	1744505	1744516	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008593	ATTTTT	2	12	1755673	1755684	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008593	ATTTAT	2	12	1760667	1760678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008593	AGGATT	2	12	1770008	1770019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008593	ATTTTT	2	12	1770480	1770491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008593	AATATT	2	12	1777899	1777910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008593	TTAAAA	2	12	1785669	1785680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008593	TATACA	2	12	1791050	1791061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_008593	ATTTAC	2	12	1810423	1810434	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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134	NC_008593	TAAATA	2	12	1847201	1847212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008593	TAAAAA	2	12	1852569	1852580	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008593	AATATT	2	12	1853612	1853623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_008593	TTAAAT	2	12	1864655	1864666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_008593	TATAAT	2	12	1920831	1920842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.