MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	TAAAA	2	10	7638	7647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008593	GGTTT	2	10	7671	7680	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008593	TAATA	2	10	20724	20733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008593	ATGTA	2	10	32932	32941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008593	TTATG	2	10	36713	36722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008593	GAAAC	2	10	37066	37075	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008593	TTATA	2	10	41827	41836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008593	AAAGA	2	10	61447	61456	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008593	CAAAA	2	10	62681	62690	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008593	TCTAT	2	10	69003	69012	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008593	TAAAA	2	10	70034	70043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008593	TATAA	2	10	74760	74769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008593	GAAAA	2	10	78406	78415	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008593	TAAAA	2	10	79460	79469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008593	ATGTT	2	10	79547	79556	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008593	TAATA	2	10	79558	79567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008593	TCATA	2	10	82239	82248	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008593	AGGAG	2	10	91126	91135	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008593	ATAAA	2	10	95001	95010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008593	TTTAT	2	10	95034	95043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008593	CTTTT	2	10	97292	97301	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008593	ATATA	2	10	97545	97554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008593	TAGAA	2	10	116064	116073	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008593	ATTTT	2	10	116518	116527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008593	TATTT	2	10	116941	116950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008593	GGTTA	2	10	117560	117569	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008593	TTTAT	2	10	119232	119241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008593	ATTTT	2	10	124496	124505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008593	AAAAG	2	10	125681	125690	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008593	ATATA	2	10	134258	134267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008593	ATAAA	2	10	144433	144442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008593	TAAAA	2	10	150008	150017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008593	TGTTT	2	10	159626	159635	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008593	TAATA	2	10	160165	160174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008593	AAATT	2	10	161918	161927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008593	TAAAA	2	10	167984	167993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008593	ATTTT	2	10	169981	169990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008593	TCGTG	2	10	171297	171306	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008593	TTAAG	2	10	171361	171370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008593	GGGAG	2	10	172463	172472	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008593	TAAGT	2	10	172991	173000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008593	AGATT	2	10	174723	174732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008593	ATTTA	2	10	174976	174985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008593	TTATT	2	10	175275	175284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008593	TAAAT	2	10	177712	177721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008593	TATAT	2	10	192667	192676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008593	TTAAT	2	10	193496	193505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008593	TATGA	2	10	201955	201964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008593	AAATA	2	10	202714	202723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008593	TATTT	2	10	202742	202751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008593	GTGAT	2	10	207589	207598	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008593	ATAAA	2	10	212606	212615	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008593	TACAA	2	10	219426	219435	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008593	TAAAA	2	10	219861	219870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008593	TAAAT	2	10	221725	221734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008593	ATTTA	2	10	233925	233934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008593	ATATA	2	10	233942	233951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008593	AATTA	2	10	235216	235225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008593	CAAAA	2	10	235343	235352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008593	TTTTG	2	10	258879	258888	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008593	TTTAA	2	10	260964	260973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008593	TATAA	2	10	263157	263166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008593	TATAA	2	10	271747	271756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008593	ATATA	2	10	274558	274567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008593	TAAAT	2	10	274572	274581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008593	AAATT	2	10	283262	283271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008593	AATAT	2	10	301355	301364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008593	AAGTA	2	10	306452	306461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008593	ATAGA	2	10	323638	323647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008593	AAATA	2	10	334508	334517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008593	TTATT	2	10	344731	344740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008593	TAATA	2	10	352972	352981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008593	AAAAG	2	10	358157	358166	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008593	GTGTT	2	10	365259	365268	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008593	TTTAA	2	10	366578	366587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008593	TAATT	2	10	376585	376594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008593	ATAAA	2	10	376595	376604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008593	TAAAT	2	10	381187	381196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008593	AGGAG	2	10	392446	392455	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008593	GCAAG	2	10	406243	406252	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008593	ATATA	2	10	406285	406294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008593	ATTTT	2	10	410844	410853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008593	ATAGT	2	10	445449	445458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008593	AAAAG	2	10	450802	450811	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008593	TAGTT	2	10	450849	450858	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008593	AAATA	2	10	451016	451025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008593	ATAAA	2	10	452445	452454	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008593	TTTAA	2	10	458741	458750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008593	TATAT	2	10	464529	464538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008593	TATAA	2	10	475839	475848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008593	ATAAA	2	10	480914	480923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008593	TTAAA	2	10	488112	488121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008593	TAATA	2	10	489484	489493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008593	TATAA	2	10	491865	491874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008593	TAAAA	2	10	492667	492676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008593	AAGAA	2	10	494348	494357	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008593	TTCTT	2	10	494376	494385	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008593	TAAAA	2	10	503644	503653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008593	TTATA	2	10	507845	507854	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008593	TTATT	2	10	507886	507895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008593	AATAA	2	10	511642	511651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008593	TAAGA	2	10	512903	512912	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008593	TTTTA	2	10	513691	513700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008593	ATTAA	2	10	517698	517707	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008593	TTTTA	2	10	521302	521311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008593	TAAAA	2	10	523791	523800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008593	ATTAT	2	10	530344	530353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008593	TAATA	2	10	533383	533392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008593	TAAAT	2	10	534982	534991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008593	CATAT	2	10	538649	538658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008593	AAATA	2	10	538737	538746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008593	TATAA	2	10	538784	538793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008593	GAGGT	2	10	538851	538860	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008593	AATAA	2	10	554142	554151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008593	TAAAA	2	10	565004	565013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008593	TATAT	2	10	567547	567556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008593	GTATG	2	10	569009	569018	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008593	GTGGA	2	10	569042	569051	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008593	TAAAA	2	10	569322	569331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008593	AAGTT	2	10	575300	575309	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008593	ATATA	2	10	575452	575461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008593	ATTTA	2	10	575664	575673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008593	ATGTA	2	10	575772	575781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008593	ATATA	2	10	579425	579434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008593	AATTA	2	10	587981	587990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008593	ATTTC	2	10	588060	588069	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008593	TAAAT	2	10	592440	592449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008593	ATTAT	2	10	593399	593408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008593	AATAT	2	10	595512	595521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008593	ATATA	2	10	600978	600987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008593	TAAAA	2	10	633024	633033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008593	TTATA	2	10	636041	636050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008593	ATTTT	2	10	636786	636795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008593	TAAAT	2	10	640048	640057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008593	TAATT	2	10	643501	643510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008593	TTTTA	2	10	649066	649075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008593	ACATA	2	10	668722	668731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008593	TAAAA	2	10	669469	669478	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008593	TAAAT	2	10	669496	669505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008593	ATTAA	2	10	671692	671701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008593	ATATA	2	10	673170	673179	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008593	TTTGT	2	10	678076	678085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008593	TATAT	2	10	680815	680824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008593	TTTTA	2	10	684902	684911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008593	ATTAT	2	10	695246	695255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008593	ATACA	2	10	695319	695328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008593	AATTA	2	10	700361	700370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008593	AAATC	2	10	700471	700480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_008593	TCTTT	2	10	700540	700549	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_008593	ATTTA	2	10	1365737	1365746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_008593	TTAAA	2	10	2220658	2220667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_008593	CTATA	2	10	2224806	2224815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
495	NC_008593	ATTTA	2	10	2225678	2225687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_008593	TATTT	2	10	2232949	2232958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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