MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 1243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	TAAA	2	8	24	31	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008593	CTTT	2	8	2540	2547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008593	ATAA	2	8	9875	9882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008593	AAAG	2	8	10563	10570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008593	TTTA	2	8	20562	20569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008593	AAAG	2	8	20632	20639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008593	TTTA	2	8	22892	22899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008593	TTTG	2	8	23012	23019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008593	ATAA	2	8	23060	23067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008593	TAAA	2	8	27709	27716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008593	ATTT	2	8	30205	30212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008593	TAAT	2	8	31170	31177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008593	TTAT	2	8	31314	31321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008593	TAAA	2	8	34287	34294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008593	TATT	2	8	34573	34580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008593	TAAT	2	8	35440	35447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008593	ATTA	2	8	36867	36874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008593	TTAA	3	12	37830	37841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008593	AATT	2	8	40001	40008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008593	ATAA	2	8	41817	41824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008593	AAAG	2	8	41848	41855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008593	AAAT	2	8	41859	41866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008593	AGAA	2	8	55095	55102	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008593	TTCT	2	8	55114	55121	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008593	ATTT	2	8	55294	55301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008593	ATAG	2	8	57749	57756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008593	AACA	2	8	61413	61420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008593	TTTA	2	8	62741	62748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008593	AATA	2	8	62863	62870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008593	TAAA	2	8	63007	63014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008593	AGAA	2	8	64037	64044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008593	ATTT	2	8	65330	65337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008593	ATAA	2	8	65424	65431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008593	TAGC	2	8	67958	67965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008593	AAAT	2	8	68462	68469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008593	CTTT	2	8	68982	68989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008593	AAAC	2	8	70005	70012	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008593	GGAT	2	8	70055	70062	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008593	TGTA	2	8	73277	73284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008593	AATT	2	8	73303	73310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008593	AAAC	2	8	74870	74877	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008593	TTTG	2	8	77056	77063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008593	ATTT	2	8	78337	78344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008593	TAAA	2	8	81433	81440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008593	CTTA	2	8	81460	81467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008593	TTAT	2	8	82134	82141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008593	GAAT	2	8	83073	83080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008593	GATA	2	8	83526	83533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008593	GGGA	2	8	87211	87218	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008593	TCCC	2	8	87223	87230	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_008593	AAAG	2	8	87238	87245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008593	TAAA	2	8	107030	107037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008593	ATAA	2	8	107120	107127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008593	TACA	2	8	108315	108322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008593	ATTA	2	8	111410	111417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008593	ATTA	2	8	115249	115256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008593	TATT	2	8	115556	115563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008593	ATTT	2	8	116004	116011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008593	AATT	2	8	117493	117500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008593	GGAA	2	8	117591	117598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008593	TTTG	2	8	125663	125670	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008593	ATCA	2	8	132655	132662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008593	TAAA	2	8	132751	132758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008593	AACA	2	8	132809	132816	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008593	TAGT	2	8	136718	136725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008593	ATTT	2	8	136800	136807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008593	TTAT	2	8	136865	136872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008593	AATA	2	8	145663	145670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008593	GGGA	2	8	150440	150447	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008593	ATTT	2	8	152588	152595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008593	TATT	2	8	155440	155447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008593	AAAT	2	8	155513	155520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008593	TTAA	2	8	160188	160195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008593	ACTG	2	8	163902	163909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008593	TAAA	2	8	166064	166071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008593	ATAA	2	8	166088	166095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008593	ATTT	2	8	169704	169711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008593	TTTG	2	8	169899	169906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008593	AATG	2	8	170153	170160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008593	GAAA	2	8	170178	170185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008593	CTTC	2	8	170329	170336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008593	GTGA	2	8	170657	170664	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008593	AGAA	2	8	172159	172166	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008593	GAAA	2	8	172322	172329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008593	TCGG	2	8	172504	172511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008593	TGCT	2	8	173980	173987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008593	TAAT	2	8	174892	174899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008593	TAAA	2	8	175350	175357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008593	ATAA	2	8	175409	175416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008593	ATTA	2	8	175424	175431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008593	AACA	2	8	175516	175523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008593	CAAA	2	8	177702	177709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008593	GAGT	2	8	185914	185921	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008593	ATTT	2	8	187797	187804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008593	TAGA	2	8	188166	188173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008593	AAAT	2	8	193414	193421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008593	TAAT	2	8	193424	193431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008593	AAAG	2	8	197151	197158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008593	AAAG	2	8	200002	200009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008593	TAGA	2	8	200791	200798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008593	TAAA	2	8	201875	201882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008593	TAAT	2	8	201983	201990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008593	ATTA	2	8	202699	202706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008593	ATTT	2	8	202801	202808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008593	AAAG	2	8	202838	202845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008593	AATA	2	8	207578	207585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008593	ATTA	2	8	210537	210544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008593	AATG	2	8	210569	210576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008593	TAAT	3	12	210582	210593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008593	TTAT	2	8	212676	212683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008593	AATA	2	8	212700	212707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008593	CATG	2	8	216913	216920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008593	ATAA	2	8	217620	217627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008593	ATTA	2	8	217858	217865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008593	GAAA	2	8	219145	219152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008593	AATT	2	8	219178	219185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008593	CGCA	2	8	219495	219502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008593	ATAA	2	8	219842	219849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008593	AACC	2	8	221778	221785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008593	TAAT	2	8	222925	222932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008593	GAAT	2	8	222947	222954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008593	AAAT	2	8	235309	235316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008593	TAAA	2	8	238412	238419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008593	ATCT	2	8	251193	251200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008593	AAAT	2	8	255771	255778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008593	AAAT	2	8	256593	256600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008593	CTTT	2	8	257218	257225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008593	TTTA	2	8	257226	257233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008593	AATT	2	8	259051	259058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008593	AAAC	2	8	263269	263276	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008593	TAAA	2	8	266334	266341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008593	AGAT	2	8	266384	266391	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008593	ACTA	2	8	271915	271922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008593	CTAT	2	8	274092	274099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008593	ATAA	2	8	274477	274484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008593	GAAA	2	8	277414	277421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008593	AATA	2	8	279596	279603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008593	GGAG	2	8	282750	282757	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008593	ATTT	2	8	283322	283329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008593	TTTA	2	8	288803	288810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008593	AATA	2	8	289596	289603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008593	AGTT	2	8	291602	291609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008593	AAAT	2	8	291670	291677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008593	AATA	2	8	301404	301411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008593	GAAA	2	8	303170	303177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008593	AAAT	2	8	303258	303265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008593	AAGT	2	8	303300	303307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008593	TAAA	2	8	303726	303733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008593	GTAA	2	8	309635	309642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008593	TAAT	2	8	313421	313428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008593	ATAA	2	8	316481	316488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_008593	TTGT	2	8	320734	320741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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