MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Solibacter usitatus Ellin6076 chromosome

Total Repeats: 18199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_008536	GAT	2	6	9864878	9864883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18002	NC_008536	GAA	2	6	9864915	9864920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_008536	CAT	2	6	9864951	9864956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_008536	CGG	2	6	9864962	9864967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18005	NC_008536	TGA	2	6	9865064	9865069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_008536	GGC	2	6	9865071	9865076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_008536	GCC	3	9	9865112	9865120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18008	NC_008536	TCGC	2	8	9865122	9865129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18009	NC_008536	GCA	2	6	9865132	9865137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18010	NC_008536	GC	3	6	9865138	9865143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18011	NC_008536	CG	3	6	9865158	9865163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18012	NC_008536	CGG	2	6	9865216	9865221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_008536	CGG	2	6	9865228	9865233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18014	NC_008536	CGC	2	6	9865298	9865303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18015	NC_008536	GGT	2	6	9865361	9865366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_008536	CGG	2	6	9865381	9865386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_008536	CTG	2	6	9865468	9865473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18018	NC_008536	GC	3	6	9865533	9865538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18019	NC_008536	CAT	2	6	9865549	9865554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_008536	CCG	2	6	9865559	9865564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18021	NC_008536	AAT	2	6	9865586	9865591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_008536	AGA	2	6	9865602	9865607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_008536	TGC	2	6	9865642	9865647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18024	NC_008536	CTG	2	6	9865652	9865657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_008536	CGGG	2	8	9865757	9865764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18026	NC_008536	TC	3	6	9865772	9865777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18027	NC_008536	TTG	2	6	9865778	9865783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18028	NC_008536	GGA	2	6	9865815	9865820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_008536	CTG	2	6	9865835	9865840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18030	NC_008536	TC	3	6	9865875	9865880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18032	NC_008536	GAG	2	6	9870453	9870458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_008536	ATG	2	6	9874031	9874036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_008536	GAA	2	6	9874049	9874054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_008536	GCCCG	2	10	9874088	9874097	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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18037	NC_008536	GT	3	6	9874171	9874176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_008536	TC	4	8	9876065	9876072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18039	NC_008536	TCGCG	2	10	9881373	9881382	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18040	NC_008536	C	6	6	9881384	9881389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18041	NC_008536	CAC	2	6	9881402	9881407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18042	NC_008536	GCC	2	6	9881457	9881462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18043	NC_008536	AAG	2	6	9881478	9881483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_008536	GTC	2	6	9881493	9881498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18045	NC_008536	CTA	2	6	9882065	9882070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_008536	CA	3	6	9882174	9882179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18047	NC_008536	CA	3	6	9882187	9882192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18052	NC_008536	TTCG	2	8	9884579	9884586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18055	NC_008536	GCC	2	6	9887619	9887624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18056	NC_008536	CGC	2	6	9887630	9887635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18057	NC_008536	GCC	2	6	9887640	9887645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18058	NC_008536	ACG	2	6	9887695	9887700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_008536	CGAA	2	8	9887742	9887749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18060	NC_008536	CGG	2	6	9889126	9889131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_008536	GGT	2	6	9889148	9889153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_008536	GCC	2	6	9889178	9889183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18063	NC_008536	GAT	2	6	9889206	9889211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_008536	G	6	6	9889261	9889266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_008536	GGC	3	9	9889278	9889286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_008536	CG	4	8	9889302	9889309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18067	NC_008536	C	6	6	9894063	9894068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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18072	NC_008536	CG	3	6	9898069	9898074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18073	NC_008536	T	6	6	9902912	9902917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18089	NC_008536	G	6	6	9911036	9911041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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18101	NC_008536	GATT	2	8	9918226	9918233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_008536	AT	3	6	9918243	9918248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18103	NC_008536	GA	3	6	9921311	9921316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18107	NC_008536	A	7	7	9921432	9921438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18108	NC_008536	G	6	6	9921464	9921469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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18111	NC_008536	TC	3	6	9923566	9923571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18112	NC_008536	CCT	2	6	9923601	9923606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18113	NC_008536	GCAT	2	8	9923657	9923664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18115	NC_008536	GCCT	2	8	9923799	9923806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18116	NC_008536	GCAC	2	8	9923880	9923887	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18117	NC_008536	AGAA	2	8	9923910	9923917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_008536	A	7	7	9928634	9928640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18119	NC_008536	GAA	2	6	9929385	9929390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18121	NC_008536	AGT	2	6	9929854	9929859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18123	NC_008536	GCC	2	6	9929921	9929926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18124	NC_008536	CTG	2	6	9929958	9929963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18125	NC_008536	CGAT	2	8	9929964	9929971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18126	NC_008536	TGC	2	6	9929984	9929989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18127	NC_008536	GCG	2	6	9930011	9930016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.