MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 plasmid pSM101A

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008263	ATTT	2	8	994	1001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008263	AATT	2	8	1106	1113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008263	TATT	2	8	1145	1152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008263	ATTA	2	8	1209	1216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008263	TAAT	2	8	1876	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008263	TTTA	2	8	3772	3779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008263	TTAG	2	8	4550	4557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008263	AGTT	2	8	8457	8464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008263	AATT	2	8	9364	9371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008263	ATTG	2	8	9383	9390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008263	AAGA	2	8	9866	9873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008263	TTGA	2	8	10060	10067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008263	TATT	2	8	10139	10146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008263	GGAA	2	8	10243	10250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008263	TTAA	2	8	10835	10842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008263	AAAT	2	8	11929	11936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008263	TATT	2	8	12210	12217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008263	TTTA	2	8	12267	12274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.