MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 1066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008262	TTATT	2	10	1684	1693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008262	TAAAT	2	10	3006	3015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008262	ATTTT	2	10	3069	3078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008262	ATATA	2	10	9640	9649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008262	ATATA	2	10	9709	9718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008262	AGGAG	2	10	10625	10634	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008262	TCGTG	2	10	11034	11043	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008262	TAATT	2	10	11611	11620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008262	ACATA	2	10	11989	11998	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008262	GGGAG	2	10	12214	12223	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008262	TAAGT	2	10	12740	12749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008262	TAAAT	2	10	14603	14612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008262	TTTTA	2	10	16117	16126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008262	GCTTC	2	10	23145	23154	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008262	TAAAA	2	10	23599	23608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008262	TAATT	2	10	23779	23788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008262	AATAA	2	10	42222	42231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008262	TATAA	2	10	43055	43064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008262	TTAAA	2	10	48001	48010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008262	TTTTA	2	10	49432	49441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008262	AGATA	2	10	52810	52819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008262	TTTTA	2	10	55243	55252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008262	TAAAA	2	10	56864	56873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008262	ATAAA	2	10	56889	56898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008262	AGGAG	2	10	64518	64527	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008262	AAAGA	2	10	65909	65918	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008262	AAATT	2	10	70773	70782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008262	ATCAT	2	10	70810	70819	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008262	GATAG	2	10	74377	74386	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008262	AATAT	2	10	75210	75219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008262	TAAAT	2	10	75318	75327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008262	AGGAG	2	10	76200	76209	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008262	TCGTG	2	10	76609	76618	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008262	TAATT	2	10	77186	77195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008262	ACATA	2	10	77564	77573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008262	GGGAG	2	10	77789	77798	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008262	TAAGT	2	10	78315	78324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008262	TAAAT	2	10	80178	80187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008262	CTCTC	2	10	82075	82084	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_008262	ATTAA	2	10	85405	85414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008262	AGGAG	2	10	86487	86496	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008262	TCGTG	2	10	86896	86905	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008262	TAATT	2	10	87473	87482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008262	GGGAG	2	10	88076	88085	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008262	TAAGT	2	10	88602	88611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008262	TAAAT	2	10	90465	90474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008262	TATAA	2	10	91062	91071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008262	TTATA	2	10	91452	91461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008262	ATTTA	2	10	104730	104739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008262	AAAAC	2	10	107559	107568	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008262	AGGAG	2	10	108523	108532	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008262	TCGTG	2	10	108932	108941	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008262	TAATT	2	10	109509	109518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008262	ACATA	2	10	109887	109896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008262	GGGAG	2	10	110112	110121	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008262	TAAGT	2	10	110638	110647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008262	TAAAT	2	10	112501	112510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008262	TTAAG	2	10	114410	114419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008262	TATTT	2	10	114931	114940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008262	AAAGA	2	10	117144	117153	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008262	AGGAG	2	10	118306	118315	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008262	TCGTG	2	10	118715	118724	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008262	TAATT	2	10	119292	119301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008262	ACATA	2	10	119670	119679	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008262	GGGAG	2	10	119895	119904	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008262	TAAGT	2	10	120421	120430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008262	TAAAT	2	10	122284	122293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008262	AAGTT	2	10	122683	122692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008262	ATTTA	2	10	125541	125550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008262	TTAAA	2	10	125580	125589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008262	CTATA	2	10	127413	127422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008262	CTATA	2	10	127431	127440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008262	ATTTT	2	10	129557	129566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008262	TATAA	2	10	129877	129886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008262	TTTTA	2	10	130698	130707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008262	TTAAA	2	10	132049	132058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008262	TATAA	2	10	132127	132136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008262	ATTTT	2	10	135100	135109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008262	TAATG	2	10	135142	135151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008262	ATTTA	2	10	137023	137032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008262	ATTTT	2	10	140082	140091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008262	ATTAA	2	10	149179	149188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008262	TTAGT	2	10	149499	149508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008262	ATAAA	2	10	152479	152488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008262	AAGGG	2	10	153676	153685	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008262	TTTGA	2	10	155382	155391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008262	AAAAT	2	10	158361	158370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008262	AGCTT	2	10	159762	159771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008262	TAATA	2	10	160129	160138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008262	TAAGC	2	10	161471	161480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008262	TATAA	2	10	170195	170204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008262	TTTAA	2	10	179523	179532	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008262	AAATT	2	10	180529	180538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008262	AATGT	2	10	181189	181198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008262	ATTTT	2	10	181343	181352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008262	ATTTT	2	10	187250	187259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008262	ATTCT	2	10	188272	188281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008262	AATTT	2	10	188285	188294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008262	AAAAG	2	10	188620	188629	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008262	TTAAT	2	10	188652	188661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008262	GAAAT	2	10	199010	199019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008262	ATTTT	2	10	203359	203368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008262	AAAGT	2	10	203493	203502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008262	GTGAG	2	10	207427	207436	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008262	ATATT	2	10	213385	213394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008262	TTTTA	2	10	218271	218280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008262	ATATT	2	10	219330	219339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008262	TTAAT	2	10	220412	220421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008262	TTAAA	2	10	221332	221341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008262	TTTAA	2	10	223376	223385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008262	ATGCA	2	10	223592	223601	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008262	AATAT	2	10	223756	223765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008262	TAAAA	2	10	224056	224065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008262	ATTAA	2	10	226812	226821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008262	ATTAA	2	10	229456	229465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008262	ATTAA	2	10	233092	233101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008262	GATAA	2	10	233115	233124	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008262	TAAAA	2	10	233205	233214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008262	AGGAG	2	10	233953	233962	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008262	TCGTG	2	10	234362	234371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008262	TAATT	2	10	234939	234948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008262	ACATA	2	10	235317	235326	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008262	GGGAG	2	10	235542	235551	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008262	TAAGT	2	10	236068	236077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008262	TAAAT	2	10	237931	237940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008262	TTTTA	2	10	238160	238169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008262	TAATT	2	10	238293	238302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008262	ATATT	2	10	238688	238697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008262	ATATA	2	10	239478	239487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008262	AATAA	2	10	239537	239546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008262	AATAA	2	10	239555	239564	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008262	ATAAA	2	10	239628	239637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008262	TTTAG	2	10	240283	240292	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008262	TAAAA	2	10	240466	240475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008262	AATAT	2	10	241111	241120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008262	CTTTT	2	10	241194	241203	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_008262	ATTTT	2	10	241295	241304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008262	TAATA	2	10	242392	242401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008262	TTTCT	2	10	245227	245236	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008262	TATAT	2	10	245402	245411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008262	ATATA	2	10	245556	245565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008262	TAAAT	2	10	251624	251633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008262	ATTTA	2	10	251648	251657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008262	ATTTT	2	10	252545	252554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008262	TAATA	2	10	252841	252850	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008262	TAAAA	2	10	259130	259139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008262	AGTTT	2	10	265119	265128	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008262	ATATA	2	10	273326	273335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008262	AGAAA	2	10	274335	274344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008262	ACTAA	2	10	274618	274627	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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