MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 17609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008262	AT	3	6	227664	227669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_008262	TAA	2	6	227672	227677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_008262	A	6	6	227676	227681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_008262	AAAT	2	8	227694	227701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_008262	T	6	6	227749	227754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_008262	AGA	2	6	229358	229363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_008262	TTC	2	6	229373	229378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_008262	T	6	6	229393	229398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_008262	A	6	6	229432	229437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_008262	ATTAA	2	10	229456	229465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_008262	ATA	2	6	229493	229498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_008262	CTT	2	6	229511	229516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_008262	ATTA	2	8	229520	229527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_008262	TTG	2	6	230412	230417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_008262	TAAT	2	8	230502	230509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_008262	AT	4	8	230511	230518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_008262	TAA	2	6	230523	230528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_008262	AAT	2	6	230531	230536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_008262	ATT	2	6	230548	230553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_008262	TAAT	2	8	230566	230573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_008262	TAAA	2	8	230581	230588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_008262	A	7	7	230586	230592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_008262	AT	3	6	231835	231840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_008262	CAA	2	6	231865	231870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_008262	A	7	7	231903	231909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_008262	ATTT	2	8	231926	231933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2028	NC_008262	TTTA	2	8	231974	231981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_008262	TAA	2	6	232003	232008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_008262	AT	3	6	232009	232014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_008262	TAC	2	6	232048	232053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_008262	AAT	2	6	232059	232064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_008262	AAG	2	6	232779	232784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_008262	TATT	2	8	232792	232799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_008262	AT	3	6	232828	232833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_008262	TATT	2	8	232837	232844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_008262	A	6	6	232849	232854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_008262	TA	4	8	232867	232874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_008262	T	6	6	232918	232923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_008262	AT	3	6	232937	232942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_008262	ATA	2	6	232949	232954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_008262	TTTG	2	8	232989	232996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_008262	TA	3	6	233018	233023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_008262	AGTA	2	8	233030	233037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_008262	ATA	3	9	233058	233066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_008262	AG	3	6	233082	233087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_008262	ATTAA	2	10	233092	233101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2049	NC_008262	CAA	2	6	233147	233152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_008262	A	6	6	233172	233177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_008262	GTT	2	6	233178	233183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_008262	CTT	2	6	233191	233196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_008262	TAAAA	2	10	233205	233214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_008262	A	6	6	233211	233216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_008262	AGA	2	6	233259	233264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_008262	GGC	2	6	233357	233362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_008262	GCG	2	6	233415	233420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_008262	CAT	3	9	233510	233518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_008262	TGG	2	6	233571	233576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2062	NC_008262	GCA	2	6	233709	233714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_008262	CGC	2	6	233716	233721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2064	NC_008262	GTGA	2	8	233722	233729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_008262	AGG	2	6	233785	233790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_008262	CAG	2	6	233812	233817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_008262	GAT	2	6	233881	233886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2070	NC_008262	GAA	2	6	234004	234009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_008262	CT	3	6	234028	234033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2072	NC_008262	GCC	2	6	234147	234152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2073	NC_008262	GAA	2	6	234265	234270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_008262	GGT	2	6	234339	234344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_008262	GTC	2	6	234353	234358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2076	NC_008262	TCGTG	2	10	234362	234371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2082	NC_008262	AC	3	6	234684	234689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2083	NC_008262	AGG	2	6	234743	234748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2091	NC_008262	AGAA	2	8	235237	235244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_008262	TAG	2	6	235258	235263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_008262	GCGA	2	8	235266	235273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2094	NC_008262	ACATA	2	10	235317	235326	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2097	NC_008262	TAC	2	6	235485	235490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2099	NC_008262	GGGAG	2	10	235542	235551	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_008262	TGA	2	6	235606	235611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_008262	GGA	2	6	235781	235786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_008262	TC	3	6	235868	235873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2103	NC_008262	AGT	2	6	235905	235910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_008262	TAAGT	2	10	236068	236077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_008262	AGC	2	6	236124	236129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_008262	CATT	2	8	236130	236137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2107	NC_008262	GA	3	6	236165	236170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_008262	ACC	2	6	236203	236208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2109	NC_008262	CGT	2	6	236248	236253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2111	NC_008262	AGG	2	6	236487	236492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_008262	GT	3	6	236496	236501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_008262	GCTA	2	8	236502	236509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2114	NC_008262	AG	4	8	236635	236642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_008262	AGT	2	6	236644	236649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2117	NC_008262	GAG	2	6	236679	236684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_008262	CGG	2	6	236698	236703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_008262	CGG	2	6	236926	236931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_008262	TGG	2	6	237176	237181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_008262	ACC	2	6	237197	237202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2122	NC_008262	GGC	2	6	237226	237231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_008262	CCT	2	6	237285	237290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2124	NC_008262	GGT	2	6	237421	237426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2126	NC_008262	CGT	2	6	237616	237621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_008262	GAG	2	6	237665	237670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_008262	GTT	2	6	237719	237724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_008262	GAA	2	6	237840	237845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_008262	TAAAT	2	10	237931	237940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_008262	TGA	2	6	238047	238052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_008262	ACG	2	6	238088	238093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_008262	TG	3	6	238132	238137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_008262	GGT	2	6	238146	238151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_008262	TTTTA	2	10	238160	238169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_008262	CCA	2	6	238241	238246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2138	NC_008262	TAATT	2	10	238293	238302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2418	NC_008262	TAT	2	6	275244	275249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2419	NC_008262	TA	3	6	275251	275256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2420	NC_008262	TCC	2	6	276626	276631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2431	NC_008262	T	6	6	280802	280807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2432	NC_008262	AAGTA	2	10	280816	280825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2434	NC_008262	TAA	2	6	280839	280844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2435	NC_008262	AAT	2	6	280849	280854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2437	NC_008262	AT	3	6	280885	280890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2444	NC_008262	GAAA	2	8	282232	282239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2445	NC_008262	A	6	6	282242	282247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2448	NC_008262	T	6	6	282275	282280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2449	NC_008262	TAT	2	6	282302	282307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2450	NC_008262	AATAAA	2	12	282308	282319	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2451	NC_008262	A	8	8	282317	282324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2452	NC_008262	CGA	2	6	282396	282401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2457	NC_008262	TAT	2	6	282495	282500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2464	NC_008262	TATT	2	8	283559	283566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2478	NC_008262	ATTT	2	8	285968	285975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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