MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 17609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_008262	TAC	2	6	2874730	2874735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_008262	TA	4	8	2874741	2874748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17503	NC_008262	AT	5	10	2874767	2874776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17504	NC_008262	AT	4	8	2874808	2874815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17505	NC_008262	A	6	6	2874833	2874838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17506	NC_008262	TTTA	2	8	2874847	2874854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_008262	A	6	6	2874881	2874886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17508	NC_008262	AAAT	2	8	2874892	2874899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17509	NC_008262	TCC	2	6	2876821	2876826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17510	NC_008262	TAAATA	2	12	2879252	2879263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17511	NC_008262	TCC	2	6	2880268	2880273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17512	NC_008262	TCCC	2	8	2880602	2880609	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17513	NC_008262	TAT	2	6	2880622	2880627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17514	NC_008262	TTTAT	2	10	2880633	2880642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17515	NC_008262	T	7	7	2880646	2880652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17516	NC_008262	TAG	2	6	2880708	2880713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_008262	TAA	2	6	2880739	2880744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_008262	CA	3	6	2880767	2880772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17519	NC_008262	TCT	2	6	2880780	2880785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17520	NC_008262	TAA	2	6	2880795	2880800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17521	NC_008262	ACT	2	6	2880802	2880807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17522	NC_008262	ATT	2	6	2880819	2880824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17523	NC_008262	ATA	2	6	2880825	2880830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17524	NC_008262	AT	3	6	2880836	2880841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_008262	A	7	7	2880845	2880851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17526	NC_008262	CCT	2	6	2881133	2881138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17527	NC_008262	ACC	2	6	2881612	2881617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17528	NC_008262	CCT	2	6	2881916	2881921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17529	NC_008262	TAGCA	2	10	2881945	2881954	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17530	NC_008262	TTA	2	6	2882006	2882011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_008262	ATTT	2	8	2882033	2882040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17532	NC_008262	T	6	6	2882038	2882043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17533	NC_008262	CCT	2	6	2882273	2882278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17534	NC_008262	TAAAA	2	10	2882280	2882289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17535	NC_008262	TA	3	6	2882292	2882297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17536	NC_008262	AAAT	2	8	2883183	2883190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_008262	TCC	2	6	2883434	2883439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17538	NC_008262	TAT	3	9	2883456	2883464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_008262	AT	3	6	2883463	2883468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_008262	TA	3	6	2883475	2883480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_008262	TATAA	2	10	2883533	2883542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_008262	AAC	2	6	2883560	2883565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17543	NC_008262	TAA	2	6	2886500	2886505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17544	NC_008262	AGG	2	6	2886515	2886520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17545	NC_008262	T	6	6	2887144	2887149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17546	NC_008262	TTG	2	6	2887164	2887169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_008262	GTT	2	6	2887235	2887240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17548	NC_008262	TCT	2	6	2887258	2887263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17549	NC_008262	ATC	2	6	2887774	2887779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17550	NC_008262	TAT	2	6	2889510	2889515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_008262	AT	3	6	2889514	2889519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_008262	TACAT	2	10	2889523	2889532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17553	NC_008262	GAT	2	6	2889540	2889545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_008262	A	6	6	2889563	2889568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17555	NC_008262	A	6	6	2889571	2889576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17556	NC_008262	AT	3	6	2889617	2889622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_008262	TTA	2	6	2889623	2889628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17558	NC_008262	T	6	6	2889629	2889634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_008262	TCC	2	6	2890425	2890430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17560	NC_008262	ATTT	2	8	2890452	2890459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_008262	TAA	2	6	2890460	2890465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_008262	CTA	2	6	2890475	2890480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17563	NC_008262	A	6	6	2890480	2890485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17564	NC_008262	T	6	6	2890536	2890541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17565	NC_008262	TCA	2	6	2892491	2892496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17566	NC_008262	CTC	2	6	2893882	2893887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17567	NC_008262	CAA	2	6	2893932	2893937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17568	NC_008262	ATT	2	6	2893966	2893971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17569	NC_008262	A	7	7	2893978	2893984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17570	NC_008262	TTAC	2	8	2894012	2894019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17571	NC_008262	AATT	2	8	2894035	2894042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17572	NC_008262	A	7	7	2894059	2894065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17573	NC_008262	TAA	2	6	2894229	2894234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_008262	TAT	2	6	2894286	2894291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17575	NC_008262	T	6	6	2894311	2894316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17576	NC_008262	CAA	2	6	2894325	2894330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17577	NC_008262	ACT	2	6	2894348	2894353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17578	NC_008262	A	7	7	2894407	2894413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17579	NC_008262	CAC	2	6	2895070	2895075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17580	NC_008262	CCT	2	6	2895826	2895831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17581	NC_008262	TA	3	6	2895844	2895849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17582	NC_008262	T	6	6	2896425	2896430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17583	NC_008262	T	6	6	2896656	2896661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17584	NC_008262	AT	3	6	2896773	2896778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17585	NC_008262	ATA	2	6	2896781	2896786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17586	NC_008262	ATTAA	2	10	2896798	2896807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17587	NC_008262	TAA	2	6	2896818	2896823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17588	NC_008262	A	6	6	2896828	2896833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17589	NC_008262	TA	3	6	2896834	2896839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17590	NC_008262	TAT	2	6	2896845	2896850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17591	NC_008262	CTAT	2	8	2896859	2896866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17592	NC_008262	TTA	2	6	2896882	2896887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17593	NC_008262	TCA	2	6	2896894	2896899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17594	NC_008262	ACTAAT	2	12	2896904	2896915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17595	NC_008262	TTTA	2	8	2896931	2896938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17596	NC_008262	TAGA	2	8	2896944	2896951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17597	NC_008262	TA	3	6	2896964	2896969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17598	NC_008262	TAA	2	6	2896985	2896990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17599	NC_008262	AACTT	2	10	2896994	2897003	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17600	NC_008262	ATAA	2	8	2897033	2897040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17601	NC_008262	TTA	2	6	2897048	2897053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17602	NC_008262	TAT	2	6	2897068	2897073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17603	NC_008262	TTA	2	6	2897104	2897109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17604	NC_008262	TAT	2	6	2897137	2897142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17605	NC_008262	AT	3	6	2897178	2897183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17606	NC_008262	CTAAAT	2	12	2897214	2897225	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17607	NC_008262	AAC	2	6	2897340	2897345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17608	NC_008262	AAT	2	6	2897361	2897366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17609	NC_008262	TAT	2	6	2897384	2897389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.