MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 17609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008262	AGG	2	6	118138	118143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008262	CAG	2	6	118165	118170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_008262	GAT	2	6	118234	118239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008262	TGC	2	6	118275	118280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_008262	AGGAG	2	10	118306	118315	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008262	GAA	2	6	118357	118362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008262	CT	3	6	118381	118386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_008262	GCC	2	6	118500	118505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_008262	GAA	2	6	118618	118623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008262	GGT	2	6	118692	118697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008262	GTC	2	6	118706	118711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008262	TCGTG	2	10	118715	118724	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_008262	GTTA	2	8	118765	118772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008262	AGG	2	6	118817	118822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008262	ATC	2	6	118842	118847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008262	AC	3	6	118869	118874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_008262	AG	3	6	118894	118899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008262	AC	3	6	119037	119042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_008262	AGG	2	6	119096	119101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008262	CCT	2	6	119178	119183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_008262	ATA	2	6	119231	119236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008262	GA	3	6	119252	119257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008262	TC	3	6	119261	119266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_008262	TAATT	2	10	119292	119301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008262	ACA	2	6	119309	119314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_008262	GGA	2	6	119582	119587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008262	AGAA	2	8	119590	119597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008262	TAG	2	6	119611	119616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008262	GCGA	2	8	119619	119626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_008262	ACATA	2	10	119670	119679	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_008262	AAG	2	6	119753	119758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008262	ACC	2	6	119819	119824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_008262	TAC	2	6	119838	119843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008262	TGA	2	6	119845	119850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008262	GGGAG	2	10	119895	119904	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008262	TGA	2	6	119959	119964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008262	GGA	2	6	120134	120139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008262	TC	3	6	120221	120226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_008262	AGT	2	6	120258	120263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008262	TAAGT	2	10	120421	120430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008262	AGC	2	6	120477	120482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_008262	CATT	2	8	120483	120490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_008262	GA	3	6	120518	120523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008262	ACC	2	6	120556	120561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_008262	CGT	2	6	120601	120606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_008262	TTA	2	6	120819	120824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008262	AGG	2	6	120840	120845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008262	GT	3	6	120849	120854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008262	GCTA	2	8	120855	120862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_008262	AG	4	8	120988	120995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008262	AGT	2	6	120997	121002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008262	AGGT	2	8	121024	121031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008262	GAG	2	6	121032	121037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008262	CGG	2	6	121051	121056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_008262	CGG	2	6	121279	121284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_008262	TGG	2	6	121529	121534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008262	ACC	2	6	121550	121555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_008262	GGC	2	6	121579	121584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008262	CCT	2	6	121638	121643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_008262	GGT	2	6	121774	121779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008262	TCG	2	6	121889	121894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008262	CGT	2	6	121969	121974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008262	GAG	2	6	122018	122023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008262	GTT	2	6	122072	122077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008262	GAA	2	6	122193	122198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008262	TAAAT	2	10	122284	122293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008262	TGA	2	6	122335	122340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008262	ACG	2	6	122376	122381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008262	TG	3	6	122420	122425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008262	GGT	2	6	122434	122439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008262	TGG	2	6	122472	122477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008262	GAG	2	6	122523	122528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008262	T	7	7	122532	122538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008262	TTA	2	6	122551	122556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008262	AAG	2	6	122557	122562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008262	T	6	6	122574	122579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008262	T	6	6	122588	122593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008262	T	7	7	122595	122601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008262	TAA	2	6	122612	122617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008262	ATT	2	6	122628	122633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008262	AAAG	2	8	122641	122648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008262	TTA	2	6	122662	122667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008262	AAGTT	2	10	122683	122692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008262	A	6	6	122761	122766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008262	ATA	2	6	122775	122780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008262	T	6	6	122781	122786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008262	AT	3	6	122798	122803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008262	AT	3	6	122808	122813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008262	T	7	7	122817	122823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008262	AGTTTA	2	12	122900	122911	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008262	TA	4	8	122915	122922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008262	TA	3	6	122943	122948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008262	ATTTAA	2	12	122991	123002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008262	AGT	2	6	123042	123047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008262	TA	3	6	123057	123062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008262	TTA	2	6	123069	123074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008262	TACTAA	2	12	123106	123117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1098	NC_008262	GGT	2	6	123130	123135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008262	AGA	2	6	123182	123187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008262	A	7	7	125353	125359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008262	TAA	2	6	125371	125376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008262	TAT	2	6	125386	125391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008262	A	7	7	125404	125410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008262	TGA	2	6	125444	125449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008262	A	7	7	125452	125458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008262	TA	3	6	125459	125464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008262	T	6	6	125477	125482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008262	TTA	2	6	125497	125502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008262	ATTTA	2	10	125541	125550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008262	ATT	2	6	125557	125562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008262	TTAAA	2	10	125580	125589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008262	AAT	2	6	125594	125599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008262	AAT	2	6	125612	125617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008262	TTATAT	2	12	125645	125656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008262	TA	3	6	125664	125669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008262	ATA	2	6	125952	125957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008262	T	6	6	125961	125966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_008262	ATAA	2	8	125969	125976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008262	TA	3	6	125986	125991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008262	GTAC	2	8	126025	126032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_008262	TAAA	2	8	126058	126065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008262	ATT	2	6	126066	126071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008262	ATA	2	6	126097	126102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008262	AAG	2	6	126136	126141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008262	T	6	6	126183	126188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008262	TA	3	6	127145	127150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008262	T	7	7	127182	127188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008262	AT	3	6	127189	127194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008262	AAT	2	6	127258	127263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008262	A	7	7	127274	127280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008262	ATT	2	6	127353	127358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008262	TA	3	6	127369	127374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008262	TA	3	6	127382	127387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008262	CTATA	2	10	127413	127422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_008262	CTATA	2	10	127431	127440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1136	NC_008262	ATT	2	6	127460	127465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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