MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 18279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008261	A	6	6	187020	187025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008261	GGT	2	6	187043	187048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008261	ATT	2	6	187057	187062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008261	ATTT	2	8	187072	187079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008261	AAT	2	6	187084	187089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008261	A	6	6	187101	187106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008261	TAA	2	6	187131	187136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008261	ATA	2	6	187162	187167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008261	GAT	2	6	187195	187200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_008261	AAT	2	6	187208	187213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008261	T	7	7	187229	187235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008261	A	6	6	187272	187277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008261	CTATAA	2	12	188908	188919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1514	NC_008261	ATTT	2	8	188920	188927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008261	TAA	2	6	188954	188959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008261	A	7	7	188963	188969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008261	ATT	2	6	188994	188999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_008261	AT	3	6	191081	191086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_008261	TAA	2	6	191116	191121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008261	A	6	6	191123	191128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008261	T	6	6	191160	191165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008261	TTTTTA	2	12	191196	191207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008261	T	7	7	191215	191221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_008261	A	7	7	191238	191244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008261	TAT	2	6	191254	191259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008261	TTA	2	6	191260	191265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008261	AAG	2	6	191289	191294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_008261	T	6	6	191358	191363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008261	ATT	2	6	191370	191375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008261	CAT	2	6	191387	191392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1532	NC_008261	ATTA	2	8	191406	191413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008261	AT	3	6	191429	191434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008261	ATA	2	6	191473	191478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008261	T	6	6	191479	191484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_008261	TTG	2	6	191542	191547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1543	NC_008261	A	8	8	192900	192907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_008261	ATGT	2	8	192934	192941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008261	AGG	2	6	192958	192963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008261	ATC	2	6	193998	194003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1548	NC_008261	ATT	2	6	194025	194030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1550	NC_008261	TAT	2	6	194062	194067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008261	TGC	2	6	194071	194076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_008261	TAA	2	6	194085	194090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008261	AAAAT	2	10	195553	195562	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008261	AG	3	6	195571	195576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1556	NC_008261	AT	4	8	196562	196569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_008261	TA	3	6	196583	196588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_008261	CATA	2	8	196590	196597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_008261	AATA	2	8	197112	197119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008261	TAAT	2	8	197145	197152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008261	A	6	6	197161	197166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1565	NC_008261	T	6	6	197270	197275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008261	GAA	2	6	197287	197292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_008261	T	7	7	197339	197345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008261	AAT	3	9	197360	197368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008261	TTA	2	6	197383	197388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008261	A	7	7	197396	197402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1572	NC_008261	ATA	2	6	197421	197426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_008261	ATT	2	6	197429	197434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_008261	A	6	6	197449	197454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_008261	A	6	6	197477	197482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_008261	TA	3	6	197585	197590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_008261	ATT	2	6	197594	197599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1585	NC_008261	TAAAAA	2	12	201622	201633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1587	NC_008261	TAA	2	6	201690	201695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_008261	GTA	2	6	201758	201763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_008261	GTT	2	6	202192	202197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_008261	ATT	2	6	202221	202226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1604	NC_008261	TTTA	2	8	202255	202262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_008261	TAA	2	6	202280	202285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_008261	A	6	6	202920	202925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_008261	AT	3	6	202935	202940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008261	AATA	2	8	202951	202958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008261	TAA	2	6	205057	205062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1611	NC_008261	TTTAAA	2	12	205574	205585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008261	ACT	2	6	205599	205604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_008261	TCT	2	6	205641	205646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_008261	A	6	6	205653	205658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_008261	ATT	2	6	205662	205667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_008261	TTAT	2	8	205695	205702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_008261	TAT	3	9	205700	205708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1619	NC_008261	T	6	6	205754	205759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_008261	GAT	2	6	205791	205796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008261	ATTA	3	12	205822	205833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_008261	AATA	2	8	205842	205849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008261	TA	3	6	205857	205862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008261	AT	3	6	205872	205877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008261	AAG	2	6	205897	205902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008261	AGG	2	6	206934	206939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_008261	TAT	2	6	206983	206988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_008261	TTTA	2	8	207030	207037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008261	CAT	2	6	207040	207045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_008261	TA	3	6	207063	207068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_008261	T	6	6	207083	207088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_008261	TTA	2	6	207156	207161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_008261	TA	3	6	207243	207248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_008261	CCT	2	6	209920	209925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_008261	AAT	2	6	209937	209942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_008261	TTA	2	6	210006	210011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_008261	TA	3	6	210101	210106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_008261	ATA	3	9	210146	210154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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