MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 18279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008261	GAAA	2	8	72376	72383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008261	T	6	6	72397	72402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008261	A	7	7	72403	72409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008261	TGA	2	6	72430	72435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008261	AAG	2	6	72443	72448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008261	AGA	2	6	72490	72495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008261	GGC	2	6	72588	72593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008261	GCG	2	6	72646	72651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008261	CAT	3	9	72741	72749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_008261	TGG	2	6	72802	72807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008261	CGA	2	6	72826	72831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_008261	GCA	2	6	72900	72905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_008261	GCA	2	6	72940	72945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_008261	CGC	2	6	72947	72952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_008261	GTGA	2	8	72953	72960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008261	AGG	2	6	73016	73021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008261	CAG	2	6	73043	73048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008261	GAT	2	6	73112	73117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008261	TGC	2	6	73153	73158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008261	AGGAG	2	10	73184	73193	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008261	GAA	2	6	73235	73240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008261	CT	3	6	73259	73264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_008261	GCC	2	6	73378	73383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_008261	GAA	2	6	73496	73501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008261	GGT	2	6	73570	73575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008261	GTC	2	6	73584	73589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_008261	TCGTG	2	10	73593	73602	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
528	NC_008261	GTTA	2	8	73643	73650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008261	AGG	2	6	73695	73700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008261	ATC	2	6	73720	73725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_008261	AC	3	6	73747	73752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_008261	AG	3	6	73772	73777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008261	AC	3	6	73915	73920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_008261	AGG	2	6	73974	73979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008261	CCT	2	6	74056	74061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_008261	GAT	2	6	74091	74096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008261	ATA	2	6	74109	74114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008261	GA	3	6	74130	74135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008261	TC	3	6	74139	74144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_008261	TAATT	2	10	74170	74179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008261	ACA	2	6	74187	74192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_008261	GGA	2	6	74460	74465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008261	AGAA	2	8	74468	74475	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008261	TAG	2	6	74489	74494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008261	GCGA	2	8	74497	74504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
546	NC_008261	ACC	2	6	74697	74702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_008261	TAC	2	6	74716	74721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008261	TGA	2	6	74723	74728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008261	GGGAG	2	10	74773	74782	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008261	TGA	2	6	74837	74842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008261	GGA	2	6	75012	75017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008261	TC	3	6	75099	75104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_008261	AGT	2	6	75136	75141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008261	TAAGT	2	10	75299	75308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008261	AGC	2	6	75355	75360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_008261	CATT	2	8	75361	75368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_008261	GA	3	6	75396	75401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008261	ACC	2	6	75434	75439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_008261	CGT	2	6	75479	75484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_008261	TTA	2	6	75697	75702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008261	AGG	2	6	75718	75723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008261	GT	3	6	75727	75732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008261	GCTA	2	8	75733	75740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_008261	AG	4	8	75866	75873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008261	AGT	2	6	75875	75880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008261	AGGT	2	8	75902	75909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008261	GAG	2	6	75910	75915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_008261	CGG	2	6	76157	76162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_008261	TGG	2	6	76407	76412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008261	ACC	2	6	76428	76433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_008261	GGC	2	6	76457	76462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_008261	TAAAT	2	10	77162	77171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_008261	AT	3	6	77446	77451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_008261	TA	3	6	77568	77573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008261	AT	3	6	77595	77600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_008261	TTA	2	6	79102	79107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_008261	A	7	7	79155	79161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_008261	TAA	2	6	79290	79295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_008261	A	6	6	79335	79340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008261	A	6	6	79367	79372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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615	NC_008261	TA	3	6	79564	79569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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624	NC_008261	TAAAA	2	10	81214	81223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_008261	TA	3	6	81934	81939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008261	TAAA	2	8	81952	81959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008261	A	7	7	81957	81963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008261	T	7	7	81967	81973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_008261	CAA	2	6	82210	82215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_008261	A	6	6	82234	82239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008261	GTT	2	6	82240	82245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_008261	AGA	2	6	82321	82326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_008261	GGC	2	6	82419	82424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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