MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 11182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008255	CAA	2	6	1161589	1161594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008255	T	6	6	1162012	1162017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008255	GAAAAG	2	12	1164348	1164359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008255	TTA	2	6	1164858	1164863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008255	A	6	6	1164915	1164920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008255	TAA	2	6	1164944	1164949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008255	GAA	2	6	1164989	1164994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008255	A	6	6	1165047	1165052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008255	TAT	2	6	1165555	1165560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008255	T	6	6	1165563	1165568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_008255	TAA	2	6	1165574	1165579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008255	CTTT	2	8	1165583	1165590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_008255	CAT	2	6	1165614	1165619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_008255	GTT	2	6	1165634	1165639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008255	T	7	7	1165668	1165674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008255	TA	3	6	1165700	1165705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008255	A	8	8	1165713	1165720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008255	T	6	6	1166652	1166657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008255	TTA	2	6	1166689	1166694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_008255	TAA	2	6	1166755	1166760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008255	TAA	2	6	1166762	1166767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008255	A	6	6	1169767	1169772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_008255	T	7	7	1169777	1169783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008255	CTT	2	6	1169807	1169812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_008255	ACT	2	6	1169877	1169882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_008255	AT	3	6	1172835	1172840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_008255	ACC	2	6	1172844	1172849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_008255	AC	3	6	1172969	1172974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_008255	GA	3	6	1172993	1172998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008255	T	7	7	1173066	1173072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008255	TTAAT	2	10	1173076	1173085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_008255	GAT	2	6	1173103	1173108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008255	TAT	3	9	1173226	1173234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008255	TA	3	6	1178064	1178069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008255	A	6	6	1183516	1183521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008255	ATT	2	6	1183531	1183536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008255	A	8	8	1188126	1188133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_008255	A	6	6	1188859	1188864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_008255	T	6	6	1193479	1193484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_008255	TGC	2	6	1193487	1193492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_008255	ATT	2	6	1200112	1200117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_008255	TGA	2	6	1200145	1200150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_008255	CGC	2	6	1200185	1200190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_008255	A	7	7	1200209	1200215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008255	T	6	6	1200254	1200259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_008255	AGCGTT	2	12	1200274	1200285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3047	NC_008255	CGC	2	6	1200287	1200292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_008255	GAA	2	6	1200296	1200301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008255	CCG	2	6	1200325	1200330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_008255	CGG	2	6	1200331	1200336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_008255	AATAA	2	10	1200354	1200363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008255	TATT	2	8	1200456	1200463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008255	CTA	2	6	1200487	1200492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_008255	TA	3	6	1200495	1200500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008255	TAA	2	6	1204498	1204503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008255	CAAT	2	8	1207494	1207501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_008255	TAA	2	6	1207833	1207838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008255	A	8	8	1207837	1207844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008255	ATAA	2	8	1207869	1207876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_008255	GGGCAG	2	12	1209363	1209374	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3061	NC_008255	TTTA	2	8	1209816	1209823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008255	AATT	2	8	1209845	1209852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_008255	CAAA	2	8	1209930	1209937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_008255	T	7	7	1210154	1210160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_008255	TTTA	2	8	1210188	1210195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008255	A	6	6	1210195	1210200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008255	ACA	2	6	1210224	1210229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_008255	AG	3	6	1210249	1210254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008255	GCG	2	6	1210273	1210278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_008255	CT	5	10	1210323	1210332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_008255	AGT	2	6	1210401	1210406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008255	GGT	2	6	1210416	1210421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_008255	CCA	2	6	1210426	1210431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_008255	CA	3	6	1210442	1210447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_008255	TG	3	6	1210509	1210514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_008255	TG	3	6	1210556	1210561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_008255	CAA	2	6	1210584	1210589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_008255	AAACC	2	10	1210605	1210614	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3079	NC_008255	AAT	2	6	1210679	1210684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008255	TA	3	6	1210698	1210703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_008255	AC	3	6	1210815	1210820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_008255	CTC	2	6	1210898	1210903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_008255	T	8	8	1210944	1210951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008255	TTTA	2	8	1211642	1211649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008255	TGA	2	6	1211662	1211667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008255	AGT	2	6	1211681	1211686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008255	TACG	2	8	1211688	1211695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_008255	GTGG	3	12	1211737	1211748	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008255	ACCA	2	8	1211757	1211764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_008255	CAT	2	6	1211800	1211805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_008255	TGGC	2	8	1211837	1211844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_008255	TAAAAA	2	12	1211861	1211872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_008255	A	8	8	1211868	1211875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008255	TGA	2	6	1211885	1211890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_008255	T	6	6	1211923	1211928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008255	A	6	6	1218340	1218345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_008255	T	6	6	1218368	1218373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008255	ATA	2	6	1218461	1218466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_008255	TGGT	2	8	1218472	1218479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008255	CGG	2	6	1218516	1218521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_008255	ACCA	2	8	1218529	1218536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_008255	ATA	2	6	1218570	1218575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008255	TGGT	2	8	1218581	1218588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008255	CGG	2	6	1218625	1218630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_008255	CTC	2	6	1218667	1218672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_008255	T	9	9	1218685	1218693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_008255	T	8	8	1221577	1221584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_008255	TCC	2	6	1221616	1221621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_008255	T	7	7	1221625	1221631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_008255	CTT	2	6	1221636	1221641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_008255	GTTTT	2	10	1221690	1221699	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_008255	T	6	6	1221696	1221701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_008255	TCA	2	6	1221710	1221715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_008255	T	7	7	1223777	1223783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008255	CTT	2	6	1224617	1224622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_008255	ATA	2	6	1225652	1225657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008255	T	7	7	1225686	1225692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_008255	TGC	2	6	1225695	1225700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_008255	TTA	2	6	1225708	1225713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008255	T	6	6	1225730	1225735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008255	CA	3	6	1225766	1225771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_008255	AGT	2	6	1225880	1225885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008255	TG	3	6	1225894	1225899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_008255	TA	3	6	1225939	1225944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_008255	AGT	2	6	1225946	1225951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_008255	TG	3	6	1225960	1225965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_008255	TTG	2	6	1225990	1225995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_008255	GT	3	6	1226623	1226628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_008255	TAA	2	6	1226643	1226648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_008255	AT	4	8	1226673	1226680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008255	GTAT	2	8	1226770	1226777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_008255	A	6	6	1227410	1227415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_008255	ATT	2	6	1227430	1227435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3135	NC_008255	T	7	7	1227604	1227610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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