MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 11182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008255	TTA	2	6	2335212	2335217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_008255	AC	3	6	2335219	2335224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_008255	ACA	2	6	2335878	2335883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_008255	CTGTC	2	10	2335898	2335907	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6005	NC_008255	TAT	2	6	2335966	2335971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_008255	AAT	2	6	2335990	2335995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_008255	TA	4	8	2337257	2337264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_008255	TTGA	2	8	2337278	2337285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_008255	TTTA	2	8	2337817	2337824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_008255	T	6	6	2337830	2337835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_008255	TAAT	2	8	2337852	2337859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_008255	A	7	7	2337867	2337873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_008255	TTC	2	6	2337906	2337911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_008255	TA	3	6	2338494	2338499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_008255	T	7	7	2338510	2338516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_008255	GT	3	6	2338618	2338623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_008255	T	6	6	2339965	2339970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_008255	ATTTTT	2	12	2339971	2339982	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_008255	CTT	2	6	2340066	2340071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_008255	ATT	2	6	2340075	2340080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_008255	CTTAA	2	10	2340087	2340096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6022	NC_008255	ATT	2	6	2340892	2340897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_008255	TTG	2	6	2340948	2340953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_008255	TAT	2	6	2341530	2341535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_008255	AATGA	2	10	2341536	2341545	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6032	NC_008255	TTA	2	6	2346532	2346537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6041	NC_008255	AAC	2	6	2346695	2346700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_008255	GCA	2	6	2348225	2348230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_008255	T	6	6	2349426	2349431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_008255	AAT	2	6	2352364	2352369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_008255	TAA	2	6	2352387	2352392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_008255	TAA	2	6	2352423	2352428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_008255	ATTT	2	8	2352432	2352439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6050	NC_008255	ATT	2	6	2352521	2352526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_008255	AAAT	2	8	2354529	2354536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_008255	T	6	6	2354584	2354589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008255	ATT	2	6	2355114	2355119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_008255	GTT	2	6	2355140	2355145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6058	NC_008255	A	6	6	2355302	2355307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_008255	GGA	2	6	2355308	2355313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6061	NC_008255	TA	4	8	2355337	2355344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_008255	TGT	2	6	2356169	2356174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_008255	CTT	2	6	2357375	2357380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_008255	AAT	2	6	2357393	2357398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_008255	AAAT	2	8	2357429	2357436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_008255	T	7	7	2357448	2357454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_008255	ATT	2	6	2357470	2357475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_008255	TA	3	6	2357478	2357483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6084	NC_008255	CA	3	6	2365575	2365580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_008255	CATTA	2	10	2365582	2365591	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6087	NC_008255	TGCA	2	8	2365620	2365627	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6088	NC_008255	CAG	2	6	2365666	2365671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6093	NC_008255	ATTC	2	8	2366812	2366819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_008255	TGC	3	9	2366868	2366876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6096	NC_008255	GGCG	2	8	2366932	2366939	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_008255	A	7	7	2367063	2367069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6100	NC_008255	CTG	2	6	2367139	2367144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_008255	AGGT	2	8	2367221	2367228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_008255	A	7	7	2367231	2367237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_008255	CTGT	2	8	2367256	2367263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_008255	TCA	2	6	2367272	2367277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6106	NC_008255	T	6	6	2367314	2367319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_008255	CTT	2	6	2367320	2367325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6110	NC_008255	AC	3	6	2367416	2367421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_008255	A	6	6	2367490	2367495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_008255	A	7	7	2367570	2367576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_008255	CA	3	6	2367603	2367608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_008255	GCA	2	6	2367614	2367619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_008255	TGGA	2	8	2367626	2367633	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_008255	TGC	2	6	2367674	2367679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_008255	A	7	7	2367718	2367724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_008255	CTT	2	6	2367734	2367739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_008255	TTC	2	6	2367799	2367804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6121	NC_008255	GAA	2	6	2367970	2367975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6124	NC_008255	TAC	2	6	2368195	2368200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6126	NC_008255	TA	4	8	2369674	2369681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_008255	AAATAA	2	12	2369717	2369728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_008255	TA	3	6	2370931	2370936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_008255	AGC	2	6	2374002	2374007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_008255	T	7	7	2374059	2374065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_008255	TA	3	6	2374087	2374092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_008255	TAT	2	6	2374109	2374114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_008255	GGCA	2	8	2374117	2374124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6403	NC_008255	TCTG	2	8	2486076	2486083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6404	NC_008255	TAT	2	6	2486099	2486104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6405	NC_008255	ATT	2	6	2486108	2486113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6406	NC_008255	TTCAT	2	10	2486130	2486139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6407	NC_008255	CTG	2	6	2486189	2486194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6412	NC_008255	A	6	6	2487464	2487469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6423	NC_008255	TTA	2	6	2492660	2492665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6425	NC_008255	AAG	2	6	2493983	2493988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6427	NC_008255	A	6	6	2494064	2494069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6428	NC_008255	CACC	2	8	2494147	2494154	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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6431	NC_008255	AAAG	2	8	2496089	2496096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6432	NC_008255	CTT	2	6	2496115	2496120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6433	NC_008255	TAAC	2	8	2496128	2496135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6434	NC_008255	AGAACT	2	12	2497214	2497225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6435	NC_008255	T	6	6	2497237	2497242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6436	NC_008255	A	6	6	2497323	2497328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6437	NC_008255	A	8	8	2497432	2497439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6438	NC_008255	AGAT	2	8	2500784	2500791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6439	NC_008255	GAA	2	6	2500810	2500815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6444	NC_008255	TAC	2	6	2500948	2500953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6449	NC_008255	AAAAG	2	10	2502278	2502287	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6463	NC_008255	A	7	7	2506230	2506236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6464	NC_008255	TGTAT	2	10	2506256	2506265	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6465	NC_008255	TA	3	6	2506317	2506322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6500	NC_008255	GATGC	2	10	2520949	2520958	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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