MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chelativorans sp. BNC1 plasmid 3

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008244	TG	3	6	1380	1385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008244	AGC	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008244	A	7	7	1411	1417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008244	GCC	2	6	1480	1485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008244	CGG	2	6	1496	1501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008244	GAA	2	6	12047	12052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008244	T	6	6	12066	12071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008244	GTGC	2	8	12110	12117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008244	CAA	2	6	12158	12163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008244	GAT	2	6	12194	12199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008244	CTG	2	6	12253	12258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008244	GCG	2	6	12275	12280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008244	AGC	2	6	12283	12288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008244	CGG	2	6	13965	13970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008244	CGC	2	6	13971	13976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008244	GAA	2	6	14010	14015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008244	GAGG	2	8	14022	14029	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008244	GGC	2	6	14039	14044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008244	GTA	2	6	14083	14088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008244	CGT	2	6	14445	14450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008244	ACC	2	6	14522	14527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008244	CG	3	6	14532	14537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008244	GAT	2	6	14553	14558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008244	GCC	3	9	14568	14576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_008244	CCA	2	6	14583	14588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008244	CTCCC	2	10	16560	16569	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
27	NC_008244	TA	3	6	16595	16600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008244	TAG	2	6	16605	16610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008244	GCC	2	6	17320	17325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008244	AAG	2	6	17354	17359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008244	AAC	2	6	18030	18035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008244	AGACT	2	10	18139	18148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008244	CTC	2	6	18244	18249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008244	GGCA	2	8	18277	18284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008244	C	6	6	18350	18355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_008244	AGA	2	6	18363	18368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008244	CCG	2	6	18498	18503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008244	AAC	2	6	18554	18559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008244	GACCC	2	10	18560	18569	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_008244	GCCGC	2	10	18601	18610	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_008244	GTT	2	6	18622	18627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008244	GGC	2	6	18698	18703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008244	TC	3	6	18708	18713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008244	ATT	2	6	18732	18737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008244	TGAA	2	8	18770	18777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008244	CT	3	6	21055	21060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008244	GCCG	2	8	22404	22411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008244	CGT	2	6	22421	22426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008244	CAT	2	6	22763	22768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008244	GCC	2	6	22865	22870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008244	CTA	2	6	22875	22880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008244	GCGA	2	8	23547	23554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008244	GAT	2	6	23593	23598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008244	CG	3	6	23627	23632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008244	TTC	2	6	23684	23689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008244	CGC	2	6	23786	23791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008244	CCAC	2	8	23858	23865	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_008244	CAC	2	6	23894	23899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008244	GGCT	2	8	23900	23907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008244	CGA	2	6	23919	23924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008244	GAG	2	6	23958	23963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008244	GGA	2	6	24118	24123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008244	GCC	2	6	24134	24139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008244	GCCG	2	8	25990	25997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008244	CGA	2	6	26021	26026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008244	CCG	2	6	27057	27062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008244	CGC	2	6	27065	27070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008244	GGC	2	6	27077	27082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008244	GAG	2	6	27110	27115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008244	CGGC	2	8	27121	27128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008244	TCA	2	6	27644	27649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008244	CCGG	2	8	27775	27782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008244	AGG	2	6	27833	27838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008244	GA	3	6	27871	27876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008244	CGT	2	6	27892	27897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008244	GCC	2	6	30585	30590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008244	ATC	2	6	30634	30639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008244	GGA	2	6	31097	31102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008244	GC	3	6	32550	32555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008244	CGC	2	6	32564	32569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008244	CGG	2	6	32678	32683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008244	CGT	2	6	32684	32689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008244	CAC	2	6	32742	32747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008244	TGCC	2	8	32761	32768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008244	GCCG	2	8	32861	32868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008244	GA	4	8	32910	32917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008244	TCG	2	6	32927	32932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008244	CT	3	6	32939	32944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008244	GTC	2	6	33403	33408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008244	AGAT	2	8	38800	38807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008244	GCCG	2	8	38872	38879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008244	C	6	6	38938	38943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_008244	CTA	2	6	39011	39016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008244	GGCC	2	8	39038	39045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008244	AGCATC	2	12	40458	40469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008244	AC	3	6	40516	40521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008244	T	6	6	40543	40548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008244	GGC	2	6	40594	40599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008244	CGG	2	6	40610	40615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008244	CGG	2	6	40666	40671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008244	GCG	2	6	40702	40707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008244	GTC	2	6	40740	40745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008244	CAT	2	6	40865	40870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008244	ACG	2	6	41304	41309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008244	CACGT	2	10	41335	41344	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008244	TCG	2	6	41360	41365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008244	CCA	2	6	42939	42944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008244	T	7	7	43579	43585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008244	ATAG	2	8	43672	43679	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008244	CGA	2	6	43711	43716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008244	GATG	2	8	43742	43749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008244	CG	3	6	43785	43790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008244	GAA	2	6	43857	43862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008244	TCGAC	2	10	43916	43925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_008244	CCA	2	6	43935	43940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008244	CTTGCC	2	12	43992	44003	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008244	AAGT	2	8	44019	44026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008244	CGC	2	6	44793	44798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008244	TGG	2	6	44828	44833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008244	CGT	2	6	44906	44911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008244	TCC	2	6	44974	44979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_008244	TCA	2	6	45047	45052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008244	CGA	2	6	45066	45071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008244	AGGA	2	8	45119	45126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008244	TAAAC	2	10	45161	45170	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008244	CGG	2	6	46949	46954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008244	CAT	2	6	46985	46990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008244	AGC	2	6	46997	47002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008244	GGGAG	2	10	47348	47357	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008244	CCT	2	6	47378	47383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.