MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 6083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007974	GC	3	6	178557	178562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_007974	GCA	2	6	178573	178578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_007974	CGG	2	6	178613	178618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_007974	GGTAA	2	10	179404	179413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
505	NC_007974	A	7	7	179455	179461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_007974	TCC	2	6	179954	179959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_007974	CGATGA	2	12	179978	179989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
508	NC_007974	ACGC	2	8	180078	180085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_007974	GCA	2	6	180201	180206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_007974	GTCACA	2	12	180215	180226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_007974	CGG	2	6	180469	180474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_007974	CCG	2	6	180494	180499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_007974	CGC	2	6	182228	182233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_007974	GCC	2	6	182266	182271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_007974	TGC	2	6	182330	182335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_007974	TCG	2	6	183978	183983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_007974	TG	3	6	183998	184003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007974	TGC	2	6	184086	184091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_007974	GGT	2	6	184154	184159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007974	CG	3	6	184195	184200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_007974	GTG	2	6	184225	184230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_007974	CGT	2	6	184261	184266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_007974	GC	3	6	184384	184389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_007974	CCA	2	6	184410	184415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_007974	GAG	2	6	184416	184421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007974	GTC	2	6	185748	185753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_007974	CG	3	6	185761	185766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_007974	GC	3	6	185782	185787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_007974	ATC	2	6	186026	186031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007974	TGC	2	6	186310	186315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_007974	GTG	2	6	186507	186512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007974	GCA	2	6	186527	186532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_007974	AAG	2	6	186534	186539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007974	CGGCCG	2	12	186542	186553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_007974	ACG	2	6	187120	187125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_007974	CATC	2	8	187136	187143	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_007974	GAC	2	6	188131	188136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_007974	GTG	2	6	198469	198474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_007974	TGG	2	6	198488	198493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007974	ATG	2	6	198504	198509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007974	GC	3	6	202790	202795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_007974	GC	3	6	202804	202809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_007974	CG	4	8	202823	202830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_007974	TAA	2	6	202895	202900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007974	GAGG	2	8	202927	202934	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007974	CGA	2	6	202943	202948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_007974	TCCT	2	8	202965	202972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_007974	CGG	2	6	204471	204476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_007974	CGG	2	6	204573	204578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_007974	C	6	6	204606	204611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
551	NC_007974	CAA	2	6	204947	204952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_007974	GAA	2	6	205644	205649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007974	CGAG	2	8	206321	206328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
554	NC_007974	CTC	2	6	207581	207586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_007974	TC	3	6	207585	207590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_007974	GA	3	6	207603	207608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_007974	AGTTTC	2	12	207634	207645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
558	NC_007974	CGT	2	6	207656	207661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007974	GTG	2	6	207683	207688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007974	CGC	2	6	207743	207748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_007974	T	6	6	207750	207755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_007974	GCCC	2	8	208536	208543	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
563	NC_007974	C	6	6	208541	208546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
564	NC_007974	CAG	2	6	209672	209677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_007974	CTG	2	6	209687	209692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_007974	T	9	9	209698	209706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007974	AGAAA	2	10	209723	209732	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
568	NC_007974	TCG	2	6	209745	209750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_007974	AGG	2	6	209779	209784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_007974	T	7	7	210157	210163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_007974	TAA	2	6	210176	210181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_007974	GC	3	6	210243	210248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_007974	TGACG	2	10	210268	210277	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
574	NC_007974	CAT	2	6	210330	210335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_007974	CGT	2	6	210947	210952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_007974	TC	3	6	211969	211974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_007974	GTTGA	2	10	211983	211992	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
578	NC_007974	ATG	2	6	213250	213255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_007974	GAGC	2	8	213270	213277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
580	NC_007974	CGT	2	6	214355	214360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_007974	CG	3	6	214399	214404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_007974	CGCTT	2	10	214417	214426	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
583	NC_007974	CTT	2	6	214440	214445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_007974	GCG	2	6	214447	214452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_007974	A	6	6	214475	214480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_007974	CGC	2	6	214904	214909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_007974	AAT	2	6	214963	214968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_007974	CG	3	6	214997	215002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_007974	GCC	2	6	215015	215020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_007974	CAG	2	6	215128	215133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_007974	GCG	2	6	215152	215157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_007974	AAGT	2	8	215191	215198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007974	TGAT	2	8	215223	215230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_007974	TCG	2	6	215253	215258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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596	NC_007974	CCG	2	6	215338	215343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_007974	ATG	2	6	217273	217278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_007974	GC	4	8	217283	217290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_007974	CAT	2	6	217299	217304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_007974	CG	3	6	219399	219404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_007974	CCG	3	9	219431	219439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_007974	TTCA	2	8	219892	219899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_007974	CTGC	2	8	219905	219912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
604	NC_007974	GCC	2	6	219954	219959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_007974	GCG	2	6	220512	220517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_007974	CG	3	6	220560	220565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_007974	GCGTG	2	10	220575	220584	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
608	NC_007974	GCC	2	6	220586	220591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_007974	AGG	2	6	222310	222315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007974	GGC	2	6	224189	224194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_007974	AAGG	2	8	224200	224207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007974	AGCC	2	8	224236	224243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_007974	TCAG	3	12	225046	225057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_007974	TGC	2	6	225065	225070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_007974	C	6	6	225189	225194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
616	NC_007974	GTA	2	6	225314	225319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_007974	CGT	2	6	225320	225325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_007974	AGC	2	6	225365	225370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_007974	T	7	7	225405	225411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_007974	AGG	2	6	226370	226375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_007974	CG	3	6	226412	226417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_007974	GCG	2	6	228343	228348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_007974	GAC	2	6	228377	228382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_007974	GC	3	6	232559	232564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_007974	AGC	2	6	233712	233717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_007974	ATC	2	6	233719	233724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_007974	GTT	2	6	234802	234807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_007974	TAG	2	6	234814	234819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_007974	GCG	2	6	234851	234856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_007974	GCA	2	6	234890	234895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_007974	G	6	6	236296	236301	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007974	G	6	6	236306	236311	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
633	NC_007974	GCC	2	6	236350	236355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_007974	CG	3	6	237138	237143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_007974	GCG	2	6	237153	237158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_007974	CAT	2	6	237196	237201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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638	NC_007974	CGC	2	6	237285	237290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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