MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 8301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007973	CTTT	2	8	2527335	2527342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_007973	T	6	6	2527340	2527345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_007973	CTCGC	2	10	2527397	2527406	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5004	NC_007973	GGA	2	6	2527846	2527851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_007973	TCA	2	6	2528272	2528277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_007973	TTCA	2	8	2528412	2528419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_007973	CTTT	2	8	2529131	2529138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_007973	CCAC	2	8	2529139	2529146	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5009	NC_007973	CAT	2	6	2529179	2529184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_007973	CA	4	8	2529947	2529954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_007973	CCTT	2	8	2529962	2529969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_007973	AG	3	6	2530002	2530007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_007973	TCC	2	6	2530320	2530325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_007973	GCA	2	6	2530355	2530360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_007973	GGTGC	2	10	2530376	2530385	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5016	NC_007973	GCAG	2	8	2530398	2530405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_007973	TCG	2	6	2530435	2530440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_007973	TTC	2	6	2530510	2530515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_007973	TCCA	2	8	2530532	2530539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_007973	CCAC	2	8	2530542	2530549	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5021	NC_007973	GCGG	2	8	2530566	2530573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_007973	TTC	2	6	2531551	2531556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_007973	CA	3	6	2531557	2531562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_007973	GTC	2	6	2531641	2531646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_007973	A	7	7	2531658	2531664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_007973	CGT	2	6	2532876	2532881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_007973	CAG	2	6	2532896	2532901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_007973	GC	3	6	2532925	2532930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_007973	GCTGG	2	10	2533081	2533090	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5030	NC_007973	GCG	3	9	2533152	2533160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_007973	GGC	2	6	2533168	2533173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_007973	CGG	2	6	2533231	2533236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_007973	CCGCG	2	10	2533279	2533288	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5034	NC_007973	GCCG	2	8	2533333	2533340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_007973	GCT	2	6	2533366	2533371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_007973	CAA	2	6	2533379	2533384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_007973	GAG	2	6	2533394	2533399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_007973	TGC	2	6	2533452	2533457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_007973	GCG	2	6	2533458	2533463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_007973	CGG	2	6	2533510	2533515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_007973	CACG	2	8	2533516	2533523	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_007973	AC	3	6	2533596	2533601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_007973	AGC	2	6	2533631	2533636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_007973	CCG	2	6	2534561	2534566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_007973	CCAC	2	8	2534599	2534606	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5046	NC_007973	CGA	2	6	2534618	2534623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_007973	GAC	2	6	2534651	2534656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_007973	CTGG	2	8	2534657	2534664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_007973	CGGT	2	8	2534769	2534776	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_007973	GGC	2	6	2534811	2534816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_007973	CGCC	2	8	2534824	2534831	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5052	NC_007973	CGA	2	6	2534908	2534913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_007973	ATC	2	6	2534915	2534920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_007973	CAAGCA	2	12	2534962	2534973	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_007973	CAG	3	9	2534975	2534983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_007973	GCC	2	6	2535183	2535188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_007973	TTC	2	6	2535245	2535250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_007973	AGC	3	9	2535285	2535293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_007973	CGG	2	6	2535324	2535329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_007973	CGC	2	6	2535426	2535431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_007973	GCA	2	6	2535474	2535479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_007973	T	6	6	2535543	2535548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_007973	CTT	2	6	2535901	2535906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_007973	CCG	2	6	2535916	2535921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_007973	CGC	2	6	2535926	2535931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_007973	GCC	2	6	2535951	2535956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_007973	CCG	2	6	2535967	2535972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_007973	CCT	2	6	2536039	2536044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_007973	CCA	2	6	2536093	2536098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_007973	AGCGAC	2	12	2536142	2536153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_007973	GATT	2	8	2536500	2536507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_007973	CG	5	10	2536513	2536522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_007973	CTG	2	6	2536548	2536553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_007973	CGT	2	6	2536555	2536560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_007973	GCG	2	6	2536597	2536602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_007973	CCA	2	6	2536655	2536660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_007973	TGG	2	6	2536666	2536671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_007973	TCC	2	6	2537708	2537713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_007973	CGC	2	6	2537721	2537726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_007973	CGG	2	6	2538707	2538712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_007973	TCAT	2	8	2538717	2538724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_007973	CGC	2	6	2539438	2539443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_007973	TTC	2	6	2539454	2539459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_007973	CCG	2	6	2539466	2539471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_007973	CGC	2	6	2539887	2539892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_007973	TTC	2	6	2539922	2539927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_007973	GAG	2	6	2539958	2539963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_007973	AGG	2	6	2540382	2540387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_007973	TTC	2	6	2540662	2540667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_007973	GCGG	2	8	2540694	2540701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5091	NC_007973	ACC	2	6	2540726	2540731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_007973	CTG	2	6	2542575	2542580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_007973	TCATCC	2	12	2542937	2542948	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_007973	TCA	2	6	2542997	2543002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_007973	AGG	2	6	2543003	2543008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_007973	GCC	2	6	2543337	2543342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_007973	ACC	2	6	2543359	2543364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_007973	CAC	2	6	2543390	2543395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_007973	GTG	2	6	2543421	2543426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_007973	T	8	8	2545765	2545772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_007973	TGC	2	6	2545814	2545819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_007973	GCG	2	6	2545834	2545839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_007973	GGC	2	6	2551931	2551936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_007973	CGG	2	6	2558151	2558156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_007973	AAT	2	6	2559262	2559267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_007973	TCGC	2	8	2559295	2559302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_007973	GTC	2	6	2559318	2559323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_007973	CA	3	6	2559387	2559392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_007973	CGCTG	2	10	2567939	2567948	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5110	NC_007973	CACCGC	2	12	2567988	2567999	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_007973	GATG	2	8	2568003	2568010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_007973	GTTC	2	8	2568017	2568024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_007973	AGG	2	6	2568028	2568033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_007973	GC	4	8	2568049	2568056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_007973	GCG	2	6	2568636	2568641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_007973	TTGT	2	8	2568677	2568684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_007973	GAG	2	6	2571896	2571901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_007973	CTT	2	6	2573466	2573471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_007973	GTC	2	6	2573835	2573840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_007973	CTG	2	6	2573885	2573890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_007973	CAGG	2	8	2575189	2575196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_007973	CGG	2	6	2575266	2575271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_007973	GCG	2	6	2575274	2575279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_007973	GCC	2	6	2578449	2578454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_007973	GGC	2	6	2578488	2578493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_007973	GTAA	2	8	2578558	2578565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_007973	CGG	2	6	2578630	2578635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_007973	TC	3	6	2578636	2578641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_007973	CAGGC	2	10	2578655	2578664	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5131	NC_007973	GGC	2	6	2578758	2578763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5262	NC_007973	CAA	2	6	2618606	2618611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_007973	GCA	2	6	2618618	2618623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_007973	GT	3	6	2619244	2619249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_007973	GT	3	6	2621395	2621400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5282	NC_007973	GA	3	6	2635290	2635295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_007973	CTG	2	6	2635306	2635311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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