MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL28

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007972	TAC	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007972	CGG	2	6	2270	2275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007972	GAC	2	6	3696	3701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007972	GCA	2	6	3818	3823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007972	CGG	2	6	3855	3860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007972	ACG	2	6	4000	4005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007972	TTG	2	6	4071	4076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007972	ATT	2	6	4119	4124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007972	GTC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007972	CTT	2	6	4210	4215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007972	CTG	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007972	AGC	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007972	ACA	2	6	4397	4402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007972	GCT	2	6	4440	4445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007972	TCG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007972	GAT	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007972	GGC	2	6	7370	7375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007972	CGG	2	6	7378	7383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007972	CGG	2	6	7390	7395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007972	GCG	2	6	7402	7407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007972	GGC	2	6	7434	7439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007972	ATT	2	6	7488	7493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007972	GGC	2	6	8684	8689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007972	CCT	2	6	8703	8708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007972	CTA	2	6	9175	9180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007972	CCT	2	6	10099	10104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007972	TCG	2	6	10161	10166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007972	GAA	2	6	12479	12484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007972	ACG	2	6	12499	12504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007972	TTC	2	6	16457	16462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007972	GAA	2	6	19281	19286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007972	CCT	2	6	19305	19310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_007972	GGC	2	6	19332	19337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007972	AAG	2	6	19391	19396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007972	TGG	2	6	20961	20966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007972	GGT	2	6	21527	21532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007972	TGG	2	6	21585	21590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007972	GCA	2	6	21862	21867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007972	CAA	2	6	21925	21930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007972	CGA	2	6	22002	22007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007972	GCG	2	6	22114	22119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007972	CGC	2	6	22158	22163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_007972	CAG	2	6	22234	22239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007972	AGC	2	6	22260	22265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007972	CGC	2	6	25330	25335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007972	ACG	2	6	25352	25357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007972	CCG	2	6	25598	25603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007972	GCT	2	6	25626	25631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007972	GCC	2	6	25917	25922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_007972	TTC	2	6	25976	25981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007972	CAC	3	9	25995	26003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007972	GCC	2	6	26059	26064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007972	GCT	2	6	26106	26111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007972	TTG	2	6	26120	26125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007972	ACC	2	6	26208	26213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007972	TCG	2	6	26276	26281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007972	GTG	2	6	26389	26394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007972	TTC	2	6	26560	26565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007972	GAT	2	6	26719	26724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007972	CGA	2	6	26895	26900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007972	GCT	2	6	26901	26906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007972	CAT	2	6	26922	26927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007972	CCA	2	6	26987	26992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007972	GCC	2	6	27085	27090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007972	TCT	2	6	27115	27120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007972	ATG	2	6	27124	27129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007972	ACC	2	6	27139	27144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007972	GCC	2	6	27592	27597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_007972	TGC	2	6	27641	27646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007972	ACT	2	6	27665	27670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007972	CCG	2	6	27891	27896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007972	CCA	2	6	27935	27940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_007972	ACC	2	6	28129	28134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_007972	CCG	2	6	28189	28194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007972	GCC	2	6	28269	28274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007972	CTG	2	6	28369	28374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007972	CGG	2	6	29092	29097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007972	GAA	2	6	29701	29706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007972	CAT	2	6	29732	29737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007972	CGA	2	6	29754	29759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007972	CTG	2	6	29797	29802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007972	GCC	2	6	29990	29995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_007972	GCC	2	6	29997	30002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007972	TTG	2	6	30047	30052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007972	CCT	2	6	30634	30639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007972	GTC	2	6	30887	30892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007972	GCT	2	6	30932	30937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007972	GAC	2	6	30993	30998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007972	ACG	2	6	31164	31169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007972	GTC	2	6	31196	31201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007972	GCA	2	6	32389	32394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007972	AGG	2	6	34133	34138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007972	TTC	2	6	35827	35832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007972	GAC	2	6	39416	39421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007972	GCC	2	6	41582	41587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007972	GCG	2	6	41724	41729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007972	AAC	2	6	44361	44366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007972	TGG	2	6	48509	48514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007972	CTT	2	6	51150	51155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007972	TGT	2	6	52182	52187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007972	GGC	2	6	52859	52864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007972	GGC	2	6	52874	52879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007972	CCG	2	6	52962	52967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007972	CGG	2	6	53005	53010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007972	ATG	2	6	53016	53021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007972	ATC	2	6	53091	53096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007972	CGG	2	6	53172	53177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007972	CGA	2	6	61515	61520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007972	CCG	2	6	64511	64516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007972	AAG	2	6	64528	64533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007972	GCA	2	6	64686	64691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007972	CGG	2	6	64721	64726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007972	GGC	2	6	64830	64835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007972	GCC	3	9	64887	64895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_007972	CGA	2	6	64946	64951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007972	TCA	2	6	65011	65016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007972	CGC	2	6	65034	65039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007972	CTC	2	6	65232	65237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_007972	TCG	2	6	65259	65264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007972	TCC	2	6	65279	65284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007972	GAG	2	6	65311	65316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007972	CGA	2	6	65372	65377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007972	GCT	2	6	65430	65435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007972	GCA	2	6	65525	65530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007972	AGC	2	6	65710	65715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007972	GTG	2	6	65928	65933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007972	AAC	2	6	65951	65956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007972	CAA	2	6	65975	65980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007972	ATG	2	6	67537	67542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007972	CGT	2	6	67576	67581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007972	CAA	2	6	67584	67589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007972	GCC	2	6	67666	67671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_007972	TCT	3	9	67740	67748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007972	AAT	2	6	67775	67780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007972	ATG	2	6	67793	67798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007972	AAG	2	6	67851	67856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007972	GCC	3	9	68326	68334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007972	CTG	2	6	71383	71388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007972	CCG	2	6	74311	74316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_007972	GCA	2	6	74394	74399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_007972	GTA	2	6	142514	142519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.