MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 1362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007971	AGC	2	6	170446	170451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_007971	TCGG	2	8	170530	170537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_007971	CGA	2	6	170544	170549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_007971	GGC	2	6	170612	170617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_007971	TG	3	6	170625	170630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_007971	CT	3	6	170653	170658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_007971	TGC	2	6	171147	171152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_007971	GAC	2	6	171268	171273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_007971	GAT	2	6	175253	175258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_007971	A	6	6	175285	175290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_007971	AAC	2	6	175347	175352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_007971	TTC	2	6	176524	176529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_007971	AAC	2	6	176550	176555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_007971	AG	3	6	176557	176562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_007971	CCA	2	6	176570	176575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_007971	GGT	2	6	176580	176585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_007971	T	7	7	176588	176594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_007971	ATT	2	6	176630	176635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_007971	CTA	3	9	176714	176722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_007971	CTG	2	6	176739	176744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_007971	CAA	2	6	176752	176757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_007971	GCG	2	6	176774	176779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_007971	CCTTG	2	10	176835	176844	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_007971	GGC	2	6	176896	176901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_007971	GACA	2	8	176972	176979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_007971	AGA	2	6	177093	177098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_007971	GCA	2	6	177185	177190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_007971	GGC	2	6	177222	177227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_007971	CAA	2	6	177249	177254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_007971	TCG	2	6	177282	177287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_007971	ATC	2	6	177289	177294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_007971	ATG	2	6	177370	177375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_007971	CG	3	6	177376	177381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_007971	TGG	2	6	177458	177463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_007971	GC	3	6	177520	177525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_007971	CGG	2	6	177578	177583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_007971	CGC	2	6	177650	177655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_007971	GGA	2	6	177663	177668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_007971	CCA	2	6	177714	177719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_007971	CAG	2	6	177808	177813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_007971	GCG	2	6	177835	177840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_007971	GCCA	2	8	177845	177852	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_007971	A	6	6	178009	178014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_007971	CG	3	6	178024	178029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_007971	CGC	2	6	178053	178058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_007971	GGC	2	6	178200	178205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_007971	GGC	2	6	178240	178245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_007971	CGG	2	6	178251	178256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_007971	GTC	2	6	178346	178351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_007971	GGA	2	6	178353	178358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_007971	A	8	8	178368	178375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_007971	GGA	2	6	178474	178479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_007971	CGC	2	6	178518	178523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_007971	CCT	2	6	178773	178778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_007971	ACG	2	6	178854	178859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_007971	AACGC	2	10	179639	179648	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1057	NC_007971	GGGT	2	8	179694	179701	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_007971	CTGT	2	8	180261	180268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_007971	GTC	2	6	180652	180657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_007971	GCCG	2	8	180685	180692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_007971	T	6	6	181978	181983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_007971	TGGCT	2	10	182100	182109	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_007971	GTA	2	6	182143	182148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007971	GTT	2	6	184826	184831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_007971	GGC	2	6	185285	185290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_007971	GCC	2	6	185297	185302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_007971	TGC	2	6	185309	185314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_007971	GTC	2	6	185872	185877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_007971	GGT	2	6	186421	186426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_007971	TGG	2	6	187809	187814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_007971	AG	3	6	189344	189349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_007971	CGA	2	6	191274	191279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_007971	ACATT	2	10	191289	191298	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_007971	GAG	2	6	191389	191394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_007971	CAG	2	6	193501	193506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_007971	GC	3	6	194024	194029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_007971	GCA	2	6	194041	194046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_007971	AGC	2	6	194794	194799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_007971	TCC	2	6	194824	194829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_007971	GAA	2	6	194865	194870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_007971	TTGGA	2	10	194954	194963	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_007971	TTC	2	6	195079	195084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_007971	GCG	2	6	195104	195109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_007971	GTGC	2	8	195247	195254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_007971	GCG	2	6	195272	195277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_007971	TGG	2	6	195279	195284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_007971	TG	3	6	195323	195328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_007971	GCA	2	6	195359	195364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_007971	GCG	2	6	195397	195402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_007971	GAG	2	6	195427	195432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_007971	G	6	6	195449	195454	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_007971	CGA	2	6	195519	195524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_007971	GTG	2	6	195584	195589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_007971	GCGAAT	2	12	195590	195601	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1095	NC_007971	GAAT	2	8	195615	195622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_007971	CGC	2	6	196851	196856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_007971	GCA	2	6	196874	196879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_007971	CGCT	2	8	196902	196909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_007971	CTG	2	6	197054	197059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_007971	CTG	2	6	197090	197095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_007971	GTG	2	6	197096	197101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_007971	GAAGGT	2	12	197168	197179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_007971	CT	3	6	197191	197196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_007971	CTGT	2	8	197210	197217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_007971	GCC	2	6	197300	197305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_007971	T	8	8	197316	197323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_007971	TGTCCT	2	12	197412	197423	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_007971	GTC	2	6	197426	197431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_007971	CAT	2	6	197579	197584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_007971	CGG	2	6	197621	197626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_007971	GCGCT	2	10	197715	197724	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1112	NC_007971	CGC	2	6	197748	197753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_007971	CGG	2	6	197759	197764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_007971	GCTG	2	8	197843	197850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_007971	CG	3	6	197852	197857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_007971	GCAG	2	8	197868	197875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_007971	GAA	2	6	197978	197983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_007971	CGC	2	6	198238	198243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_007971	TTGC	2	8	198335	198342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_007971	TTGG	2	8	198408	198415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_007971	ACCA	2	8	198473	198480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_007971	GCCG	2	8	198513	198520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_007971	TCA	2	6	198564	198569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_007971	GAG	2	6	198617	198622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_007971	TTCG	2	8	198672	198679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_007971	AT	3	6	198766	198771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_007971	GAA	2	6	198777	198782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_007971	CGC	2	6	198808	198813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_007971	TGC	2	6	198900	198905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_007971	CGCA	2	8	198914	198921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_007971	GC	3	6	198978	198983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_007971	TC	3	6	199020	199025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_007971	GTG	2	6	199124	199129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_007971	GAC	2	6	199266	199271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_007971	CG	3	6	200061	200066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_007971	CAG	2	6	200078	200083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1275	NC_007971	TCG	2	6	217592	217597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1303	NC_007971	TCG	2	6	224582	224587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1304	NC_007971	TAT	2	6	225264	225269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1305	NC_007971	ATG	2	6	225325	225330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1306	NC_007971	TTG	2	6	225366	225371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1315	NC_007971	CGG	2	6	226468	226473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1318	NC_007971	TC	3	6	228812	228817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1321	NC_007971	ATC	2	6	228928	228933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1362	NC_007971	T	6	6	233607	233612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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