MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 7808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007963	TCC	2	6	459229	459234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_007963	GGA	2	6	459246	459251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_007963	GACA	2	8	459323	459330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_007963	GGT	2	6	459366	459371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_007963	CGG	2	6	459453	459458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_007963	TCA	2	6	459481	459486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_007963	CGT	2	6	459561	459566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_007963	GCT	2	6	459615	459620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_007963	CCT	2	6	459772	459777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_007963	GAC	2	6	459989	459994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_007963	AGCG	2	8	459998	460005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_007963	CAG	2	6	460032	460037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_007963	T	6	6	460142	460147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_007963	GC	3	6	460160	460165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_007963	GCC	2	6	460192	460197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_007963	TTG	2	6	460201	460206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_007963	T	6	6	460258	460263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_007963	GAC	2	6	460273	460278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_007963	TGC	2	6	462105	462110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_007963	GA	3	6	462137	462142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_007963	TC	3	6	462173	462178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_007963	TCG	2	6	462193	462198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_007963	CCA	2	6	462284	462289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_007963	TGA	2	6	462378	462383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_007963	TC	3	6	462509	462514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_007963	GC	4	8	462567	462574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1029	NC_007963	TTC	2	6	462710	462715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_007963	TTCT	2	8	462721	462728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_007963	CGG	2	6	464958	464963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_007963	GCC	2	6	465048	465053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_007963	TCT	2	6	465056	465061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1042	NC_007963	GTGGG	2	10	474816	474825	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_007963	TTG	2	6	474840	474845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_007963	TGT	2	6	475279	475284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_007963	GC	3	6	475308	475313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1048	NC_007963	GAG	2	6	479234	479239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_007963	GCCT	2	8	479274	479281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_007963	CA	3	6	479712	479717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_007963	AG	3	6	482490	482495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_007963	AG	3	6	482499	482504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_007963	CAGT	2	8	484453	484460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_007963	GGTGTA	2	12	490018	490029	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1060	NC_007963	ACG	2	6	496237	496242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_007963	GGACA	2	10	499919	499928	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_007963	AAGGCG	2	12	499954	499965	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1063	NC_007963	GGC	2	6	499983	499988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_007963	GC	3	6	499987	499992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_007963	GTC	2	6	500059	500064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1067	NC_007963	GGCGT	2	10	501278	501287	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_007963	TGG	2	6	501294	501299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_007963	CGG	2	6	502227	502232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1072	NC_007963	GC	3	6	505905	505910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_007963	ATG	2	6	505967	505972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_007963	GCCC	2	8	515530	515537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1083	NC_007963	GAC	2	6	515996	516001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_007963	GATGAA	2	12	520014	520025	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_007963	GCG	2	6	520064	520069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_007963	CCT	2	6	520926	520931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_007963	GCT	2	6	520941	520946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1092	NC_007963	GGC	2	6	521072	521077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_007963	GGT	2	6	522170	522175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_007963	GC	5	10	522211	522220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_007963	C	6	6	523289	523294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1102	NC_007963	CG	3	6	523326	523331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_007963	TCA	2	6	523389	523394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1107	NC_007963	GCC	2	6	524149	524154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_007963	GCG	2	6	526517	526522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_007963	CGG	2	6	526525	526530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_007963	GGC	2	6	527007	527012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_007963	A	6	6	527021	527026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_007963	T	7	7	527041	527047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_007963	GGGC	2	8	528695	528702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_007963	GATACC	2	12	532698	532709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_007963	GAT	2	6	532717	532722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_007963	TCG	2	6	532759	532764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_007963	GGCC	2	8	532774	532781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_007963	CGTC	2	8	533793	533800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_007963	GCC	2	6	533816	533821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_007963	CG	3	6	534800	534805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_007963	GCGT	2	8	534837	534844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_007963	CT	3	6	534890	534895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_007963	TA	3	6	538806	538811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_007963	CATC	2	8	538823	538830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1126	NC_007963	GCG	2	6	539319	539324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_007963	CGG	2	6	542251	542256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_007963	GA	3	6	542339	542344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_007963	GCA	2	6	544008	544013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_007963	CCG	2	6	544026	544031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_007963	GCG	2	6	544038	544043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_007963	GGC	2	6	544935	544940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_007963	CGC	2	6	546742	546747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1135	NC_007963	TGA	2	6	546819	546824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1406	NC_007963	CCG	2	6	653659	653664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1407	NC_007963	CAGCC	2	10	653697	653706	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1408	NC_007963	GAG	2	6	654884	654889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1410	NC_007963	CGA	2	6	657132	657137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1438	NC_007963	CCG	2	6	672343	672348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1439	NC_007963	CGG	2	6	672365	672370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1479	NC_007963	A	6	6	695175	695180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1488	NC_007963	TAC	2	6	699027	699032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1500	NC_007963	GA	3	6	705420	705425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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