MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila felis Fe/C-56

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007899	CTTTT	2	10	17532	17541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007899	GTTTT	2	10	25787	25796	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007899	TGACT	2	10	35142	35151	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007899	GGGCT	2	10	101828	101837	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007899	TGTTA	2	10	140037	140046	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007899	ATAAA	2	10	140066	140075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007899	AGGAA	2	10	140955	140964	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007899	ATTTT	2	10	147692	147701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007899	GGAAA	2	10	148294	148303	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007899	TATGT	2	10	149375	149384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007899	AGTTA	2	10	150115	150124	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007899	AGGTT	2	10	151042	151051	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007899	GTTAC	2	10	152520	152529	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007899	AAAGG	2	10	152810	152819	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007899	TCTTT	2	10	152828	152837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007899	CTATT	2	10	157979	157988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007899	GAAAA	2	10	158628	158637	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007899	TACTT	2	10	179681	179690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007899	AAATT	2	10	187830	187839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007899	TCTTT	2	10	206191	206200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007899	ACGTT	2	10	227458	227467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007899	TTAAA	2	10	238421	238430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007899	GTTGT	2	10	244928	244937	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007899	TCTAT	2	10	253988	253997	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007899	AGTTT	2	10	257007	257016	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007899	TTTTG	2	10	264208	264217	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007899	TAACT	2	10	276162	276171	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007899	TTGCT	2	10	276172	276181	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007899	GAAAA	2	10	285916	285925	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007899	TAGTA	2	10	288838	288847	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007899	AAAAT	2	10	288964	288973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007899	CTTTT	2	10	289050	289059	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007899	TAAAA	2	10	302346	302355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007899	TGGTA	2	10	302408	302417	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007899	TTTTA	2	10	305717	305726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007899	TGTTC	2	10	315171	315180	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007899	AATGA	2	10	332100	332109	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007899	TTTAT	2	10	355277	355286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007899	GTCTT	2	10	356313	356322	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007899	AGTAA	2	10	359120	359129	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007899	TTAAT	2	10	359778	359787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007899	TTTAA	2	10	374555	374564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007899	TAGAA	2	10	399709	399718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007899	TTTCT	2	10	425285	425294	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007899	TTTAA	2	10	425348	425357	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007899	GTTTG	2	10	433643	433652	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007899	CCCTT	2	10	451127	451136	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_007899	GTTCT	2	10	455119	455128	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007899	TATTT	2	10	462532	462541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007899	TTAAT	2	10	469074	469083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007899	ATTAA	2	10	485182	485191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007899	TATTT	2	10	485198	485207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007899	CTTAG	2	10	487060	487069	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007899	CTCTT	2	10	491203	491212	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_007899	TTATT	2	10	492657	492666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007899	AGAGT	2	10	497926	497935	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007899	TGTTT	2	10	499850	499859	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007899	AGCAT	2	10	517569	517578	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007899	TAACT	2	10	533584	533593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007899	TTTTC	2	10	534907	534916	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007899	TGATT	2	10	534998	535007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007899	AATCT	2	10	543730	543739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007899	TTGTT	2	10	549507	549516	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007899	CAAAT	2	10	563821	563830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007899	CTATT	2	10	596407	596416	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007899	TTTTA	2	10	604223	604232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007899	AGAAA	2	10	604245	604254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007899	TTTTA	2	10	614798	614807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007899	GTCTT	2	10	620911	620920	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007899	ATTTT	2	10	652215	652224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007899	TAAAA	2	10	655640	655649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007899	ATTTT	2	10	670167	670176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007899	GTAAA	2	10	670224	670233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007899	ATTTT	2	10	674107	674116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007899	ATTAA	2	10	680146	680155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007899	TATTC	2	10	682797	682806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007899	TAAAA	2	10	684238	684247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007899	TACAT	2	10	692325	692334	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007899	CTTTT	2	10	707324	707333	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007899	CAAAT	2	10	714943	714952	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007899	TAACT	2	10	716138	716147	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007899	AGAAA	2	10	717694	717703	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007899	CTCTT	2	10	717787	717796	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_007899	TCATA	2	10	717822	717831	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007899	CATAA	2	10	767655	767664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007899	ATTAA	2	10	792148	792157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007899	ATTTA	2	10	807093	807102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007899	ATAAA	2	10	811298	811307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007899	CTTCA	2	10	815712	815721	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_007899	TTAAA	2	10	815736	815745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007899	TGAAA	2	10	819451	819460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007899	TATAA	2	10	822606	822615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007899	TTATT	2	10	876317	876326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007899	AACAA	2	10	876352	876361	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007899	TAAAA	2	10	876380	876389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007899	ATTAA	2	10	878376	878385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007899	TTAAA	2	10	886966	886975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007899	AAAAT	2	10	891147	891156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007899	AATTA	2	10	893318	893327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007899	ATTTT	2	10	940332	940341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007899	AAAAT	2	10	973055	973064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007899	AATTA	2	10	987594	987603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007899	TAAAA	2	10	1002446	1002455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007899	CTTAA	2	10	1002589	1002598	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007899	CAGAA	2	10	1018629	1018638	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007899	TAAAA	2	10	1018778	1018787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007899	TAAAA	2	10	1018896	1018905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007899	CAAAA	2	10	1023568	1023577	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007899	TAAAA	2	10	1027452	1027461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007899	TCAAC	2	10	1027510	1027519	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007899	AGCAA	2	10	1036285	1036294	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007899	GAGCA	2	10	1038134	1038143	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007899	TATAT	2	10	1043631	1043640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007899	TTTCT	2	10	1044008	1044017	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007899	CTCTA	2	10	1056550	1056559	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007899	TAGAA	2	10	1059574	1059583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007899	GAAGT	2	10	1095207	1095216	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007899	ATAAA	2	10	1113488	1113497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007899	GTTTT	2	10	1113650	1113659	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007899	TATTT	2	10	1122719	1122728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007899	ATTAA	2	10	1133907	1133916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007899	AAAAT	2	10	1139614	1139623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007899	TAAAA	2	10	1159520	1159529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.