MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 7295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007514	GAT	2	6	1417567	1417572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_007514	CAT	2	6	1417617	1417622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_007514	A	6	6	1417627	1417632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_007514	GTA	2	6	1417645	1417650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_007514	GATGG	2	10	1421090	1421099	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_007514	GGT	2	6	1421137	1421142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_007514	ATG	2	6	1421182	1421187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_007514	GC	3	6	1421201	1421206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_007514	AC	3	6	1421314	1421319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_007514	TTA	2	6	1421549	1421554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_007514	AAG	2	6	1421583	1421588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_007514	A	7	7	1421590	1421596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_007514	TTG	2	6	1421617	1421622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_007514	A	6	6	1421642	1421647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_007514	AACC	2	8	1421751	1421758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_007514	GAC	2	6	1421776	1421781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_007514	ACA	2	6	1421785	1421790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_007514	TG	3	6	1421823	1421828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_007514	CCT	2	6	1421862	1421867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_007514	GGT	2	6	1421897	1421902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_007514	GAT	2	6	1421918	1421923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_007514	GCACG	2	10	1421933	1421942	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4023	NC_007514	AC	3	6	1422049	1422054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_007514	ATT	2	6	1422367	1422372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_007514	TAA	2	6	1422377	1422382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_007514	A	6	6	1422387	1422392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_007514	A	7	7	1422406	1422412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_007514	CT	3	6	1422425	1422430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_007514	A	6	6	1422471	1422476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_007514	AAT	2	6	1422487	1422492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_007514	A	6	6	1422507	1422512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_007514	TCAG	2	8	1422530	1422537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_007514	A	6	6	1422538	1422543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_007514	AT	3	6	1422604	1422609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_007514	AAC	2	6	1422623	1422628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_007514	AGA	2	6	1422662	1422667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_007514	ATGA	2	8	1422681	1422688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_007514	GAA	2	6	1422728	1422733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_007514	ACA	2	6	1423115	1423120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_007514	CGT	2	6	1423155	1423160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_007514	G	6	6	1423224	1423229	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_007514	GAT	2	6	1423272	1423277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_007514	GCACG	2	10	1423287	1423296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4044	NC_007514	TCA	2	6	1423389	1423394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4047	NC_007514	T	7	7	1423471	1423477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_007514	TTCA	2	8	1423501	1423508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_007514	GAC	2	6	1423598	1423603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4051	NC_007514	GTG	2	6	1423642	1423647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_007514	AACAA	2	10	1424999	1425008	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4053	NC_007514	CT	3	6	1425009	1425014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_007514	A	6	6	1425017	1425022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_007514	CAAT	2	8	1425078	1425085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4061	NC_007514	T	6	6	1431417	1431422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_007514	A	7	7	1431514	1431520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_007514	ATT	2	6	1431667	1431672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_007514	AAAAC	2	10	1431691	1431700	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4066	NC_007514	TAC	2	6	1437949	1437954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4068	NC_007514	TCA	2	6	1438011	1438016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_007514	ACT	2	6	1438043	1438048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_007514	GAT	2	6	1438066	1438071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_007514	T	6	6	1438071	1438076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_007514	GCTTT	2	10	1438092	1438101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4073	NC_007514	AAT	2	6	1438108	1438113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_007514	CTTTT	2	10	1438127	1438136	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4075	NC_007514	A	10	10	1438148	1438157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_007514	CATT	2	8	1441267	1441274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_007514	T	6	6	1441273	1441278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_007514	CAA	2	6	1441339	1441344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4087	NC_007514	ACCT	2	8	1443417	1443424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_007514	A	7	7	1443429	1443435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_007514	C	6	6	1443440	1443445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4093	NC_007514	A	6	6	1443574	1443579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4098	NC_007514	TTG	2	6	1443694	1443699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_007514	ACC	2	6	1443714	1443719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_007514	AAT	2	6	1443809	1443814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_007514	AT	3	6	1443832	1443837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_007514	GAG	2	6	1446657	1446662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_007514	T	7	7	1446669	1446675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_007514	TA	3	6	1446680	1446685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_007514	TCA	2	6	1446690	1446695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4107	NC_007514	GAA	2	6	1449469	1449474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_007514	TGA	2	6	1449478	1449483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_007514	A	6	6	1449500	1449505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_007514	ATC	2	6	1449522	1449527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_007514	TTA	2	6	1449606	1449611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_007514	AGGG	2	8	1451183	1451190	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_007514	CA	3	6	1451214	1451219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_007514	A	6	6	1451221	1451226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_007514	TAG	2	6	1452213	1452218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_007514	CT	3	6	1452224	1452229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_007514	ACA	2	6	1452241	1452246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_007514	G	6	6	1452251	1452256	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_007514	ATA	2	6	1452308	1452313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_007514	A	6	6	1452313	1452318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_007514	T	6	6	1452330	1452335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_007514	T	7	7	1452350	1452356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_007514	GAAA	2	8	1454288	1454295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_007514	AAC	2	6	1454356	1454361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_007514	T	6	6	1454374	1454379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_007514	ACC	2	6	1454468	1454473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_007514	AGA	2	6	1455433	1455438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_007514	A	7	7	1455482	1455488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_007514	T	6	6	1455496	1455501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_007514	TAC	2	6	1456051	1456056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_007514	CAAA	2	8	1456067	1456074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_007514	AAAC	2	8	1456209	1456216	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4133	NC_007514	AAT	2	6	1459965	1459970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_007514	TGG	2	6	1459983	1459988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_007514	CTCCC	2	10	1500552	1500561	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4263	NC_007514	T	6	6	1500680	1500685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_007514	TTTAAC	2	12	1500718	1500729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4266	NC_007514	ATC	2	6	1501814	1501819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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