MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 7295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007514	CAA	2	6	467579	467584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_007514	A	6	6	467598	467603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_007514	CCTC	2	8	467641	467648	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1504	NC_007514	TTA	2	6	467756	467761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_007514	A	8	8	467848	467855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_007514	ACA	4	12	467863	467874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_007514	AAT	2	6	467961	467966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_007514	GTA	2	6	467994	467999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_007514	AAT	2	6	470793	470798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_007514	AAT	2	6	470850	470855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_007514	GA	3	6	470904	470909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_007514	TTA	2	6	471023	471028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_007514	AC	3	6	471033	471038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_007514	AGC	2	6	471055	471060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_007514	TTGAG	2	10	472284	472293	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_007514	CTATT	2	10	472322	472331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1517	NC_007514	TA	3	6	472341	472346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_007514	AAG	2	6	472394	472399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_007514	AAG	2	6	472425	472430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_007514	ACA	2	6	472465	472470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_007514	TGA	2	6	479104	479109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_007514	GTGTT	2	10	479119	479128	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_007514	GAA	2	6	479153	479158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_007514	CAA	2	6	479234	479239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_007514	TA	3	6	479770	479775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_007514	TAA	2	6	479796	479801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_007514	AAT	2	6	479815	479820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_007514	T	7	7	479826	479832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_007514	GAA	2	6	479867	479872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_007514	GCTTC	2	10	479915	479924	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1531	NC_007514	AGAA	2	8	479938	479945	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_007514	CCT	2	6	480944	480949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_007514	ATT	2	6	480958	480963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_007514	TTTA	2	8	481027	481034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_007514	ATA	2	6	481048	481053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_007514	A	6	6	481058	481063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_007514	CGG	2	6	481077	481082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_007514	ATGG	2	8	481097	481104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_007514	CTT	2	6	481122	481127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_007514	GGTT	2	8	481180	481187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_007514	ATT	2	6	482694	482699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_007514	TTC	2	6	482712	482717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_007514	GATA	2	8	482754	482761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_007514	TC	3	6	482802	482807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_007514	TTAT	2	8	482828	482835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_007514	CAAC	2	8	483358	483365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_007514	T	6	6	484420	484425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_007514	T	6	6	484451	484456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_007514	ATT	2	6	484480	484485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_007514	AAATC	2	10	484494	484503	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1551	NC_007514	AATA	2	8	484517	484524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_007514	T	8	8	484555	484562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_007514	GTT	2	6	487954	487959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_007514	AGT	2	6	489135	489140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_007514	TC	3	6	493424	493429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_007514	TGCT	2	8	493435	493442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_007514	CCA	2	6	493446	493451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1559	NC_007514	GCT	2	6	494385	494390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_007514	GGA	2	6	494403	494408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_007514	TTG	3	9	494414	494422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_007514	GAAT	2	8	494438	494445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_007514	G	6	6	494519	494524	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_007514	AAG	2	6	494525	494530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_007514	TGC	2	6	494994	494999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1569	NC_007514	TTCGT	2	10	495100	495109	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1571	NC_007514	ATG	2	6	496919	496924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_007514	CCAA	2	8	496928	496935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_007514	TGG	2	6	496969	496974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_007514	AGG	2	6	496977	496982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_007514	TTGC	2	8	496992	496999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1578	NC_007514	TA	3	6	498706	498711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_007514	CGC	2	6	498742	498747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_007514	GC	3	6	498755	498760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_007514	TCA	2	6	500170	500175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_007514	TAA	2	6	500622	500627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_007514	A	7	7	500626	500632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_007514	TAT	2	6	500636	500641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_007514	ACG	2	6	500683	500688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1587	NC_007514	ATT	2	6	500888	500893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1590	NC_007514	TGT	2	6	501787	501792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_007514	GC	3	6	501814	501819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_007514	TGAAA	2	10	501858	501867	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_007514	ATG	2	6	501919	501924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_007514	CTG	2	6	501960	501965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_007514	TAA	2	6	501969	501974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_007514	A	6	6	501973	501978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_007514	TCC	3	9	502674	502682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_007514	TGCT	2	8	503811	503818	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_007514	GAA	2	6	505939	505944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_007514	ATG	2	6	506640	506645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1607	NC_007514	T	8	8	506713	506720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_007514	CT	4	8	506733	506740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_007514	T	6	6	506772	506777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_007514	TAT	2	6	506815	506820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_007514	T	7	7	506820	506826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_007514	T	7	7	506905	506911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_007514	T	6	6	507595	507600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_007514	AAT	2	6	507601	507606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_007514	TAT	2	6	507691	507696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_007514	TTA	2	6	507705	507710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_007514	ATTT	2	8	507760	507767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_007514	TTCAT	2	10	507779	507788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1620	NC_007514	T	7	7	507799	507805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_007514	ATTT	2	8	507837	507844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_007514	ATTA	2	8	507885	507892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_007514	AT	3	6	507910	507915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_007514	TTCT	2	8	507942	507949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_007514	A	6	6	507960	507965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_007514	T	7	7	507994	508000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_007514	ATC	2	6	508001	508006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_007514	AAAT	2	8	508055	508062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_007514	GT	3	6	508097	508102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_007514	A	6	6	508164	508169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_007514	AG	3	6	508172	508177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_007514	T	8	8	508196	508203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_007514	ATC	2	6	508328	508333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_007514	CCACA	2	10	508416	508425	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1635	NC_007514	CGG	2	6	508433	508438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_007514	TAA	2	6	508505	508510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_007514	GCT	2	6	509331	509336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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