MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 7295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007514	ATTGC	2	10	146451	146460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
502	NC_007514	T	7	7	147581	147587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007514	GAA	2	6	147593	147598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_007514	AATA	2	8	147602	147609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_007514	GAA	2	6	148294	148299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_007514	AAC	2	6	148313	148318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_007514	TGAT	2	8	148889	148896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007514	AT	3	6	148954	148959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007514	CAATT	2	10	148965	148974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
510	NC_007514	CCGA	2	8	148976	148983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
511	NC_007514	CAA	2	6	149075	149080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_007514	TGAT	2	8	149189	149196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_007514	TTA	2	6	149235	149240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_007514	TAC	2	6	149287	149292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_007514	AAG	2	6	149551	149556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007514	AG	3	6	149648	149653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007514	GAT	2	6	149691	149696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007514	AGA	2	6	149700	149705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007514	T	6	6	149736	149741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007514	GAT	2	6	149751	149756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_007514	TTC	2	6	149767	149772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007514	AAGAA	2	10	149784	149793	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007514	CAT	2	6	150530	150535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_007514	GTC	2	6	150903	150908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_007514	TTC	2	6	153974	153979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_007514	CTT	2	6	154070	154075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_007514	TAA	2	6	154094	154099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007514	CAA	2	6	154222	154227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_007514	CAA	2	6	155909	155914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007514	T	7	7	156811	156817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007514	A	6	6	156820	156825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007514	T	6	6	156842	156847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007514	AGGA	2	8	156854	156861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007514	ATC	2	6	156870	156875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_007514	TTG	2	6	156886	156891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007514	TGT	2	6	156909	156914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007514	TTG	2	6	156958	156963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_007514	CCA	2	6	157010	157015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_007514	GAC	2	6	157069	157074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_007514	AG	3	6	157090	157095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007514	ATT	2	6	157135	157140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007514	TGG	2	6	160912	160917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007514	A	7	7	161011	161017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007514	TTG	2	6	161051	161056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007514	AT	3	6	162829	162834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007514	TTTC	2	8	162835	162842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_007514	CAT	2	6	164791	164796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_007514	CAT	2	6	164835	164840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_007514	TAT	2	6	164953	164958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007514	A	6	6	165027	165032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_007514	ATC	2	6	165038	165043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_007514	TG	3	6	166178	166183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007514	A	6	6	166187	166192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_007514	AGCTA	2	10	166216	166225	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
555	NC_007514	GCG	2	6	166259	166264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_007514	AGA	2	6	167059	167064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_007514	T	8	8	167128	167135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_007514	AAC	2	6	167140	167145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007514	T	6	6	167781	167786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007514	CTTT	2	8	169846	169853	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_007514	TG	3	6	169891	169896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_007514	A	7	7	169904	169910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007514	CA	3	6	171185	171190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_007514	CAGT	2	8	171213	171220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_007514	ATCG	2	8	171226	171233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_007514	ATT	2	6	174191	174196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007514	TACAG	2	10	174199	174208	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
568	NC_007514	TC	3	6	174221	174226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_007514	AG	3	6	174268	174273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_007514	CGC	2	6	174305	174310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_007514	A	7	7	177137	177143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_007514	TAA	2	6	177232	177237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_007514	A	7	7	177286	177292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_007514	TAT	2	6	177353	177358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007514	GTT	2	6	179164	179169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007514	AAT	2	6	179174	179179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007514	CAATC	2	10	181579	181588	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
578	NC_007514	TAT	2	6	181602	181607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_007514	TGT	2	6	182466	182471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_007514	T	6	6	182500	182505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_007514	T	6	6	182515	182520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_007514	A	6	6	182532	182537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007514	GTT	2	6	182543	182548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007514	T	6	6	182583	182588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_007514	AACT	2	8	182594	182601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_007514	C	6	6	182602	182607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
587	NC_007514	CT	4	8	184041	184048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_007514	CTT	2	6	184101	184106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_007514	CAA	2	6	184166	184171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007514	TTA	2	6	184222	184227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_007514	TAA	2	6	184230	184235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_007514	A	6	6	184275	184280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007514	T	6	6	184312	184317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_007514	A	6	6	184328	184333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007514	CCT	2	6	184379	184384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_007514	TGG	2	6	184445	184450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_007514	A	6	6	184474	184479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_007514	TCA	2	6	185149	185154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_007514	AAT	2	6	185166	185171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_007514	A	7	7	185183	185189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_007514	A	6	6	186581	186586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007514	TTAGG	2	10	186614	186623	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007514	CCA	2	6	186645	186650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_007514	GGGT	2	8	186713	186720	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
605	NC_007514	CTT	2	6	186799	186804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_007514	ATG	2	6	186863	186868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_007514	TCT	2	6	188126	188131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_007514	ATT	2	6	188855	188860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007514	A	7	7	188889	188895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007514	TTTG	2	8	188909	188916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007514	TGA	2	6	188935	188940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007514	ACA	2	6	189533	189538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_007514	CAT	2	6	189549	189554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_007514	GTT	2	6	191304	191309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_007514	TCG	2	6	191355	191360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_007514	GAG	2	6	191377	191382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_007514	GTA	2	6	191411	191416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_007514	CAC	2	6	191432	191437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_007514	AGT	2	6	191445	191450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_007514	T	6	6	191467	191472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_007514	T	7	7	191486	191492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007514	TATC	2	8	191513	191520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
623	NC_007514	TC	3	6	191567	191572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_007514	TCCC	2	8	194918	194925	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
625	NC_007514	T	8	8	196359	196366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_007514	CTC	2	6	198637	198642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_007514	TTG	2	6	198643	198648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_007514	TGG	2	6	198651	198656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_007514	TAA	2	6	202809	202814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_007514	GAT	2	6	202829	202834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_007514	TTG	2	6	202857	202862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007514	TAGC	2	8	202881	202888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_007514	GCTTCC	2	12	202952	202963	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
634	NC_007514	A	7	7	202966	202972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_007514	A	8	8	204547	204554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_007514	ATT	2	6	204597	204602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_007514	CAATA	2	10	204651	204660	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
638	NC_007514	ATT	2	6	204699	204704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_007514	TCA	2	6	204709	204714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_007514	A	7	7	204731	204737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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