MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007503	AGAT	2	8	203	210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007503	CCCT	2	8	16213	16220	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_007503	GGTC	2	8	19279	19286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007503	TAAT	2	8	25037	25044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007503	TACC	2	8	28183	28190	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007503	TCAA	2	8	49225	49232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007503	TAAA	2	8	49282	49289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007503	ATTA	2	8	49306	49313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007503	AGTT	2	8	50892	50899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007503	TGAA	2	8	55080	55087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007503	AGTA	2	8	55181	55188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007503	TTGT	2	8	66368	66375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007503	TTAA	2	8	89331	89338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007503	ATTA	2	8	89346	89353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007503	GCTG	2	8	90366	90373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007503	CGAA	2	8	97154	97161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007503	TTAT	2	8	106132	106139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007503	CCGC	2	8	112652	112659	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_007503	AAAG	2	8	118724	118731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007503	GGTC	2	8	124075	124082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007503	CCTT	2	8	127707	127714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007503	TAAA	2	8	132074	132081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007503	AAGC	2	8	132156	132163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007503	AGGG	2	8	132236	132243	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007503	TTAT	2	8	133721	133728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007503	TTAT	2	8	151068	151075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007503	GTAA	2	8	163175	163182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007503	TTGT	2	8	171019	171026	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007503	ATTT	2	8	190122	190129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007503	ATCC	2	8	193558	193565	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007503	GGGA	2	8	194070	194077	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007503	CCCG	2	8	194759	194766	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_007503	GAAA	2	8	201414	201421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007503	CTTT	2	8	206049	206056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007503	AGTA	2	8	208403	208410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007503	AGAA	2	8	208440	208447	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007503	CTTT	2	8	210629	210636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007503	TTCT	2	8	217320	217327	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007503	CAAA	2	8	226781	226788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007503	CTTC	2	8	230007	230014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007503	GGTG	2	8	238337	238344	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007503	AACC	2	8	252132	252139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007503	ATAA	2	8	252421	252428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007503	ATGT	2	8	257905	257912	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007503	GGCT	2	8	258578	258585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007503	TTAT	2	8	268021	268028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007503	ATGG	2	8	268741	268748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007503	TTAA	2	8	278373	278380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007503	CACC	2	8	278496	278503	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_007503	ACTT	2	8	284395	284402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007503	TAAA	2	8	295220	295227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007503	AATA	2	8	303300	303307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007503	AAAT	2	8	303342	303349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007503	AGGG	2	8	303620	303627	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007503	TTGT	2	8	303667	303674	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007503	GAAG	2	8	303681	303688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007503	TGCT	2	8	306223	306230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007503	ATTA	2	8	308142	308149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007503	ATTG	2	8	314480	314487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007503	TTTA	2	8	320308	320315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007503	AAAT	2	8	329657	329664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007503	TTAA	2	8	333517	333524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007503	GGAG	2	8	336047	336054	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007503	TAAA	2	8	343293	343300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007503	TTTA	2	8	343326	343333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007503	TAAA	2	8	360879	360886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007503	AGGG	2	8	365026	365033	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007503	GGAT	2	8	382053	382060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007503	GTTT	2	8	383079	383086	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007503	GAAA	2	8	391629	391636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007503	GCTT	2	8	391857	391864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007503	AATT	2	8	395087	395094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007503	ATAA	2	8	403380	403387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007503	GCAA	2	8	404398	404405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007503	CATC	2	8	410709	410716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007503	AATT	2	8	410808	410815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007503	TAAA	2	8	410953	410960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007503	GTTT	2	8	423899	423906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007503	TGAC	2	8	441205	441212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007503	TTAA	2	8	462102	462109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007503	AAAG	2	8	471976	471983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007503	CTTT	2	8	471993	472000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007503	GGAG	2	8	479584	479591	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007503	AAAC	2	8	481790	481797	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007503	TAGA	2	8	488760	488767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007503	AGGG	2	8	493199	493206	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007503	AGGG	2	8	494865	494872	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007503	TTAT	2	8	494982	494989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007503	AAAT	2	8	501102	501109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007503	GGAG	2	8	501217	501224	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007503	AAGA	2	8	504844	504851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007503	GAAG	2	8	512648	512655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007503	TCCT	2	8	514996	515003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007503	AATA	2	8	515109	515116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007503	AACA	2	8	518124	518131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007503	CTTT	2	8	526320	526327	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007503	GTTT	2	8	527613	527620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007503	ATTT	2	8	527664	527671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007503	GGGA	2	8	531964	531971	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007503	ATTA	2	8	534589	534596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007503	AAAT	2	8	534615	534622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007503	AAGC	2	8	541321	541328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007503	ATTT	2	8	542356	542363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007503	TCTA	2	8	542428	542435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007503	TAAA	2	8	552306	552313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007503	GTTA	2	8	554783	554790	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007503	TAAT	2	8	559008	559015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007503	GGGA	2	8	561126	561133	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007503	AAGG	2	8	565689	565696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007503	GGCG	2	8	566012	566019	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007503	ATTT	2	8	569689	569696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007503	TTTG	2	8	578257	578264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007503	AAAT	2	8	578366	578373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007503	AAAT	2	8	589083	589090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007503	AGGA	2	8	592747	592754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007503	CGTT	2	8	604845	604852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007503	TTAT	2	8	605327	605334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007503	TGCC	2	8	605472	605479	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007503	GGTG	2	8	605580	605587	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007503	GCCA	2	8	606449	606456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007503	AAGC	2	8	606489	606496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007503	TGCC	2	8	606894	606901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007503	CTTT	2	8	626099	626106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007503	AACA	2	8	630428	630435	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007503	AGGG	2	8	633841	633848	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007503	AGAA	2	8	635651	635658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007503	GGAG	2	8	642545	642552	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007503	TTTA	2	8	643716	643723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007503	CCTT	2	8	656515	656522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007503	GGAG	2	8	656933	656940	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007503	CTTT	2	8	689197	689204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007503	ACAA	2	8	694282	694289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007503	TTAA	2	8	714375	714382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007503	AGTG	2	8	714442	714449	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007503	GATT	2	8	719696	719703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007503	ATTT	2	8	720240	720247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007503	TATT	2	8	723655	723662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007503	GAAA	2	8	726254	726261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007503	GTAG	2	8	727474	727481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007503	GTAC	2	8	728409	728416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007503	AATT	2	8	732728	732735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007503	TTCT	2	8	733091	733098	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007503	TTTG	2	8	733206	733213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007503	GAAA	2	8	743392	743399	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007503	TTCC	2	8	744647	744654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007503	TCCT	2	8	746748	746755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007503	AGGG	2	8	747317	747324	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007503	GGGA	2	8	754081	754088	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007503	TTGT	2	8	755067	755074	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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