MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN chromosome

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007292	TATGTA	2	12	9207	9218	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007292	ATTTAT	2	12	10864	10875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007292	AGAAAA	2	12	29745	29756	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007292	TTTTTA	2	12	38896	38907	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007292	TAAGCA	2	12	49259	49270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007292	AATTTT	2	12	49718	49729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007292	TGTATT	2	12	56129	56140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007292	TTTATA	2	12	56164	56175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007292	ATTTTT	2	12	56293	56304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007292	TCAATT	2	12	58743	58754	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007292	TATTTT	2	12	62424	62435	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007292	TTAATT	2	12	67754	67765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007292	TTAATT	2	12	82867	82878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007292	TTAATT	2	12	84009	84020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007292	TTTTTA	2	12	84083	84094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007292	AAATAT	2	12	104115	104126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007292	TAAATA	2	12	106915	106926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007292	CCAATA	2	12	112611	112622	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007292	ATTTTT	2	12	117643	117654	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007292	TTTATT	2	12	136245	136256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007292	GTAACA	2	12	150556	150567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007292	ATAAAA	2	12	164036	164047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007292	ATTTAT	2	12	186626	186637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007292	TATGAT	2	12	189686	189697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007292	TTATAA	2	12	189699	189710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007292	TTTATA	2	12	192590	192601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007292	CATTAC	2	12	200518	200529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007292	ATTTTA	2	12	200717	200728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007292	TTAAAT	2	12	201112	201123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007292	TGACAT	6	36	201261	201296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007292	TTTATA	2	12	217886	217897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007292	TATTTC	2	12	219710	219721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007292	TGATTT	2	12	222093	222104	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007292	ATAGAT	2	12	233156	233167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007292	TAAATA	2	12	239382	239393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007292	TAATTA	2	12	241407	241418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007292	AAAATA	2	12	260691	260702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007292	CATATA	2	12	266389	266400	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007292	TAAACG	2	12	288156	288167	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007292	TTTAAT	2	12	291171	291182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007292	ATTACG	2	12	299528	299539	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007292	AACAAA	2	12	310866	310877	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007292	AAATTA	2	12	311040	311051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007292	TATAAT	2	12	311128	311139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007292	TATCTA	3	18	312979	312996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007292	TTATAA	2	12	313193	313204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007292	TATAAT	2	12	329727	329738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007292	AGTATA	2	12	355105	355116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007292	ATTTTT	2	12	357100	357111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007292	TATACA	2	12	358567	358578	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007292	AAAATA	2	12	359098	359109	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007292	ATTTTT	2	12	362382	362393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007292	TACAAA	2	12	362886	362897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007292	AATATC	2	12	367961	367972	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007292	TAAATT	2	12	368416	368427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007292	TTATTT	2	12	373960	373971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007292	AAAATA	2	12	389196	389207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007292	TATTTT	2	12	398515	398526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007292	AACACT	2	12	398917	398928	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007292	ATCTTA	2	12	407040	407051	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007292	ATTATA	2	12	414874	414885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007292	TAAATA	2	12	416788	416799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007292	AATTAA	2	12	419892	419903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007292	ACATAT	2	12	420605	420616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007292	AAGATA	2	12	423954	423965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007292	ATTAAA	2	12	426182	426193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007292	GTTTAT	2	12	428698	428709	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007292	AAATAT	2	12	451990	452001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007292	ACTCCA	2	12	454801	454812	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007292	TAAAAA	2	12	472105	472116	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007292	TAAAAA	2	12	477150	477161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007292	TATAAT	2	12	478198	478209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007292	TACATA	2	12	478942	478953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007292	AATCAT	2	12	482588	482599	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007292	ATTATG	2	12	491522	491533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007292	TCAAAT	2	12	504113	504124	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007292	TTTATA	2	12	504949	504960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007292	TCAAAT	2	12	507174	507185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007292	ATTTAA	2	12	516151	516162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007292	ATACTT	2	12	517595	517606	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007292	ATTTTT	2	12	517824	517835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007292	AATCTT	2	12	518020	518031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007292	TATTTA	2	12	526664	526675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007292	TAATTT	2	12	530926	530937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007292	AATTAA	2	12	531002	531013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007292	TAAAAA	2	12	532394	532405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007292	CATACC	2	12	533273	533284	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007292	TATGAA	2	12	538044	538055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007292	AATATT	2	12	538125	538136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007292	TTTTAC	2	12	546237	546248	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007292	TAGATA	2	12	551256	551267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007292	ATTTAA	2	12	553557	553568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007292	ATAAAA	2	12	558697	558708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007292	CAATAT	2	12	562983	562994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007292	ATACAA	2	12	564425	564436	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007292	TATTTA	2	12	567443	567454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007292	ATAAAA	2	12	578596	578607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007292	CATATA	2	12	578735	578746	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007292	AATTTT	2	12	581350	581361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007292	TACAGT	2	12	581465	581476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007292	AATAAA	2	12	581485	581496	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007292	TCAATA	2	12	586594	586605	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007292	ATATTT	2	12	597755	597766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007292	AAACAT	2	12	609899	609910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007292	TTAAAA	2	12	610023	610034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007292	TATTAA	2	12	610392	610403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007292	TAAAAT	2	12	617384	617395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007292	AATAAC	2	12	623655	623666	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007292	TTATTT	2	12	627626	627637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007292	ATTTTA	2	12	644425	644436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007292	GTTCTG	2	12	645223	645234	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007292	CTATAT	2	12	645317	645328	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007292	CTATTT	2	12	657781	657792	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007292	TAATTT	2	12	657937	657948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007292	AATGAA	2	12	664804	664815	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007292	TATAAA	2	12	669209	669220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007292	GAATAT	2	12	670615	670626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007292	GTTTTT	2	12	676935	676946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007292	TAAAAA	2	12	678350	678361	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007292	TTTTAA	2	12	684206	684217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007292	ATCATT	2	12	686254	686265	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007292	TTTAGA	2	12	697106	697117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007292	ATATGT	2	12	712679	712690	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007292	CTTAAT	2	12	717698	717709	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007292	ATATTT	2	12	720635	720646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007292	AAAATT	2	12	723568	723579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007292	TTTTTA	2	12	737187	737198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007292	AATTTT	2	12	737478	737489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007292	ATATTA	2	12	738697	738708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007292	ATACTT	2	12	743759	743770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_007292	TTATTT	2	12	744176	744187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007292	AAATAT	2	12	751643	751654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007292	AAAATT	2	12	755488	755499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007292	GTCAAT	2	12	756390	756401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_007292	AATATA	2	12	764316	764327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007292	TAAAAA	2	12	768784	768795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007292	AAATAT	2	12	773315	773326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007292	ATAGTA	2	12	775558	775569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007292	AATATT	2	12	777790	777801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007292	TATACA	2	12	791452	791463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.