MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN chromosome

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007292	ATTGA	2	10	16316	16325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007292	ATTAT	2	10	21120	21129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007292	ATAAA	2	10	21208	21217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007292	CTTAT	2	10	25187	25196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007292	ATTAT	2	10	30016	30025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007292	AAATT	2	10	32137	32146	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007292	AGTAT	2	10	34800	34809	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007292	ATTTC	2	10	34886	34895	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007292	GTTTT	2	10	37167	37176	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007292	AGATT	2	10	38730	38739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007292	CTATT	2	10	39484	39493	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007292	TTATT	2	10	40757	40766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007292	TTGTG	2	10	45848	45857	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007292	ACGAT	2	10	49239	49248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007292	TTTTA	2	10	49798	49807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007292	AATTT	2	10	50805	50814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007292	TATGT	2	10	51888	51897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007292	TAGTA	2	10	52224	52233	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007292	ATATT	2	10	54643	54652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007292	CATAT	2	10	54941	54950	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007292	AAATA	2	10	56151	56160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007292	TAAAA	2	10	56407	56416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007292	TTATA	2	10	60219	60228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007292	TATTT	2	10	60289	60298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007292	GTATA	2	10	60969	60978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007292	TATAT	2	10	62700	62709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007292	TGTTC	2	10	62785	62794	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007292	TTTAA	2	10	62858	62867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007292	GTATT	2	10	63090	63099	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007292	TATAA	2	10	64435	64444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007292	TAATT	2	10	66427	66436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007292	AATAA	2	10	66492	66501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007292	TAATA	2	10	67737	67746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007292	TTATT	2	10	72119	72128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007292	AATAT	2	10	73986	73995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007292	TAAGA	2	10	74408	74417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007292	AAAAT	2	10	76936	76945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007292	TAATT	2	10	77211	77220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007292	ATATT	2	10	82724	82733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007292	AATCA	2	10	83278	83287	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007292	AGATA	2	10	84443	84452	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007292	TTTAT	2	10	84582	84591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007292	GATTA	2	10	92470	92479	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007292	AATAA	2	10	93058	93067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007292	AAAAT	2	10	103149	103158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007292	ATGTT	2	10	106767	106776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007292	TAACA	2	10	113275	113284	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007292	TATAA	2	10	122752	122761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007292	ATTAA	2	10	123878	123887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007292	ATTTA	2	10	129804	129813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007292	TTTGA	2	10	135727	135736	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007292	ATTTT	2	10	135816	135825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007292	TGTAT	2	10	135964	135973	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007292	CATAT	2	10	141023	141032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007292	AATAT	2	10	149461	149470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007292	TTTTA	2	10	151698	151707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007292	TAAAT	2	10	151761	151770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007292	ATTTT	2	10	157989	157998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007292	TATAT	2	10	163737	163746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007292	ATATA	2	10	164103	164112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007292	TAATA	2	10	169146	169155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007292	TACAA	2	10	186451	186460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007292	ATGTG	2	10	190445	190454	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007292	ATTAA	2	10	190506	190515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007292	ATATA	2	10	190886	190895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007292	ATGTA	2	10	191609	191618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007292	ATTTT	2	10	192635	192644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007292	ATTTA	2	10	193237	193246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007292	CATTA	2	10	200293	200302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007292	TTTAA	2	10	200349	200358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007292	ATATT	2	10	200478	200487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007292	TTTTA	2	10	204059	204068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007292	ATATA	2	10	204131	204140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007292	GTATA	2	10	204785	204794	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007292	TAAAT	2	10	205101	205110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007292	AAATT	2	10	208593	208602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007292	ATATT	2	10	221306	221315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007292	TATTT	2	10	221454	221463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007292	ATTAT	2	10	221655	221664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007292	TAAAA	2	10	224853	224862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007292	TATTT	2	10	227065	227074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007292	TATAT	2	10	233087	233096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007292	TTAAT	2	10	233099	233108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007292	TAATA	2	10	240296	240305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007292	CTTAT	2	10	241355	241364	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007292	ATTTA	2	10	242092	242101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007292	ACAAT	2	10	242116	242125	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007292	GATAT	2	10	258448	258457	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007292	TTGAT	2	10	260262	260271	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007292	AGAAA	2	10	260650	260659	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007292	TAAAA	2	10	260865	260874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007292	ATTAC	2	10	264223	264232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007292	TTACT	2	10	264422	264431	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007292	TAAAA	2	10	265201	265210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007292	TCAAT	2	10	265635	265644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007292	CCGAA	2	10	273649	273658	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007292	ATAAA	2	10	277121	277130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007292	ATATT	2	10	280443	280452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007292	TTAAT	2	10	285466	285475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007292	TATGT	2	10	285639	285648	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007292	TAAAA	2	10	285693	285702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007292	TGAAA	2	10	286087	286096	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007292	AATAA	2	10	286577	286586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007292	ATTGC	2	10	286783	286792	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007292	ATACA	2	10	287388	287397	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007292	ATTAC	2	10	289588	289597	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007292	ATAAA	2	10	291730	291739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007292	ATTTT	2	10	293259	293268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007292	AATTA	2	10	295395	295404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007292	TTAAT	2	10	296586	296595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007292	ATCAA	2	10	296689	296698	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007292	TAAAC	2	10	296978	296987	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007292	TAGAT	2	10	299461	299470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007292	TACAA	2	10	301808	301817	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007292	TAAAT	2	10	302492	302501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007292	ATATA	2	10	306142	306151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007292	ATTTT	2	10	310815	310824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007292	TTGAG	2	10	311118	311127	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007292	TTTCA	2	10	313078	313087	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007292	TAAAT	2	10	313274	313283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007292	ACGAT	2	10	323729	323738	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007292	TAATT	2	10	328437	328446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007292	AATAT	2	10	348439	348448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007292	ACTAA	2	10	348521	348530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007292	TTTAT	2	10	349212	349221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007292	ACATT	2	10	351850	351859	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007292	ATTTT	2	10	352250	352259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007292	AAAAT	2	10	355157	355166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007292	AATAA	2	10	359557	359566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007292	TAAAA	2	10	363142	363151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007292	ATATT	2	10	363577	363586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007292	AATAA	2	10	363821	363830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007292	AAAAT	2	10	363850	363859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007292	TTAAA	2	10	366812	366821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007292	TAATT	2	10	367014	367023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007292	ATATT	2	10	368384	368393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007292	TATTC	2	10	368395	368404	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007292	TAGTA	2	10	372671	372680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007292	ATCAT	2	10	373906	373915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007292	TTGTA	2	10	392042	392051	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007292	ACATA	2	10	394664	394673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007292	AAATA	2	10	394840	394849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007292	GCTTT	2	10	398011	398020	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007292	CAATA	2	10	398039	398048	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007292	TAATA	2	10	398072	398081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007292	TAAAT	2	10	398098	398107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007292	ATAGT	2	10	398202	398211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007292	TTATT	2	10	398598	398607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007292	TCATT	2	10	399021	399030	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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295	NC_007292	TATAA	2	10	723879	723888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_007292	ATTTA	2	10	724868	724877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_007292	TCCAA	2	10	725661	725670	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
298	NC_007292	TCATT	2	10	725912	725921	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_007292	AAATT	2	10	728339	728348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_007292	ATATA	2	10	728964	728973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_007292	ATTTT	2	10	737135	737144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_007292	ACTAA	2	10	737543	737552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
303	NC_007292	GTATA	2	10	737579	737588	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
304	NC_007292	ACTAA	2	10	738376	738385	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
305	NC_007292	AAATA	2	10	738598	738607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_007292	TACAT	2	10	741385	741394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
307	NC_007292	AAATA	2	10	743916	743925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_007292	ATAAA	2	10	747702	747711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_007292	TAATT	2	10	747825	747834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_007292	GAAAA	2	10	748048	748057	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
311	NC_007292	AATAA	2	10	755889	755898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_007292	TTACG	2	10	756091	756100	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
313	NC_007292	TAAAT	2	10	756417	756426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_007292	TACAA	2	10	756677	756686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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317	NC_007292	AATTT	2	10	758751	758760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_007292	TTAAA	2	10	762331	762340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_007292	TTTTA	2	10	762619	762628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_007292	CTAAT	2	10	763981	763990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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323	NC_007292	TTATA	2	10	773588	773597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_007292	GTATA	2	10	773631	773640	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
325	NC_007292	ATTAT	2	10	773872	773881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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327	NC_007292	AAATA	2	10	777700	777709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_007292	ATTTT	2	10	785333	785342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
329	NC_007292	TACAC	2	10	786643	786652	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
330	NC_007292	AAATT	2	10	789272	789281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_007292	ATAAC	2	10	791187	791196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
332	NC_007292	GTAAA	2	10	791482	791491	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.