MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006958	ATCCA	2	10	3544	3553	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_006958	AGTTC	2	10	40024	40033	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_006958	TTAAT	2	10	58999	59008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006958	CGCCC	2	10	66422	66431	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5	NC_006958	TCGTG	2	10	77690	77699	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006958	CGTCA	2	10	78026	78035	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_006958	GGGAG	2	10	79131	79140	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006958	GCTTT	2	10	80113	80122	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_006958	GGAGT	2	10	87508	87517	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006958	AACCA	2	10	98545	98554	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006958	ATGAA	2	10	107203	107212	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006958	TGCGC	2	10	107272	107281	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_006958	ATTTC	2	10	136688	136697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_006958	GGTGG	2	10	144696	144705	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006958	AAGGA	2	10	148043	148052	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006958	TGGTT	2	10	167498	167507	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006958	TGGTC	2	10	167570	167579	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006958	TTTCT	2	10	178233	178242	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_006958	AGGGG	2	10	190641	190650	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006958	TGGGG	2	10	239681	239690	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006958	ATTTA	2	10	254058	254067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006958	GATTA	2	10	256350	256359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006958	TGTGG	2	10	268160	268169	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006958	CGGGG	2	10	273338	273347	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
25	NC_006958	ATGAA	2	10	291670	291679	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006958	CCAGC	2	10	297523	297532	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_006958	TGGTT	2	10	311393	311402	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006958	GGGTG	2	10	352414	352423	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006958	ACTCA	2	10	359664	359673	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_006958	GGTTG	2	10	360551	360560	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006958	CAACA	2	10	377365	377374	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_006958	TAATT	2	10	381712	381721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006958	ACAAA	2	10	404435	404444	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_006958	TGGGG	2	10	406379	406388	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006958	TACCC	2	10	415548	415557	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_006958	AGGTT	2	10	415588	415597	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006958	TGGTT	2	10	427958	427967	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006958	TGGTT	2	10	428312	428321	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006958	GTATC	2	10	438113	438122	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_006958	AAACC	2	10	447829	447838	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_006958	TGGGT	2	10	468920	468929	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006958	TGAAT	2	10	471057	471066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006958	AGGGG	2	10	471885	471894	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006958	GAAAA	2	10	479324	479333	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006958	CTTAA	2	10	479409	479418	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_006958	TGAGC	2	10	483037	483046	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_006958	GGGGT	2	10	511024	511033	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006958	CGTTG	2	10	512699	512708	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006958	CGTCA	2	10	522648	522657	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_006958	CAGGT	2	10	532969	532978	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_006958	AACCT	2	10	548089	548098	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_006958	GGGAA	2	10	555292	555301	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006958	TTTGA	2	10	558129	558138	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006958	AAGTG	2	10	578016	578025	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006958	AAAGC	2	10	584304	584313	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_006958	CTTTT	2	10	589167	589176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_006958	CAAGA	2	10	589209	589218	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_006958	TTCTT	2	10	609706	609715	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006958	GGTGT	2	10	625015	625024	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006958	TTTCG	2	10	629030	629039	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_006958	CTTTT	2	10	646243	646252	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_006958	GTCTA	2	10	667839	667848	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_006958	AACCA	2	10	672225	672234	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_006958	GTGTG	2	10	672568	672577	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006958	GCTGC	2	10	676485	676494	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_006958	TTAGG	2	10	686439	686448	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006958	TCAGA	2	10	689551	689560	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_006958	GACTC	2	10	703485	703494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_006958	CAGAC	2	10	727270	727279	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_006958	TTCGT	2	10	837469	837478	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_006958	GGAAT	2	10	840374	840383	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006958	CCACC	2	10	842923	842932	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_006958	GGTGG	2	10	849116	849125	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006958	TGTGC	2	10	852539	852548	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_006958	TAACC	2	10	852744	852753	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_006958	TTAGG	2	10	853896	853905	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006958	TCGTG	2	10	858636	858645	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_006958	CGTCA	2	10	858972	858981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_006958	GGGAG	2	10	860079	860088	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006958	GCTTT	2	10	861061	861070	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_006958	CCACC	2	10	912669	912678	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
82	NC_006958	TTCGA	2	10	943489	943498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_006958	AAACC	2	10	943776	943785	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_006958	CAGGT	2	10	946384	946393	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_006958	CATGC	2	10	963916	963925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_006958	CTGTG	2	10	963944	963953	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_006958	AGGTC	2	10	963960	963969	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_006958	TCAGT	2	10	964238	964247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_006958	CAACC	2	10	984039	984048	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_006958	TTTGA	2	10	984095	984104	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006958	TCACA	2	10	1008404	1008413	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_006958	AAGGA	2	10	1015467	1015476	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006958	GAAAT	2	10	1034626	1034635	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006958	CCAAA	2	10	1044433	1044442	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_006958	GGCGA	2	10	1046336	1046345	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_006958	ATTTT	2	10	1047905	1047914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006958	CCCAT	2	10	1048045	1048054	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_006958	GGGCT	2	10	1111214	1111223	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_006958	CAAAA	2	10	1135999	1136008	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_006958	TCCTT	2	10	1138309	1138318	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_006958	TTGTT	2	10	1145399	1145408	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006958	GCCGA	2	10	1183301	1183310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_006958	CCGGG	2	10	1221214	1221223	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_006958	TTTTG	2	10	1243895	1243904	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006958	TGTTT	2	10	1247128	1247137	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006958	GAACT	2	10	1304640	1304649	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_006958	TGATC	2	10	1316299	1316308	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_006958	GTGTT	2	10	1327836	1327845	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006958	GGCTT	2	10	1339543	1339552	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_006958	GAGTG	2	10	1384032	1384041	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006958	TTCGC	2	10	1388831	1388840	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_006958	GTTTT	2	10	1399079	1399088	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006958	CAGAC	2	10	1401270	1401279	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_006958	GATTT	2	10	1401462	1401471	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006958	CCCAT	2	10	1405903	1405912	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_006958	TTTTG	2	10	1409473	1409482	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006958	GAATC	2	10	1424575	1424584	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_006958	CCAAA	2	10	1438251	1438260	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_006958	CAAGA	2	10	1450085	1450094	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_006958	CAATT	2	10	1452304	1452313	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_006958	TGCTG	2	10	1462140	1462149	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_006958	TCGTG	2	10	1481877	1481886	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_006958	CGTCA	2	10	1482213	1482222	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_006958	GGGAG	2	10	1483320	1483329	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006958	GCTTT	2	10	1484301	1484310	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_006958	AACAG	2	10	1485863	1485872	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_006958	GTGTG	2	10	1485929	1485938	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006958	ATTTC	2	10	1486110	1486119	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_006958	TTAGG	2	10	1530895	1530904	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006958	GGGAG	2	10	1549284	1549293	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006958	TAAAC	2	10	1551902	1551911	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_006958	TCGGT	2	10	1565460	1565469	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_006958	GTCAG	2	10	1604084	1604093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_006958	GCACT	2	10	1622497	1622506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_006958	GTGTC	2	10	1633093	1633102	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_006958	AAAGT	2	10	1638535	1638544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006958	CCTGA	2	10	1640806	1640815	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_006958	AAATC	2	10	1641032	1641041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_006958	ATTCC	2	10	1655102	1655111	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_006958	GACCA	2	10	1662611	1662620	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_006958	TGGTT	2	10	1662666	1662675	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006958	CGTTC	2	10	1665522	1665531	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_006958	TTTTC	2	10	1665583	1665592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_006958	TGTTT	2	10	1682622	1682631	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006958	ATTCA	2	10	1710427	1710436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_006958	AGACC	2	10	1716538	1716547	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_006958	ACCGG	2	10	1716689	1716698	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_006958	CGTTC	2	10	1778108	1778117	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_006958	CCCAC	2	10	1778422	1778431	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
150	NC_006958	AACTA	2	10	1787081	1787090	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_006958	TAACA	2	10	1790367	1790376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_006958	TCAGC	2	10	1791856	1791865	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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154	NC_006958	GACAC	2	10	1810832	1810841	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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156	NC_006958	GACAA	2	10	1819775	1819784	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_006958	AAGTG	2	10	1826220	1826229	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_006958	ATTGA	2	10	1829307	1829316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_006958	AATTG	2	10	1829436	1829445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_006958	CAATT	2	10	1829928	1829937	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_006958	TCGCT	2	10	1830923	1830932	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_006958	GTCAT	2	10	1837217	1837226	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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166	NC_006958	GTCAT	2	10	1848533	1848542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_006958	TAATT	2	10	1848765	1848774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_006958	AGAAA	2	10	1848777	1848786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_006958	TTCTC	2	10	1856489	1856498	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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173	NC_006958	TGAGA	2	10	1893262	1893271	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_006958	TTCAG	2	10	1937664	1937673	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_006958	ATTCC	2	10	1948524	1948533	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
179	NC_006958	ACGTT	2	10	1957138	1957147	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
180	NC_006958	CAGCA	2	10	1957477	1957486	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_006958	ACAAA	2	10	1975437	1975446	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_006958	GTTTA	2	10	2097321	2097330	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_006958	AACCA	2	10	2097362	2097371	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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197	NC_006958	AGCAA	2	10	2191935	2191944	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
198	NC_006958	GTCTG	2	10	2199107	2199116	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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234	NC_006958	GGGGT	2	10	2621170	2621179	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_006958	TGACG	2	10	2688094	2688103	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
250	NC_006958	CACGA	2	10	2688430	2688439	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
251	NC_006958	GGTCG	2	10	2694590	2694599	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_006958	TTAAT	2	10	2704193	2704202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_006958	TGAAA	2	10	2763891	2763900	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_006958	GAATA	2	10	2971738	2971747	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_006958	ATGAG	2	10	2992607	2992616	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
280	NC_006958	GAGGG	2	10	2995386	2995395	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
281	NC_006958	GGGTT	2	10	2997237	2997246	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
282	NC_006958	TTCAG	2	10	3000809	3000818	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
283	NC_006958	GAAAT	2	10	3003381	3003390	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_006958	TGAAG	2	10	3015259	3015268	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
285	NC_006958	CGAGA	2	10	3015750	3015759	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
286	NC_006958	TTTTC	2	10	3081136	3081145	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_006958	CCCAC	2	10	3094339	3094348	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
288	NC_006958	GCTCC	2	10	3115320	3115329	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
289	NC_006958	ATTGT	2	10	3115357	3115366	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_006958	CTCCC	2	10	3122010	3122019	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
291	NC_006958	TGACG	2	10	3123117	3123126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
292	NC_006958	CACGA	2	10	3123453	3123462	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
293	NC_006958	ATATC	2	10	3128456	3128465	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_006958	TCCTC	2	10	3145852	3145861	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
295	NC_006958	TCATC	2	10	3152196	3152205	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
296	NC_006958	AGAAA	2	10	3157277	3157286	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_006958	GGGTG	2	10	3188485	3188494	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
298	NC_006958	CAGAC	2	10	3204087	3204096	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
299	NC_006958	ATTTC	2	10	3220336	3220345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_006958	CAAGC	2	10	3222898	3222907	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
301	NC_006958	GCTGC	2	10	3224973	3224982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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303	NC_006958	TTCGC	2	10	3229671	3229680	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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305	NC_006958	CGAGT	2	10	3265577	3265586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
306	NC_006958	ACGAT	2	10	3265823	3265832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
307	NC_006958	AAACC	2	10	3274648	3274657	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.