MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 1975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	TTAA	2	8	45	52	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005861	TGAT	2	8	1037	1044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005861	AATT	2	8	4079	4086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005861	TTTG	2	8	4091	4098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005861	ATGA	2	8	8364	8371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005861	AATT	2	8	8578	8585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005861	CTTT	2	8	9346	9353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_005861	TTAA	2	8	11198	11205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005861	ATGG	2	8	11425	11432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005861	ATTT	2	8	11483	11490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005861	TAAA	2	8	20787	20794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005861	ATTT	2	8	20797	20804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005861	TAAA	2	8	20951	20958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005861	TGAA	2	8	23718	23725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005861	TAAT	3	12	23750	23761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005861	TCTA	2	8	26618	26625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_005861	AATA	2	8	28227	28234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005861	ACTG	2	8	28275	28282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_005861	CTTA	2	8	29612	29619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_005861	AAAT	2	8	29633	29640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005861	TTTA	2	8	29748	29755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005861	ATTT	2	8	29773	29780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005861	CAAA	2	8	29889	29896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_005861	TCTT	2	8	37421	37428	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_005861	CATT	2	8	37523	37530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_005861	TAAT	2	8	42085	42092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005861	AATT	2	8	42164	42171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005861	AATA	2	8	42278	42285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005861	CTTT	2	8	43180	43187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_005861	AATA	2	8	43201	43208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005861	ATAA	2	8	43380	43387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005861	TAAA	2	8	43478	43485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005861	TTAT	2	8	44085	44092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005861	CTTT	2	8	44582	44589	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_005861	ATCC	2	8	44637	44644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_005861	GTTG	2	8	48173	48180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005861	TAAT	2	8	55652	55659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005861	TTTA	2	8	57210	57217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005861	TCCA	2	8	60099	60106	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005861	AATT	2	8	60174	60181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005861	ATAA	2	8	60521	60528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005861	TAAA	2	8	60639	60646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005861	CGCA	2	8	60687	60694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005861	AATT	2	8	61620	61627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005861	AAAC	2	8	68800	68807	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_005861	TAAC	2	8	68814	68821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_005861	ATAA	2	8	72321	72328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005861	TAGA	2	8	72388	72395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005861	TTAG	2	8	72456	72463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005861	TAAA	2	8	81098	81105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005861	AATT	2	8	81141	81148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005861	TAAT	2	8	81160	81167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005861	ATTT	2	8	81216	81223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005861	AAAT	2	8	81254	81261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005861	AAAT	2	8	81288	81295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005861	ATTA	2	8	81339	81346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005861	AAAT	2	8	84669	84676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005861	ATCA	2	8	84786	84793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_005861	ATTT	2	8	84972	84979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005861	CGAT	2	8	84992	84999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_005861	GAAA	2	8	87187	87194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005861	TAGT	2	8	87345	87352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005861	ACTA	2	8	87745	87752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_005861	AAAT	2	8	87858	87865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005861	TAAC	2	8	87914	87921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_005861	CTTA	2	8	89023	89030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_005861	AAAG	2	8	89242	89249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005861	AATG	2	8	89482	89489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005861	TAAC	2	8	89609	89616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_005861	TGTA	2	8	91371	91378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005861	TAAC	2	8	95132	95139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_005861	TAAA	2	8	102030	102037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005861	ATAA	2	8	102176	102183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005861	ATAA	2	8	107414	107421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005861	ATTA	2	8	107433	107440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005861	ATAA	2	8	110512	110519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005861	TAAA	2	8	114005	114012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005861	TGAA	2	8	114477	114484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005861	TAAT	2	8	114548	114555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005861	TGGT	2	8	114659	114666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005861	AAAT	2	8	116099	116106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005861	CTTT	2	8	116135	116142	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_005861	ATTG	2	8	116162	116169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005861	AATT	2	8	116531	116538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005861	ATGA	2	8	117687	117694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005861	TTTC	2	8	118732	118739	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_005861	AGAA	2	8	118857	118864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005861	CTGT	2	8	119146	119153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_005861	GTAA	2	8	119230	119237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005861	GTTT	2	8	120267	120274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005861	GTTG	2	8	120485	120492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005861	TTGA	2	8	120684	120691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005861	TATT	2	8	120800	120807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005861	TTGA	2	8	120886	120893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005861	TTCT	2	8	132358	132365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_005861	ATTT	2	8	133474	133481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005861	TAAA	2	8	135144	135151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005861	CATG	2	8	135296	135303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_005861	AGGT	2	8	140300	140307	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005861	CAAT	2	8	147436	147443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_005861	TTTA	2	8	149800	149807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005861	TTAT	2	8	149836	149843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005861	TCAC	2	8	149844	149851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_005861	CAAA	2	8	151115	151122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_005861	CTAT	2	8	151423	151430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_005861	TATC	2	8	152273	152280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_005861	ATTT	2	8	155731	155738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005861	ATAA	2	8	155761	155768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005861	GCTT	2	8	157118	157125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_005861	AATT	2	8	157140	157147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005861	TAAG	2	8	161335	161342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005861	AGTT	2	8	163406	163413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005861	TTTA	2	8	174574	174581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005861	ATTT	2	8	174651	174658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005861	TGAT	2	8	174681	174688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005861	AGTG	2	8	177411	177418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005861	AGAT	2	8	178381	178388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005861	AAAT	2	8	178537	178544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005861	ATGA	2	8	178545	178552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005861	TCTT	2	8	178665	178672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_005861	ATTT	2	8	180868	180875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005861	ATTA	2	8	182100	182107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005861	AAAT	2	8	183489	183496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005861	GCTT	2	8	188008	188015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_005861	CTTT	2	8	189458	189465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_005861	TGTT	2	8	190120	190127	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005861	AATT	2	8	192974	192981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005861	CAAT	2	8	193111	193118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_005861	AACA	2	8	193192	193199	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_005861	AAAG	2	8	202281	202288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005861	TTTA	2	8	205300	205307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005861	TCGA	2	8	208973	208980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_005861	TTCA	2	8	210758	210765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_005861	TATT	2	8	211037	211044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005861	AGCT	2	8	212309	212316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_005861	GCCT	2	8	214390	214397	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_005861	AATG	2	8	214574	214581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005861	ATTT	2	8	214592	214599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005861	AAAG	2	8	216774	216781	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005861	GAAA	2	8	220446	220453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005861	GTTT	2	8	220710	220717	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005861	AATA	2	8	223987	223994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005861	ATTG	2	8	225003	225010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005861	TGAG	2	8	226288	226295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005861	ATTA	2	8	227038	227045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005861	TAAA	2	8	227080	227087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005861	CTTT	2	8	227225	227232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_005861	ATTT	2	8	227341	227348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005861	TGCT	2	8	231101	231108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_005861	CTAA	2	8	231352	231359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_005861	TAAA	2	8	232677	232684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005861	AAAC	2	8	232781	232788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_005861	TAAA	2	8	232799	232806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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