MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 11464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005861	TAA	3	9	273902	273910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_005861	TGT	2	6	275494	275499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_005861	TGA	2	6	276912	276917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_005861	CCA	2	6	276930	276935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_005861	TTA	2	6	276967	276972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_005861	AAT	2	6	277009	277014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_005861	TAA	2	6	277022	277027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_005861	A	6	6	277039	277044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_005861	AAGA	2	8	277104	277111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_005861	TA	3	6	278229	278234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_005861	ATC	2	6	282178	282183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_005861	TAA	2	6	282185	282190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_005861	ATAA	2	8	282208	282215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_005861	ATTTT	2	10	282221	282230	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_005861	TAA	2	6	282301	282306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_005861	TAA	2	6	282362	282367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_005861	ATAA	3	12	282364	282375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_005861	TTA	2	6	283861	283866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_005861	AG	3	6	283896	283901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_005861	ATTAG	2	10	283919	283928	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_005861	GAAT	2	8	283929	283936	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_005861	CTT	2	6	288198	288203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_005861	A	6	6	288277	288282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_005861	TCT	2	6	288290	288295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_005861	TAA	2	6	288331	288336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_005861	A	7	7	288351	288357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_005861	TAA	2	6	288451	288456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_005861	T	7	7	288478	288484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_005861	TAG	2	6	288525	288530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_005861	A	7	7	288543	288549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_005861	A	6	6	289760	289765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_005861	A	7	7	289785	289791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_005861	T	6	6	289795	289800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_005861	AAT	2	6	289843	289848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_005861	TAA	2	6	289861	289866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_005861	TATC	2	8	289867	289874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_005861	ATC	2	6	289932	289937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_005861	AAT	2	6	289943	289948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_005861	T	6	6	289979	289984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_005861	GATA	2	8	290027	290034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_005861	TAAC	2	8	290044	290051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1045	NC_005861	TTA	2	6	290076	290081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_005861	TTA	2	6	290169	290174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_005861	TA	3	6	290191	290196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_005861	A	8	8	290261	290268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1054	NC_005861	CAAC	2	8	290355	290362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_005861	ATT	2	6	291212	291217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_005861	ACT	3	9	291305	291313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1061	NC_005861	T	7	7	291339	291345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_005861	T	6	6	292373	292378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_005861	ATAATT	2	12	292379	292390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_005861	T	7	7	292490	292496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_005861	AAG	2	6	292497	292502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_005861	T	7	7	292846	292852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_005861	ACTA	2	8	292864	292871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_005861	AAT	2	6	292892	292897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_005861	T	6	6	292897	292902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_005861	AGTTAT	2	12	292987	292998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1080	NC_005861	A	7	7	295314	295320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_005861	A	6	6	295335	295340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_005861	TAA	2	6	304285	304290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_005861	TA	3	6	304716	304721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_005861	A	6	6	304728	304733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_005861	TAT	2	6	304780	304785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1119	NC_005861	A	7	7	304824	304830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_005861	TAA	2	6	304831	304836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_005861	AAT	2	6	304850	304855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_005861	TAA	2	6	306652	306657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_005861	CTT	2	6	306667	306672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_005861	CCT	2	6	306953	306958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_005861	T	7	7	307051	307057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_005861	TTA	2	6	307177	307182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_005861	TCT	2	6	307266	307271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_005861	TGA	2	6	307326	307331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1132	NC_005861	GAT	2	6	307399	307404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_005861	TGTTT	2	10	307422	307431	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_005861	TAT	2	6	307531	307536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_005861	A	6	6	307583	307588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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