MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005043	TCTTAT	2	12	4070	4081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_005043	TCGATT	2	12	24248	24259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_005043	ATTTTT	2	12	43333	43344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005043	AGGCTT	2	12	86810	86821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_005043	AATTAA	2	12	91188	91199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005043	TGTAGG	2	12	134724	134735	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005043	TTCTAT	2	12	135416	135427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_005043	AATTTT	2	12	199455	199466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005043	CTATTT	2	12	205740	205751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_005043	TCCCCC	2	12	242377	242388	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_005043	AAACAA	2	12	248699	248710	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_005043	ATTTTA	2	12	271649	271660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005043	AAATTT	2	12	275477	275488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005043	AGTAAT	2	12	327276	327287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005043	AAAACT	2	12	330470	330481	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_005043	AAAGAG	2	12	331333	331344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005043	ATCTTC	2	12	353899	353910	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005043	TAAAAA	2	12	363281	363292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005043	TTATTT	2	12	372447	372458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005043	ACAAAA	2	12	376512	376523	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_005043	ATTTTT	2	12	423718	423729	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005043	TTTCCC	2	12	429315	429326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_005043	TAGAGA	2	12	465711	465722	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005043	AAATAA	2	12	486040	486051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005043	AGAAAT	2	12	565370	565381	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005043	GAAAAA	2	12	601230	601241	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005043	TATTTT	2	12	603571	603582	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005043	TAGGAG	2	12	604791	604802	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005043	CATTAA	2	12	635604	635615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_005043	TTTTTA	2	12	652979	652990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005043	AAAAAC	2	12	659588	659599	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_005043	AATTAT	2	12	676744	676755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005043	TAGAAA	2	12	727856	727867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005043	GCCTAA	2	12	741578	741589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_005043	TATTTT	2	12	758653	758664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005043	GAATGC	2	12	765723	765734	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_005043	TAAAAA	2	12	797143	797154	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005043	ATTAAC	2	12	810717	810728	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_005043	TAAATT	2	12	919281	919292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005043	TATTTA	2	12	935556	935567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005043	TCATGA	2	12	938846	938857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_005043	TTTTTA	2	12	952021	952032	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005043	TTATTT	2	12	952543	952554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005043	TAAGCA	2	12	978868	978879	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_005043	TTTAAA	2	12	990468	990479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005043	AAGCGA	2	12	1000341	1000352	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_005043	GTTATT	2	12	1008713	1008724	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005043	AAAAGA	2	12	1057202	1057213	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005043	TAATTT	2	12	1060176	1060187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005043	TTTTTA	2	12	1075303	1075314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005043	ATTTCT	2	12	1086791	1086802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_005043	GAATAG	2	12	1105836	1105847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005043	TTTCAA	2	12	1110370	1110381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_005043	TACAAG	2	12	1114144	1114155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_005043	TTATAA	2	12	1115703	1115714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005043	TTTGGA	2	12	1174670	1174681	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005043	ACTTTT	2	12	1207178	1207189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_005043	TCCTAG	2	12	1219011	1219022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.