MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 2850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005043	TCT	2	6	218609	218614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_005043	CTA	2	6	219915	219920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_005043	ACT	2	6	219986	219991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_005043	ATA	2	6	219995	220000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_005043	AT	3	6	220009	220014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_005043	TTA	2	6	220038	220043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_005043	TTCTT	2	10	220048	220057	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
508	NC_005043	AT	3	6	220137	220142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_005043	CCT	2	6	220154	220159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_005043	TCA	2	6	220166	220171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_005043	GAT	2	6	220194	220199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_005043	AT	3	6	220203	220208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_005043	ACA	2	6	220262	220267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_005043	T	9	9	221544	221552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_005043	ACTC	2	8	221560	221567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_005043	CAA	2	6	221582	221587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_005043	ATT	2	6	222463	222468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_005043	T	6	6	222477	222482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_005043	AATA	2	8	222488	222495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_005043	A	6	6	222495	222500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_005043	TAAT	2	8	227265	227272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_005043	ATTAA	2	10	227298	227307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_005043	TTA	2	6	227308	227313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_005043	GCT	2	6	228697	228702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_005043	AGC	2	6	228705	228710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_005043	ATTT	2	8	230059	230066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_005043	TTTTC	2	10	230597	230606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
528	NC_005043	T	6	6	230611	230616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_005043	TC	4	8	233286	233293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_005043	AAAG	2	8	233331	233338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_005043	TTA	2	6	234965	234970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_005043	AAG	2	6	236297	236302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_005043	T	8	8	236317	236324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_005043	TTC	2	6	236338	236343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_005043	AAG	2	6	236368	236373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_005043	TCT	2	6	236376	236381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_005043	TA	3	6	236383	236388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_005043	GAA	2	6	236400	236405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_005043	AGTA	2	8	236408	236415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_005043	CCT	2	6	236435	236440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_005043	AAT	2	6	236467	236472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_005043	CCA	2	6	236495	236500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_005043	TA	3	6	236564	236569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_005043	TTTAA	2	10	238215	238224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_005043	ACT	2	6	238269	238274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_005043	A	7	7	238299	238305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_005043	CTTC	2	8	238332	238339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_005043	T	6	6	238348	238353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_005043	TC	3	6	238443	238448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_005043	A	7	7	239404	239410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_005043	TC	3	6	241960	241965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_005043	ATG	2	6	241988	241993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_005043	A	7	7	241998	242004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_005043	CAA	2	6	242235	242240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_005043	TCCCCC	2	12	242377	242388	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
556	NC_005043	A	7	7	242389	242395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_005043	AAG	2	6	243423	243428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_005043	A	7	7	243455	243461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_005043	AGA	2	6	243482	243487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_005043	AGA	2	6	243762	243767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_005043	ATCA	2	8	244577	244584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_005043	TA	3	6	246041	246046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_005043	ACC	2	6	246102	246107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_005043	CT	3	6	246132	246137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_005043	GAA	2	6	246155	246160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_005043	TTG	2	6	246180	246185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_005043	TTC	2	6	246188	246193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_005043	A	7	7	246265	246271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_005043	GAT	2	6	246319	246324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_005043	CATGC	2	10	248158	248167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
571	NC_005043	AG	3	6	248235	248240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_005043	T	6	6	248306	248311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_005043	TTA	2	6	248330	248335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_005043	AG	3	6	248391	248396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_005043	ATT	2	6	248403	248408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_005043	AAC	2	6	248425	248430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_005043	AAACAA	2	12	248699	248710	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
578	NC_005043	GAA	2	6	248717	248722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_005043	CAAC	2	8	248737	248744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_005043	TA	3	6	248753	248758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_005043	CTT	2	6	248773	248778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_005043	TAA	2	6	248795	248800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_005043	TAG	2	6	249800	249805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_005043	TC	3	6	249815	249820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_005043	CT	3	6	249837	249842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_005043	CAA	2	6	250174	250179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_005043	TCT	2	6	250202	250207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_005043	ATTTT	2	10	250215	250224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_005043	A	6	6	250270	250275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_005043	ATTT	2	8	250282	250289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_005043	AG	3	6	251491	251496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_005043	AAT	2	6	251506	251511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_005043	AGGA	2	8	251682	251689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_005043	A	6	6	251729	251734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_005043	AG	3	6	251789	251794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_005043	TCA	2	6	251805	251810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_005043	CT	3	6	251824	251829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_005043	TAG	2	6	251839	251844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_005043	AGG	2	6	253129	253134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_005043	ACT	2	6	254453	254458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_005043	ATGA	2	8	254477	254484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_005043	CAA	2	6	254498	254503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_005043	TAA	2	6	254523	254528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_005043	AAAT	2	8	254555	254562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_005043	GTGC	2	8	255024	255031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_005043	ATT	2	6	255067	255072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_005043	ATA	2	6	255093	255098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_005043	TTTGA	2	10	255103	255112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
609	NC_005043	GCAC	2	8	255153	255160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
610	NC_005043	CAT	2	6	255225	255230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_005043	TGC	2	6	255301	255306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_005043	TACC	2	8	256573	256580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_005043	AAAC	2	8	256677	256684	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_005043	A	6	6	257916	257921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_005043	ATTT	2	8	257935	257942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_005043	A	7	7	257945	257951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_005043	TTTA	2	8	257966	257973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_005043	CT	3	6	257986	257991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_005043	A	8	8	258005	258012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_005043	A	6	6	258025	258030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_005043	TAAT	2	8	258031	258038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_005043	T	6	6	258082	258087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_005043	A	9	9	258088	258096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_005043	T	6	6	258102	258107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_005043	AGC	2	6	258755	258760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_005043	A	6	6	258768	258773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_005043	TAG	2	6	258791	258796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_005043	TAT	3	9	258801	258809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_005043	TAA	2	6	258823	258828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_005043	TCCC	2	8	258859	258866	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
631	NC_005043	GAA	2	6	258910	258915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_005043	TAAA	2	8	258919	258926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_005043	TA	3	6	258999	259004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_005043	ATTTT	2	10	259008	259017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_005043	ATTAG	2	10	259025	259034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
636	NC_005043	A	6	6	259505	259510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_005043	TTC	2	6	259576	259581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_005043	T	7	7	260268	260274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_005043	TTA	2	6	260324	260329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_005043	A	8	8	260834	260841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_005043	A	6	6	263566	263571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_005043	CTAAG	2	10	266542	266551	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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